15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0745 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0745  tetratricopeptide domain-containing protein  100 
 
 
232 aa  471  1e-132  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.473989  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1452  hypothetical protein  39.73 
 
 
243 aa  158  6e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0580  tetratricopeptide domain-containing protein  24.68 
 
 
231 aa  58.9  0.00000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.367595  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0487  TPR repeat-containing protein  30.86 
 
 
566 aa  47.4  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  29.35 
 
 
887 aa  44.3  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1188  peptidase S41  41.67 
 
 
897 aa  43.9  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.130898  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18191  hypothetical protein  29.73 
 
 
425 aa  43.5  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.888115 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0275  TPR repeat-containing protein  23.33 
 
 
245 aa  43.5  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00217035  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  23.78 
 
 
462 aa  43.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2203  TPR repeat-containing protein  29.46 
 
 
331 aa  42.7  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36889  predicted protein  28.21 
 
 
209 aa  42.4  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00688126  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10800  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 
245 aa  42.4  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  24.29 
 
 
730 aa  42  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  31.52 
 
 
565 aa  41.6  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1952  O-antigen polymerase  35.85 
 
 
653 aa  41.6  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.953343  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>