30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2596 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2596  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 209 aa  431  1e-120  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.230663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1283  TPR repeat-containing protein  67.74 
 
 		 230 aa  263  1e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.873901 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2600  TPR repeat-containing protein  57.77 
 
 		 223 aa  231  7.000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.167475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3020  hypothetical protein  41.29 
 
 		 213 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.621257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3310  hypothetical protein  40.3 
 
 		 213 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.628665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0648  hypothetical protein  39.02 
 
 		 224 aa  145  4.0000000000000006e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2665  hypothetical protein  40.62 
 
 		 209 aa  144  8.000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0845681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3832  TPR repeat-containing protein  40.21 
 
 		 211 aa  143  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.972183  normal  0.172551 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2712  hypothetical protein  41.29 
 
 		 213 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.160555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3040  hypothetical protein  41.29 
 
 		 213 aa  141  8e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.338752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003616  hypothetical protein  39.6 
 
 		 211 aa  140  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2031  TPR repeat-containing protein  40 
 
 		 206 aa  138  4.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3353  hypothetical protein  41.35 
 
 		 214 aa  137  7.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.782786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2433  hypothetical protein  42.2 
 
 		 219 aa  135  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.28641  normal  0.541906 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03396  TPR repeats containing protein  38.46 
 
 		 233 aa  132  3e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0293  hypothetical protein  44.85 
 
 		 206 aa  129  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.545966  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4142  TPR repeat-containing protein  34.81 
 
 		 208 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3946  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 211 aa  118  7.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2843  hypothetical protein  35.71 
 
 		 256 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1939  hypothetical protein  41.3 
 
 		 238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03397  TPR repeats containing protein  35.52 
 
 		 215 aa  115  3.9999999999999997e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0950  TPR repeat-containing protein  34.68 
 
 		 215 aa  111  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.265468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02327  TPR repeat-containing protein  47.46 
 
 		 170 aa  101  8e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0734856  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0138  hypothetical protein  50 
 
 		 93 aa  96.7  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.299058  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2557  hypothetical protein  36.43 
 
 		 227 aa  85.5  5e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0691  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  36.13 
 
 		 883 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.953113 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1812  TPR repeat-containing protein  33.04 
 
 		 713 aa  43.1  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.154682 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02328  TPR repeats containing protein  31.58 
 
 		 87 aa  42  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.090455  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1015  hypothetical protein  38.46 
 
 		 267 aa  41.6  0.009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1204  TPR domain-containing protein  38.6 
 
 		 291 aa  41.6  0.01  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.79238  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>