27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2843 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2843  hypothetical protein  100 
 
 		 256 aa  523  1e-147  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3832  TPR repeat-containing protein  50.81 
 
 		 211 aa  186  3e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.972183  normal  0.172551 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03397  TPR repeats containing protein  47.59 
 
 		 215 aa  183  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03396  TPR repeats containing protein  46.67 
 
 		 233 aa  177  1e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003616  hypothetical protein  43.89 
 
 		 211 aa  152  5.9999999999999996e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3310  hypothetical protein  43.08 
 
 		 213 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.628665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3020  hypothetical protein  42.56 
 
 		 213 aa  148  8e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.621257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0648  hypothetical protein  42.25 
 
 		 224 aa  145  9e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2665  hypothetical protein  40.82 
 
 		 209 aa  142  4e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0845681  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4142  TPR repeat-containing protein  37.63 
 
 		 208 aa  137  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3040  hypothetical protein  41.54 
 
 		 213 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.338752  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2712  hypothetical protein  41.54 
 
 		 213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.160555  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3946  TPR repeat-containing protein  35.92 
 
 		 211 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2031  TPR repeat-containing protein  38.31 
 
 		 206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0293  hypothetical protein  42.94 
 
 		 206 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.545966  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0950  TPR repeat-containing protein  35.98 
 
 		 215 aa  124  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.265468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1283  TPR repeat-containing protein  34.03 
 
 		 230 aa  124  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.873901 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1939  hypothetical protein  45.36 
 
 		 238 aa  117  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2596  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 		 209 aa  116  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.230663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2433  hypothetical protein  38.42 
 
 		 219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.28641  normal  0.541906 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3353  hypothetical protein  42.63 
 
 		 214 aa  113  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.782786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2600  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 223 aa  108  6e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.167475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2557  hypothetical protein  36.24 
 
 		 227 aa  103  4e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0138  hypothetical protein  51.65 
 
 		 93 aa  99.4  5e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.299058  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02327  TPR repeat-containing protein  40.52 
 
 		 170 aa  79.3  0.00000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0734856  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1015  hypothetical protein  37.21 
 
 		 267 aa  53.5  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2878  hypothetical protein  27.12 
 
 		 296 aa  42.4  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.484673 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>