41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0950 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0950  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 215 aa  431  1e-120  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.265468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003616  hypothetical protein  56.65 
 
 		 211 aa  229  2e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3946  TPR repeat-containing protein  49.76 
 
 		 211 aa  197  7e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2031  TPR repeat-containing protein  52.69 
 
 		 206 aa  192  4e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0648  hypothetical protein  45.67 
 
 		 224 aa  182  3e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3310  hypothetical protein  48.33 
 
 		 213 aa  174  7e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.628665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3020  hypothetical protein  46.67 
 
 		 213 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.621257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03396  TPR repeats containing protein  47.28 
 
 		 233 aa  172  5e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3832  TPR repeat-containing protein  47.26 
 
 		 211 aa  170  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.972183  normal  0.172551 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2665  hypothetical protein  42.86 
 
 		 209 aa  169  4e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0845681  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2712  hypothetical protein  48.58 
 
 		 213 aa  162  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.160555  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4142  TPR repeat-containing protein  44.02 
 
 		 208 aa  161  6e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3040  hypothetical protein  48.11 
 
 		 213 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.338752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03397  TPR repeats containing protein  42.03 
 
 		 215 aa  156  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1939  hypothetical protein  50.26 
 
 		 238 aa  149  3e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2433  hypothetical protein  42.69 
 
 		 219 aa  144  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.28641  normal  0.541906 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0293  hypothetical protein  48.26 
 
 		 206 aa  139  3.9999999999999997e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.545966  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2843  hypothetical protein  35.98 
 
 		 256 aa  124  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3353  hypothetical protein  47.46 
 
 		 214 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.782786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02327  TPR repeat-containing protein  49.58 
 
 		 170 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0734856  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2557  hypothetical protein  42.76 
 
 		 227 aa  115  3.9999999999999997e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0138  hypothetical protein  57.14 
 
 		 93 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.299058  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1283  TPR repeat-containing protein  34.62 
 
 		 230 aa  111  8.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.873901 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2596  TPR repeat-containing protein  34.68 
 
 		 209 aa  111  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.230663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2600  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.167475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2878  hypothetical protein  26.62 
 
 		 296 aa  54.7  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.484673 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1523  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.19 
 
 		 245 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.52918  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1618  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.19 
 
 		 245 aa  52.4  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.127216  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1528  TPR repeat-containing protein  30.97 
 
 		 275 aa  52.4  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1829  TPR repeat-containing protein  33.7 
 
 		 322 aa  52  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.725463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0584  hypothetical protein  26.97 
 
 		 292 aa  52  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1141  hypothetical protein  27.33 
 
 		 272 aa  49.7  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.27984  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2346  TPR repeat-containing protein  30.7 
 
 		 244 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3244  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.66 
 
 		 699 aa  46.2  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  31.1 
 
 		 729 aa  45.8  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1452  hypothetical protein  27.91 
 
 		 243 aa  45.4  0.0007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  35.06 
 
 		 816 aa  45.1  0.0007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  23.97 
 
 		 1406 aa  43.1  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1015  hypothetical protein  30.26 
 
 		 267 aa  42.4  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1448  peptidase M48 Ste24p  35.42 
 
 		 469 aa  41.6  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.749654  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3052  peptidase S1C, HrtA/DegP2/Q/S  30.77 
 
 		 772 aa  41.6  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00233494  normal  0.413301 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>