43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_4142 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_4142  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 208 aa  427  1e-119  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3946  TPR repeat-containing protein  63.19 
 
 		 211 aa  251  4.0000000000000004e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2031  TPR repeat-containing protein  54.95 
 
 		 206 aa  208  5e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2665  hypothetical protein  49.21 
 
 		 209 aa  191  4e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0845681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003616  hypothetical protein  48.62 
 
 		 211 aa  186  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3020  hypothetical protein  44.17 
 
 		 213 aa  174  7e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.621257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0648  hypothetical protein  48.33 
 
 		 224 aa  172  3.9999999999999995e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3310  hypothetical protein  43.2 
 
 		 213 aa  168  4e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.628665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3832  TPR repeat-containing protein  42.29 
 
 		 211 aa  167  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.972183  normal  0.172551 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0950  TPR repeat-containing protein  42.11 
 
 		 215 aa  166  2e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.265468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0293  hypothetical protein  45.03 
 
 		 206 aa  161  7e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.545966  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3040  hypothetical protein  42.23 
 
 		 213 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.338752  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2712  hypothetical protein  42.23 
 
 		 213 aa  153  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.160555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1939  hypothetical protein  51.96 
 
 		 238 aa  154  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03396  TPR repeats containing protein  42.11 
 
 		 233 aa  152  4e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3353  hypothetical protein  46.7 
 
 		 214 aa  148  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.782786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2433  hypothetical protein  44.07 
 
 		 219 aa  146  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.28641  normal  0.541906 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2843  hypothetical protein  38.07 
 
 		 256 aa  139  3e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03397  TPR repeats containing protein  38.14 
 
 		 215 aa  134  8e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1283  TPR repeat-containing protein  37.57 
 
 		 230 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.873901 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2596  TPR repeat-containing protein  34.81 
 
 		 209 aa  125  3e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.230663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2557  hypothetical protein  38.71 
 
 		 227 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02327  TPR repeat-containing protein  51.75 
 
 		 170 aa  111  9e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0734856  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0138  hypothetical protein  55.43 
 
 		 93 aa  110  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.299058  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2600  TPR repeat-containing protein  37.64 
 
 		 223 aa  110  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.167475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2878  hypothetical protein  27.54 
 
 		 296 aa  67  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.484673 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1528  TPR repeat-containing protein  34.55 
 
 		 275 aa  62.4  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2346  TPR repeat-containing protein  35.11 
 
 		 244 aa  55.5  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1618  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.96 
 
 		 245 aa  55.5  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.127216  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1523  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.04 
 
 		 245 aa  55.1  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.52918  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0584  hypothetical protein  25.15 
 
 		 292 aa  53.9  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1015  hypothetical protein  34.67 
 
 		 267 aa  51.6  0.000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1452  hypothetical protein  27.78 
 
 		 243 aa  46.2  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4604  protein kinase  33.85 
 
 		 545 aa  45.8  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0378  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.33 
 
 		 545 aa  43.5  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.579733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0720  TPR repeat-containing protein  31.11 
 
 		 595 aa  43.9  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.537549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0580  tetratricopeptide domain-containing protein  26.67 
 
 		 231 aa  42.7  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.367595  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1730  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  27.91 
 
 		 974 aa  43.1  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000283057  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0070  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 201 aa  43.1  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000134059  normal  0.0131239 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0411  TPR domain-containing protein  28.21 
 
 		 621 aa  42.7  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0673088  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0402  TPR domain-containing protein  28.21 
 
 		 621 aa  42.7  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0851  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  36.21 
 
 		 255 aa  42.7  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2888  type IV pilus biogenesis protein PilF, putative  31.58 
 
 		 255 aa  41.2  0.01  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>