14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0870 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0870  hypothetical protein  100 
 
 		 250 aa  508  1e-143  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.706129  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0275  TPR repeat-containing protein  61.45 
 
 		 245 aa  293  2e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00217035  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0580  tetratricopeptide domain-containing protein  47.3 
 
 		 231 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.367595  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0875  hypothetical protein  34.52 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.168274  normal  0.978348 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2346  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 244 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1452  hypothetical protein  26.38 
 
 		 243 aa  50.4  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1523  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.89 
 
 		 245 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.52918  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1618  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.89 
 
 		 245 aa  50.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.127216  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1522  TPR repeat-containing protein  25.81 
 
 		 260 aa  49.3  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0670  hypothetical protein  28.1 
 
 		 251 aa  49.3  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3620  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 268 aa  46.2  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1528  TPR repeat-containing protein  25.17 
 
 		 275 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336716  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1076  hypothetical protein  25.4 
 
 		 230 aa  42.7  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2031  TPR repeat-containing protein  30.09 
 
 		 206 aa  42  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>