21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0580 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0580  tetratricopeptide domain-containing protein  100 
 
 		 231 aa  457  9.999999999999999e-129  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.367595  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0275  TPR repeat-containing protein  51.25 
 
 		 245 aa  231  7.000000000000001e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00217035  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0870  hypothetical protein  47.3 
 
 		 250 aa  200  1.9999999999999998e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.706129  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0875  hypothetical protein  31.54 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.168274  normal  0.978348 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0745  tetratricopeptide domain-containing protein  24.68 
 
 		 232 aa  58.9  0.00000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.473989  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1523  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.67 
 
 		 245 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.52918  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1452  hypothetical protein  27.27 
 
 		 243 aa  50.1  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1528  TPR repeat-containing protein  27.08 
 
 		 275 aa  49.7  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2346  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 244 aa  49.3  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1618  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.06 
 
 		 245 aa  49.3  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.127216  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3620  TPR repeat-containing protein  26.79 
 
 		 268 aa  47.4  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  28.46 
 
 		 1676 aa  45.8  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4603  TPR repeat-containing protein  27.16 
 
 		 722 aa  45.4  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66638  glucose repression mediator protein  24.83 
 
 		 815 aa  44.7  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2878  hypothetical protein  26.79 
 
 		 296 aa  45.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.484673 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 		 612 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0195  TPR domain protein  29.46 
 
 		 379 aa  43.5  0.002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.315867  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4142  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 208 aa  42.7  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  26.43 
 
 		 750 aa  42.4  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.32 
 
 		 2240 aa  42.4  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03396  TPR repeats containing protein  29.2 
 
 		 233 aa  41.6  0.01  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>