33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0293 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0293  hypothetical protein  100 
 
 
206 aa  409  1e-113  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.545966  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3310  hypothetical protein  57.07 
 
 
213 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.628665  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3020  hypothetical protein  56.1 
 
 
213 aa  217  7.999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.621257  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2665  hypothetical protein  52.5 
 
 
209 aa  217  8.999999999999998e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0845681  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3040  hypothetical protein  60.94 
 
 
213 aa  204  5e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.338752  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0648  hypothetical protein  56.59 
 
 
224 aa  204  6e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2712  hypothetical protein  60.42 
 
 
213 aa  202  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.160555  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2031  TPR repeat-containing protein  51.47 
 
 
206 aa  199  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003616  hypothetical protein  51.61 
 
 
211 aa  198  3.9999999999999996e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3946  TPR repeat-containing protein  47.14 
 
 
211 aa  195  5.000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1939  hypothetical protein  65.57 
 
 
238 aa  189  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4142  TPR repeat-containing protein  48.17 
 
 
208 aa  187  9e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3832  TPR repeat-containing protein  50 
 
 
211 aa  185  5e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.972183  normal  0.172551 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03396  TPR repeats containing protein  49.43 
 
 
233 aa  181  9.000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2433  hypothetical protein  50 
 
 
219 aa  176  3e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.28641  normal  0.541906 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0950  TPR repeat-containing protein  47.37 
 
 
215 aa  174  7e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.265468  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3353  hypothetical protein  51.47 
 
 
214 aa  166  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.782786  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2843  hypothetical protein  43.75 
 
 
256 aa  150  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1283  TPR repeat-containing protein  41.18 
 
 
230 aa  145  6e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.873901 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2596  TPR repeat-containing protein  43.93 
 
 
209 aa  144  7.0000000000000006e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.230663  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03397  TPR repeats containing protein  38.59 
 
 
215 aa  135  3.0000000000000003e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02327  TPR repeat-containing protein  59.82 
 
 
170 aa  129  3e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0734856  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2557  hypothetical protein  38.02 
 
 
227 aa  127  9.000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2600  TPR repeat-containing protein  35.15 
 
 
223 aa  118  4.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.167475  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0138  hypothetical protein  53.85 
 
 
93 aa  109  3e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.299058  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02328  TPR repeats containing protein  42.19 
 
 
87 aa  53.9  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.090455  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2878  hypothetical protein  28.22 
 
 
296 aa  53.9  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.484673 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1523  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.95 
 
 
245 aa  51.6  0.000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.52918  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1528  TPR repeat-containing protein  29.76 
 
 
275 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336716  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1618  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.65 
 
 
245 aa  49.3  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.127216  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2346  TPR repeat-containing protein  29.76 
 
 
244 aa  49.3  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0584  hypothetical protein  26.72 
 
 
292 aa  44.7  0.0009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1015  hypothetical protein  38.33 
 
 
267 aa  44.3  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>