25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0584 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0584  hypothetical protein  100 
 
 		 292 aa  599  1e-170  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2878  hypothetical protein  59.11 
 
 		 296 aa  329  3e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.484673 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1015  hypothetical protein  32 
 
 		 267 aa  68.6  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1528  TPR repeat-containing protein  31.01 
 
 		 275 aa  59.7  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0950  TPR repeat-containing protein  26.97 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.265468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1523  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.1 
 
 		 245 aa  56.6  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.52918  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2031  TPR repeat-containing protein  28.47 
 
 		 206 aa  55.5  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003616  hypothetical protein  27.97 
 
 		 211 aa  54.3  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4142  TPR repeat-containing protein  25.15 
 
 		 208 aa  55.1  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3832  TPR repeat-containing protein  24.73 
 
 		 211 aa  52  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.972183  normal  0.172551 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2346  TPR repeat-containing protein  29.45 
 
 		 244 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1618  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.83 
 
 		 245 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.127216  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2080  hypothetical protein  33.91 
 
 		 247 aa  50.1  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2665  hypothetical protein  26.45 
 
 		 209 aa  50.1  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0845681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3089  hypothetical protein  31.2 
 
 		 249 aa  49.7  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.655576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03397  TPR repeats containing protein  28.81 
 
 		 215 aa  49.7  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03396  TPR repeats containing protein  26.52 
 
 		 233 aa  48.5  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3040  hypothetical protein  24.78 
 
 		 213 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.338752  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2712  hypothetical protein  24.78 
 
 		 213 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.160555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2557  hypothetical protein  30 
 
 		 227 aa  45.8  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3310  hypothetical protein  22.93 
 
 		 213 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.628665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2146  hypothetical protein  25.4 
 
 		 400 aa  43.9  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2716  hypothetical protein  33.33 
 
 		 905 aa  43.1  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0426299  hitchhiker  0.00105391 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1075  hypothetical protein  24.06 
 
 		 408 aa  42.4  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0196  TPR repeat-containing protein  34.12 
 
 		 927 aa  42.4  0.01  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.935444 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>