54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2712 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2712  hypothetical protein  100 
 
 		 213 aa  427  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.160555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3040  hypothetical protein  98.12 
 
 		 213 aa  421  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.338752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3310  hypothetical protein  92.49 
 
 		 213 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.628665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3020  hypothetical protein  84.51 
 
 		 213 aa  364  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.621257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3353  hypothetical protein  62.15 
 
 		 214 aa  224  7e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.782786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3832  TPR repeat-containing protein  50.23 
 
 		 211 aa  199  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.972183  normal  0.172551 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0648  hypothetical protein  51.21 
 
 		 224 aa  195  5.000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2031  TPR repeat-containing protein  51.49 
 
 		 206 aa  194  8.000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2665  hypothetical protein  50.56 
 
 		 209 aa  191  6e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0845681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0293  hypothetical protein  61.36 
 
 		 206 aa  190  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.545966  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03396  TPR repeats containing protein  50.26 
 
 		 233 aa  189  2.9999999999999997e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3946  TPR repeat-containing protein  46.89 
 
 		 211 aa  187  1e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003616  hypothetical protein  48.31 
 
 		 211 aa  184  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0950  TPR repeat-containing protein  48.58 
 
 		 215 aa  183  2.0000000000000003e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.265468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2433  hypothetical protein  52.84 
 
 		 219 aa  180  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.28641  normal  0.541906 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1939  hypothetical protein  57.67 
 
 		 238 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4142  TPR repeat-containing protein  44.2 
 
 		 208 aa  165  5e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2596  TPR repeat-containing protein  41.29 
 
 		 209 aa  153  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.230663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03397  TPR repeats containing protein  38.76 
 
 		 215 aa  146  2.0000000000000003e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2843  hypothetical protein  41.54 
 
 		 256 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1283  TPR repeat-containing protein  38.14 
 
 		 230 aa  134  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.873901 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2557  hypothetical protein  39.11 
 
 		 227 aa  124  8.000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2600  TPR repeat-containing protein  33.81 
 
 		 223 aa  115  6e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.167475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02327  TPR repeat-containing protein  51.26 
 
 		 170 aa  111  7.000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0734856  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0138  hypothetical protein  55.43 
 
 		 93 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.299058  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2878  hypothetical protein  29.68 
 
 		 296 aa  60.1  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.484673 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.09 
 
 		 810 aa  51.6  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  37.93 
 
 		 878 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1452  hypothetical protein  28.41 
 
 		 243 aa  49.3  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1523  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.45 
 
 		 245 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.52918  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02328  TPR repeats containing protein  42.11 
 
 		 87 aa  47.8  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.090455  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0584  hypothetical protein  24.78 
 
 		 292 aa  47.8  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3244  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.85 
 
 		 699 aa  47.8  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  34.02 
 
 		 750 aa  47.4  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1618  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.45 
 
 		 245 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.127216  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  31.25 
 
 		 714 aa  46.2  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 602 aa  46.2  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00381  hypothetical protein  25.76 
 
 		 437 aa  45.1  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  26.43 
 
 		 545 aa  45.4  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 714 aa  44.7  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2346  TPR repeat-containing protein  35.56 
 
 		 244 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00391  TPR repeat-containing protein  30.83 
 
 		 502 aa  44.3  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.264497  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  29.09 
 
 		 587 aa  44.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1015  hypothetical protein  32.47 
 
 		 267 aa  43.5  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  24.58 
 
 		 543 aa  43.5  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2309  TPR repeat-containing protein  32.67 
 
 		 278 aa  43.9  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.107221  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4723  TPR repeat-containing protein  29.29 
 
 		 289 aa  43.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.939176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.71 
 
 		 2240 aa  43.1  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00431  hypothetical protein  33.33 
 
 		 435 aa  42.7  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 632 aa  42.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 739 aa  42.7  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  31.25 
 
 		 816 aa  42  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0991  TPR repeat-containing protein  28.95 
 
 		 357 aa  42  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161827  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3296  TPR repeat-containing protein  31.78 
 
 		 193 aa  42  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.173177  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>