21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1452 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1452  hypothetical protein  100 
 
 		 243 aa  497  1e-140  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0745  tetratricopeptide domain-containing protein  39.73 
 
 		 232 aa  158  6e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.473989  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0870  hypothetical protein  26.38 
 
 		 250 aa  50.4  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.706129  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0580  tetratricopeptide domain-containing protein  27.27 
 
 		 231 aa  50.1  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.367595  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2433  hypothetical protein  33.33 
 
 		 219 aa  49.3  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.28641  normal  0.541906 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2712  hypothetical protein  28.41 
 
 		 213 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.160555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3040  hypothetical protein  28.41 
 
 		 213 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.338752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0648  hypothetical protein  22.5 
 
 		 224 aa  48.5  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2031  TPR repeat-containing protein  29.69 
 
 		 206 aa  48.1  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1939  hypothetical protein  29.67 
 
 		 238 aa  48.1  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3310  hypothetical protein  27.27 
 
 		 213 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.628665  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4142  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 208 aa  45.8  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0950  TPR repeat-containing protein  27.91 
 
 		 215 aa  45.4  0.0009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.265468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2600  TPR repeat-containing protein  29.67 
 
 		 223 aa  45.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.167475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0138  hypothetical protein  33.8 
 
 		 93 aa  44.3  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.299058  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3020  hypothetical protein  26.14 
 
 		 213 aa  43.1  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.621257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  27.86 
 
 		 878 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.86 
 
 		 810 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  32.73 
 
 		 718 aa  42.4  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0854  Tetratricopeptide domain protein  37.74 
 
 		 122 aa  42.4  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.679313  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03396  TPR repeats containing protein  23.4 
 
 		 233 aa  42  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>