37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3620 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3620  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 268 aa  551  1e-156  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1434  hypothetical protein  40.87 
 
 		 273 aa  181  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1141  hypothetical protein  30.43 
 
 		 272 aa  135  5e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.27984  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0933  hypothetical protein  35.44 
 
 		 270 aa  135  9e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2252  hypothetical protein  30.39 
 
 		 252 aa  87.8  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.303114  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2749  hypothetical protein  26.54 
 
 		 242 aa  77.8  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.594508  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6234  hypothetical protein  29.68 
 
 		 251 aa  73.6  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.170418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  27.75 
 
 		 4079 aa  52  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.69 
 
 		 836 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  27.73 
 
 		 1297 aa  50.1  0.00004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0875  hypothetical protein  25.51 
 
 		 231 aa  48.9  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.168274  normal  0.978348 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2975  TPR repeat-containing protein  23.76 
 
 		 716 aa  48.5  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  26.99 
 
 		 927 aa  48.1  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0580  tetratricopeptide domain-containing protein  26.79 
 
 		 231 aa  47.8  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.367595  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  26.16 
 
 		 539 aa  47.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0870  hypothetical protein  25 
 
 		 250 aa  46.6  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.706129  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4974  TPR repeat-containing protein  23.21 
 
 		 422 aa  46.2  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0964  TPR domain-containing protein  32.98 
 
 		 295 aa  45.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166963  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0434  hypothetical protein  26.76 
 
 		 274 aa  45.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  25.56 
 
 		 730 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  28.38 
 
 		 878 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0905  TPR domain-containing protein  32.98 
 
 		 295 aa  44.7  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  32.08 
 
 		 329 aa  43.9  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1392  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 		 301 aa  43.5  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.800927  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2754  TPR repeat-containing protein  30.11 
 
 		 295 aa  43.5  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  25.1 
 
 		 745 aa  43.5  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  27.95 
 
 		 462 aa  43.5  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.29 
 
 		 810 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2895  O-linked N-acetylglucosamine transferase  23.96 
 
 		 292 aa  43.1  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0140366 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0585  hypothetical protein  23.75 
 
 		 255 aa  42.7  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  31.93 
 
 		 306 aa  42.7  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1362  TPR repeat-containing protein  23.77 
 
 		 376 aa  42.7  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.42 
 
 		 265 aa  42.4  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3665  TPR repeat-containing protein  30.93 
 
 		 289 aa  42.4  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00516372  normal  0.53352 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3363  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.93 
 
 		 289 aa  42.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.040769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 265 aa  42  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2801  TPR repeat-containing protein  28.72 
 
 		 291 aa  42.4  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.462521  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>