60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3040 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_3040  hypothetical protein  100 
 
 		 213 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.338752  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2712  hypothetical protein  98.12 
 
 		 213 aa  421  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.160555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3310  hypothetical protein  92.49 
 
 		 213 aa  401  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.628665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3020  hypothetical protein  84.98 
 
 		 213 aa  367  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.621257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3353  hypothetical protein  62.62 
 
 		 214 aa  227  8e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.782786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3832  TPR repeat-containing protein  50.23 
 
 		 211 aa  200  9.999999999999999e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.972183  normal  0.172551 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2031  TPR repeat-containing protein  51.98 
 
 		 206 aa  198  3.9999999999999996e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0648  hypothetical protein  51.69 
 
 		 224 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03396  TPR repeats containing protein  51.04 
 
 		 233 aa  193  2e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2665  hypothetical protein  50.56 
 
 		 209 aa  192  3e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0845681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0293  hypothetical protein  61.93 
 
 		 206 aa  192  3e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.545966  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3946  TPR repeat-containing protein  46.89 
 
 		 211 aa  187  1e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003616  hypothetical protein  48.31 
 
 		 211 aa  185  5e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0950  TPR repeat-containing protein  48.11 
 
 		 215 aa  181  1e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.265468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2433  hypothetical protein  51.7 
 
 		 219 aa  177  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.28641  normal  0.541906 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1939  hypothetical protein  57.14 
 
 		 238 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4142  TPR repeat-containing protein  44.2 
 
 		 208 aa  166  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2596  TPR repeat-containing protein  41.29 
 
 		 209 aa  152  4e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.230663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2843  hypothetical protein  41.54 
 
 		 256 aa  149  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03397  TPR repeats containing protein  38.76 
 
 		 215 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1283  TPR repeat-containing protein  38.66 
 
 		 230 aa  135  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.873901 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2557  hypothetical protein  38.55 
 
 		 227 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2600  TPR repeat-containing protein  33.81 
 
 		 223 aa  116  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.167475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02327  TPR repeat-containing protein  51.26 
 
 		 170 aa  112  5e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0734856  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0138  hypothetical protein  55.43 
 
 		 93 aa  110  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.299058  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2878  hypothetical protein  29.01 
 
 		 296 aa  57.8  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.484673 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.21 
 
 		 810 aa  55.5  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  38.79 
 
 		 878 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02328  TPR repeats containing protein  42.11 
 
 		 87 aa  49.7  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.090455  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1452  hypothetical protein  28.41 
 
 		 243 aa  49.3  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  34.02 
 
 		 750 aa  48.5  0.00007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0584  hypothetical protein  24.78 
 
 		 292 aa  47.8  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3244  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.85 
 
 		 699 aa  48.1  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  26.43 
 
 		 602 aa  46.6  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1523  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.61 
 
 		 245 aa  46.2  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.52918  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4723  TPR repeat-containing protein  30.3 
 
 		 289 aa  46.2  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.939176  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1015  hypothetical protein  32.47 
 
 		 267 aa  45.1  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1618  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.61 
 
 		 245 aa  45.1  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.127216  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00381  hypothetical protein  25.76 
 
 		 437 aa  45.1  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.07 
 
 		 632 aa  45.1  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  27.88 
 
 		 1297 aa  44.3  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2346  TPR repeat-containing protein  35.56 
 
 		 244 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  30.68 
 
 		 714 aa  44.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 714 aa  44.7  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  27.14 
 
 		 545 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00391  TPR repeat-containing protein  30.83 
 
 		 502 aa  44.3  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.264497  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00431  hypothetical protein  33.33 
 
 		 435 aa  43.5  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2309  TPR repeat-containing protein  32.67 
 
 		 278 aa  43.5  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.107221  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 739 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  24.58 
 
 		 543 aa  43.5  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  29.82 
 
 		 612 aa  43.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.71 
 
 		 2240 aa  43.1  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  29.09 
 
 		 587 aa  42.7  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2185  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  32.29 
 
 		 285 aa  42.7  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3296  TPR repeat-containing protein  31.78 
 
 		 193 aa  42.4  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.173177  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  31.25 
 
 		 816 aa  42  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2167  tetratricopeptide TPR_2  31 
 
 		 1014 aa  42  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.796808 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0116  TPR repeat-containing protein  28.28 
 
 		 289 aa  41.6  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.75872 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  28.86 
 
 		 685 aa  41.6  0.009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0991  TPR repeat-containing protein  28.95 
 
 		 357 aa  41.6  0.009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161827  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>