13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2749 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2749  hypothetical protein  100 
 
 
242 aa  489  1e-137  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.594508  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2252  hypothetical protein  37.5 
 
 
252 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.303114  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1434  hypothetical protein  36.13 
 
 
273 aa  104  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1141  hypothetical protein  30.91 
 
 
272 aa  90.1  3e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.27984  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3620  TPR repeat-containing protein  26.54 
 
 
268 aa  78.6  0.00000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_94311  predicted protein  29.81 
 
 
406 aa  72.8  0.000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.320101 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0933  hypothetical protein  27.48 
 
 
270 aa  70.9  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0875  hypothetical protein  29.07 
 
 
231 aa  69.7  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.168274  normal  0.978348 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0585  hypothetical protein  34.55 
 
 
255 aa  67.8  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6234  hypothetical protein  27.16 
 
 
251 aa  63.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.170418  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0670  hypothetical protein  27.63 
 
 
251 aa  55.1  0.0000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1076  hypothetical protein  27.75 
 
 
230 aa  54.7  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0648  hypothetical protein  26.12 
 
 
224 aa  45.4  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>