27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2878 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2878  hypothetical protein  100 
 
 		 296 aa  601  1.0000000000000001e-171  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.484673 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0584  hypothetical protein  59.11 
 
 		 292 aa  307  2.0000000000000002e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1015  hypothetical protein  28.21 
 
 		 267 aa  67.4  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4142  TPR repeat-containing protein  27.92 
 
 		 208 aa  67  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3946  TPR repeat-containing protein  28 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2080  hypothetical protein  35.43 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2665  hypothetical protein  27.04 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0845681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1528  TPR repeat-containing protein  28.75 
 
 		 275 aa  56.6  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336716  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2712  hypothetical protein  28.57 
 
 		 213 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.160555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0950  TPR repeat-containing protein  26.62 
 
 		 215 aa  54.7  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.265468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03397  TPR repeats containing protein  27.12 
 
 		 215 aa  53.9  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3040  hypothetical protein  27.92 
 
 		 213 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.338752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3310  hypothetical protein  27.22 
 
 		 213 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.628665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3089  hypothetical protein  34.38 
 
 		 249 aa  52.4  0.000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.655576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3020  hypothetical protein  31.09 
 
 		 213 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.621257  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2031  TPR repeat-containing protein  31.2 
 
 		 206 aa  51.2  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003616  hypothetical protein  26.06 
 
 		 211 aa  50.4  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1523  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.91 
 
 		 245 aa  49.7  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.52918  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03396  TPR repeats containing protein  28.36 
 
 		 233 aa  49.3  0.00008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2557  hypothetical protein  28.77 
 
 		 227 aa  48.1  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1618  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.33 
 
 		 245 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.127216  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0648  hypothetical protein  25.15 
 
 		 224 aa  47  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2346  TPR repeat-containing protein  27.06 
 
 		 244 aa  46.6  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3832  TPR repeat-containing protein  24.67 
 
 		 211 aa  45.8  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.972183  normal  0.172551 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0580  tetratricopeptide domain-containing protein  26.79 
 
 		 231 aa  45.1  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.367595  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0293  hypothetical protein  28.17 
 
 		 206 aa  44.3  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.545966  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2843  hypothetical protein  27.12 
 
 		 256 aa  42.4  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>