25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1015 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1015  hypothetical protein  100 
 
 		 267 aa  531  1e-150  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2878  hypothetical protein  28.21 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.484673 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0584  hypothetical protein  30.46 
 
 		 292 aa  63.9  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3089  hypothetical protein  35.71 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.655576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2665  hypothetical protein  40.91 
 
 		 209 aa  53.9  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0845681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2843  hypothetical protein  37.21 
 
 		 256 aa  53.5  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2557  hypothetical protein  41.33 
 
 		 227 aa  52.8  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003616  hypothetical protein  37.84 
 
 		 211 aa  52.4  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4142  TPR repeat-containing protein  34.67 
 
 		 208 aa  51.6  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3832  TPR repeat-containing protein  35.8 
 
 		 211 aa  51.2  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.972183  normal  0.172551 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3020  hypothetical protein  36.36 
 
 		 213 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.621257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1939  hypothetical protein  37.5 
 
 		 238 aa  50.4  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2080  hypothetical protein  33.08 
 
 		 247 aa  49.3  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3310  hypothetical protein  36.36 
 
 		 213 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.628665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03397  TPR repeats containing protein  35.11 
 
 		 215 aa  48.5  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2031  TPR repeat-containing protein  29.67 
 
 		 206 aa  47.4  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03396  TPR repeats containing protein  38.89 
 
 		 233 aa  46.2  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3946  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 211 aa  46.2  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02327  TPR repeat-containing protein  34.67 
 
 		 170 aa  45.8  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0734856  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0138  hypothetical protein  38.6 
 
 		 93 aa  44.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.299058  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3040  hypothetical protein  35.38 
 
 		 213 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.338752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0293  hypothetical protein  38.33 
 
 		 206 aa  43.9  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.545966  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3353  hypothetical protein  41.18 
 
 		 214 aa  42.7  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.782786  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2712  hypothetical protein  35.38 
 
 		 213 aa  42.7  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.160555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0950  TPR repeat-containing protein  30.26 
 
 		 215 aa  42.4  0.009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.265468  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>