50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3353 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3353  hypothetical protein  100 
 
 		 214 aa  425  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.782786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3020  hypothetical protein  63.55 
 
 		 213 aa  261  6e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.621257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3310  hypothetical protein  62.15 
 
 		 213 aa  259  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.628665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3040  hypothetical protein  62.62 
 
 		 213 aa  246  1e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.338752  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2712  hypothetical protein  62.15 
 
 		 213 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.160555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0648  hypothetical protein  57.71 
 
 		 224 aa  202  4e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2031  TPR repeat-containing protein  53.17 
 
 		 206 aa  195  5.000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3946  TPR repeat-containing protein  48.74 
 
 		 211 aa  185  5e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3832  TPR repeat-containing protein  48.6 
 
 		 211 aa  184  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.972183  normal  0.172551 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2665  hypothetical protein  47.85 
 
 		 209 aa  181  5.0000000000000004e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0845681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003616  hypothetical protein  47.09 
 
 		 211 aa  179  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1939  hypothetical protein  61.29 
 
 		 238 aa  178  4.999999999999999e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03396  TPR repeats containing protein  45.88 
 
 		 233 aa  172  3.9999999999999995e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4142  TPR repeat-containing protein  49.71 
 
 		 208 aa  171  7.999999999999999e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0293  hypothetical protein  50.53 
 
 		 206 aa  163  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.545966  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2596  TPR repeat-containing protein  41.35 
 
 		 209 aa  156  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.230663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2433  hypothetical protein  45.71 
 
 		 219 aa  154  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.28641  normal  0.541906 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0950  TPR repeat-containing protein  47.43 
 
 		 215 aa  153  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.265468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03397  TPR repeats containing protein  40.98 
 
 		 215 aa  145  4.0000000000000006e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2843  hypothetical protein  42.63 
 
 		 256 aa  143  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1283  TPR repeat-containing protein  39.9 
 
 		 230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.873901 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2557  hypothetical protein  40.59 
 
 		 227 aa  123  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02327  TPR repeat-containing protein  56.56 
 
 		 170 aa  123  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0734856  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0138  hypothetical protein  61.54 
 
 		 93 aa  113  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.299058  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2600  TPR repeat-containing protein  35.51 
 
 		 223 aa  111  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.167475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  29.08 
 
 		 1979 aa  58.5  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1166  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  37.36 
 
 		 261 aa  53.5  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.327307 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00381  hypothetical protein  29.46 
 
 		 437 aa  48.9  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  27.1 
 
 		 543 aa  47  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00391  TPR repeat-containing protein  34 
 
 		 502 aa  47  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.264497  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  29.41 
 
 		 545 aa  46.6  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1452  hypothetical protein  34.41 
 
 		 243 aa  46.2  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  31.82 
 
 		 587 aa  45.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2255  hypothetical protein  27.56 
 
 		 191 aa  44.7  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.319682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35 
 
 		 810 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02328  TPR repeats containing protein  45.28 
 
 		 87 aa  44.7  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.090455  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0901  tfp pilus assembly protein PilF  30.7 
 
 		 246 aa  44.7  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  30.71 
 
 		 878 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1015  hypothetical protein  32.43 
 
 		 267 aa  43.5  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3012  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.61 
 
 		 254 aa  43.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  30.93 
 
 		 750 aa  43.1  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0038  TPR repeat-containing protein  34 
 
 		 494 aa  42.4  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1523  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.57 
 
 		 245 aa  42  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.52918  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0964  TPR domain-containing protein  32.5 
 
 		 295 aa  42  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166963  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3244  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.89 
 
 		 699 aa  42  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1434  hypothetical protein  26.83 
 
 		 273 aa  42  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  27.54 
 
 		 1694 aa  41.6  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  37.04 
 
 		 816 aa  41.6  0.009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2878  hypothetical protein  26.27 
 
 		 296 aa  41.6  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.484673 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  31.16 
 
 		 714 aa  41.6  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>