29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0138 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0138  hypothetical protein  100 
 
 		 93 aa  192  1e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.299058  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2031  TPR repeat-containing protein  67.39 
 
 		 206 aa  135  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003616  hypothetical protein  63.04 
 
 		 211 aa  126  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3946  TPR repeat-containing protein  60.87 
 
 		 211 aa  120  8e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1939  hypothetical protein  62.64 
 
 		 238 aa  118  3e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2665  hypothetical protein  59.55 
 
 		 209 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0845681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0950  TPR repeat-containing protein  57.14 
 
 		 215 aa  114  5e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.265468  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2712  hypothetical protein  55.43 
 
 		 213 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.160555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3040  hypothetical protein  55.43 
 
 		 213 aa  110  5e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.338752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4142  TPR repeat-containing protein  55.43 
 
 		 208 aa  110  6e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03396  TPR repeats containing protein  56.04 
 
 		 233 aa  110  7.000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3020  hypothetical protein  56.52 
 
 		 213 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.621257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0648  hypothetical protein  52.17 
 
 		 224 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03397  TPR repeats containing protein  52.27 
 
 		 215 aa  104  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3310  hypothetical protein  53.26 
 
 		 213 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.628665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3832  TPR repeat-containing protein  51.09 
 
 		 211 aa  103  9e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.972183  normal  0.172551 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2843  hypothetical protein  51.65 
 
 		 256 aa  99.4  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2433  hypothetical protein  54.32 
 
 		 219 aa  98.6  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.28641  normal  0.541906 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3353  hypothetical protein  61.54 
 
 		 214 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.782786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2596  TPR repeat-containing protein  50 
 
 		 209 aa  96.7  9e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.230663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0293  hypothetical protein  53.85 
 
 		 206 aa  96.7  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.545966  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02327  TPR repeat-containing protein  51.09 
 
 		 170 aa  94.7  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0734856  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1283  TPR repeat-containing protein  52.17 
 
 		 230 aa  92.8  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.873901 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2557  hypothetical protein  43.96 
 
 		 227 aa  79.7  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2600  TPR repeat-containing protein  43.48 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.167475  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1015  hypothetical protein  38.6 
 
 		 267 aa  44.7  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1452  hypothetical protein  33.8 
 
 		 243 aa  44.3  0.0006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1528  TPR repeat-containing protein  35.63 
 
 		 275 aa  43.5  0.0009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1166  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  37.7 
 
 		 261 aa  42  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.327307 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>