42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3020 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3020  hypothetical protein  100 
 
 		 213 aa  427  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.621257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3310  hypothetical protein  83.1 
 
 		 213 aa  364  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.628665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3040  hypothetical protein  84.98 
 
 		 213 aa  351  4e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.338752  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2712  hypothetical protein  84.51 
 
 		 213 aa  348  3e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.160555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3353  hypothetical protein  63.55 
 
 		 214 aa  231  5e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.782786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0648  hypothetical protein  55.56 
 
 		 224 aa  211  7e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2031  TPR repeat-containing protein  51.98 
 
 		 206 aa  199  3e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2665  hypothetical protein  52.78 
 
 		 209 aa  198  3.9999999999999996e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0845681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3832  TPR repeat-containing protein  49.3 
 
 		 211 aa  197  1.0000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.972183  normal  0.172551 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3946  TPR repeat-containing protein  47.85 
 
 		 211 aa  192  3e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0293  hypothetical protein  57.14 
 
 		 206 aa  187  8e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.545966  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003616  hypothetical protein  49.74 
 
 		 211 aa  186  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03396  TPR repeats containing protein  49.48 
 
 		 233 aa  185  6e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0950  TPR repeat-containing protein  46.67 
 
 		 215 aa  177  1e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.265468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2433  hypothetical protein  52.84 
 
 		 219 aa  176  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.28641  normal  0.541906 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4142  TPR repeat-containing protein  45.86 
 
 		 208 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1939  hypothetical protein  57.14 
 
 		 238 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2596  TPR repeat-containing protein  41.09 
 
 		 209 aa  158  6e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.230663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03397  TPR repeats containing protein  41.67 
 
 		 215 aa  154  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2843  hypothetical protein  42.56 
 
 		 256 aa  150  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1283  TPR repeat-containing protein  40.21 
 
 		 230 aa  141  6e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.873901 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2557  hypothetical protein  42.46 
 
 		 227 aa  132  5e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02327  TPR repeat-containing protein  56.3 
 
 		 170 aa  120  9.999999999999999e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0734856  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2600  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 223 aa  118  7.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.167475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0138  hypothetical protein  56.52 
 
 		 93 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.299058  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02328  TPR repeats containing protein  45.12 
 
 		 87 aa  55.5  0.0000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.090455  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2878  hypothetical protein  27.16 
 
 		 296 aa  53.5  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.484673 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.38 
 
 		 810 aa  52  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1015  hypothetical protein  36.36 
 
 		 267 aa  51.2  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  37.07 
 
 		 878 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1452  hypothetical protein  26.14 
 
 		 243 aa  47.4  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3244  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.05 
 
 		 699 aa  47  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4723  TPR repeat-containing protein  29.29 
 
 		 289 aa  44.7  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.939176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00381  hypothetical protein  25.76 
 
 		 437 aa  43.5  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  29.27 
 
 		 739 aa  43.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2167  tetratricopeptide TPR_2  30 
 
 		 1014 aa  42.7  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.796808 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  23.57 
 
 		 602 aa  42  0.007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0991  TPR repeat-containing protein  28.07 
 
 		 357 aa  42  0.007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161827  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1187  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.28 
 
 		 293 aa  42  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0548059  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3296  TPR repeat-containing protein  30.91 
 
 		 193 aa  42  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.173177  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  30.93 
 
 		 750 aa  42  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1522  TPR repeat-containing protein  36.9 
 
 		 260 aa  41.6  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>