34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03396 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03396  TPR repeats containing protein  100 
 
 		 233 aa  474  1e-133  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3832  TPR repeat-containing protein  58.2 
 
 		 211 aa  222  4.9999999999999996e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.972183  normal  0.172551 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03397  TPR repeats containing protein  54.21 
 
 		 215 aa  214  8e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3310  hypothetical protein  52.6 
 
 		 213 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.628665  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2031  TPR repeat-containing protein  49.74 
 
 		 206 aa  187  9e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003616  hypothetical protein  48.45 
 
 		 211 aa  187  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2665  hypothetical protein  45.75 
 
 		 209 aa  186  3e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0845681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0648  hypothetical protein  46.39 
 
 		 224 aa  182  3e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3020  hypothetical protein  49.48 
 
 		 213 aa  181  7e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.621257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2843  hypothetical protein  46.67 
 
 		 256 aa  177  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3946  TPR repeat-containing protein  48.57 
 
 		 211 aa  175  5e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3040  hypothetical protein  51.04 
 
 		 213 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.338752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0950  TPR repeat-containing protein  47.28 
 
 		 215 aa  172  5.999999999999999e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.265468  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2712  hypothetical protein  50.26 
 
 		 213 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.160555  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4142  TPR repeat-containing protein  42.11 
 
 		 208 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2557  hypothetical protein  41.49 
 
 		 227 aa  149  3e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1939  hypothetical protein  50.81 
 
 		 238 aa  148  8e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0293  hypothetical protein  48.8 
 
 		 206 aa  145  5e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.545966  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3353  hypothetical protein  45.88 
 
 		 214 aa  142  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.782786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2433  hypothetical protein  42.53 
 
 		 219 aa  141  8e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.28641  normal  0.541906 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2596  TPR repeat-containing protein  38.46 
 
 		 209 aa  132  3.9999999999999996e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.230663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1283  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 		 230 aa  120  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.873901 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2600  TPR repeat-containing protein  35.5 
 
 		 223 aa  118  9e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.167475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0138  hypothetical protein  56.04 
 
 		 93 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.299058  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02327  TPR repeat-containing protein  49.07 
 
 		 170 aa  100  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0734856  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2878  hypothetical protein  28.36 
 
 		 296 aa  49.3  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.484673 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1188  peptidase S41  35.29 
 
 		 897 aa  49.3  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.130898  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1015  hypothetical protein  38.89 
 
 		 267 aa  46.2  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0584  hypothetical protein  30.59 
 
 		 292 aa  45.4  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3296  TPR repeat-containing protein  32.35 
 
 		 193 aa  43.9  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.173177  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1452  hypothetical protein  23.4 
 
 		 243 aa  42  0.008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1528  TPR repeat-containing protein  31.68 
 
 		 275 aa  42  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0580  tetratricopeptide domain-containing protein  29.2 
 
 		 231 aa  41.6  0.01  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.367595  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0376  tetratricopeptide TPR_4  27.06 
 
 		 929 aa  41.6  0.01  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>