28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1434 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1434  hypothetical protein  100 
 
 
273 aa  558  1e-158  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1141  hypothetical protein  41.81 
 
 
272 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.27984  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0933  hypothetical protein  41.92 
 
 
270 aa  187  2e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3620  TPR repeat-containing protein  40.87 
 
 
268 aa  181  8.000000000000001e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2749  hypothetical protein  36.13 
 
 
242 aa  104  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.594508  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6234  hypothetical protein  30.62 
 
 
251 aa  97.4  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.170418  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2252  hypothetical protein  31.96 
 
 
252 aa  94.7  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.303114  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_94311  predicted protein  25.75 
 
 
406 aa  78.6  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.320101 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0585  hypothetical protein  28.18 
 
 
255 aa  59.7  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  24.75 
 
 
816 aa  48.9  0.00009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  24.76 
 
 
2262 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 
2262 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  29.79 
 
 
685 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03397  TPR repeats containing protein  26.29 
 
 
215 aa  46.6  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  23.31 
 
 
545 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  23.3 
 
 
739 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0875  hypothetical protein  26.32 
 
 
231 aa  45.4  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.168274  normal  0.978348 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  24.19 
 
 
909 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1939  hypothetical protein  31.25 
 
 
238 aa  45.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0311  TPR repeat-containing protein  38.1 
 
 
513 aa  44.3  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0753033  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1186  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.23 
 
 
612 aa  44.3  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1429  PDZ/DHR/GLGF domain protein  26.39 
 
 
668 aa  43.1  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000479067  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1523  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.7 
 
 
245 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.52918  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2041  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  27.75 
 
 
884 aa  43.1  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.443497 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  25.9 
 
 
750 aa  42.7  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  23.79 
 
 
887 aa  42.4  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  23.58 
 
 
217 aa  42.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00381  hypothetical protein  30.22 
 
 
437 aa  42  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>