24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2346 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_2346  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
244 aa  489  1e-137  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1523  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  94.59 
 
 
245 aa  427  1e-118  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.52918  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1618  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  92.86 
 
 
245 aa  420  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.127216  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1528  TPR repeat-containing protein  70.95 
 
 
275 aa  304  8.000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336716  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4142  TPR repeat-containing protein  34.74 
 
 
208 aa  54.7  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2031  TPR repeat-containing protein  32.8 
 
 
206 aa  53.9  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0275  TPR repeat-containing protein  27.97 
 
 
245 aa  54.3  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00217035  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0870  hypothetical protein  28.57 
 
 
250 aa  54.3  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.706129  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1522  TPR repeat-containing protein  24.19 
 
 
260 aa  52  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3946  TPR repeat-containing protein  32.06 
 
 
211 aa  49.7  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0580  tetratricopeptide domain-containing protein  27.27 
 
 
231 aa  49.3  0.00005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.367595  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0584  hypothetical protein  29.45 
 
 
292 aa  47.8  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1939  hypothetical protein  33.93 
 
 
238 aa  48.1  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3497  hypothetical protein  33.12 
 
 
268 aa  47.8  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.798864 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0950  TPR repeat-containing protein  30.7 
 
 
215 aa  48.1  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.265468  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2878  hypothetical protein  24.11 
 
 
296 aa  48.1  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.484673 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3310  hypothetical protein  33.71 
 
 
213 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.628665  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0293  hypothetical protein  34.44 
 
 
206 aa  44.7  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.545966  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4026  hypothetical protein  32.59 
 
 
257 aa  44.3  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.452989  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0479  SARP family transcriptional regulator  30.97 
 
 
631 aa  44.3  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2712  hypothetical protein  35.56 
 
 
213 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.160555  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3040  hypothetical protein  35.56 
 
 
213 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.338752  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0648  hypothetical protein  32.04 
 
 
224 aa  43.1  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003616  hypothetical protein  30.34 
 
 
211 aa  42.4  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>