16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02328 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_02328  TPR repeats containing protein  100 
 
 		 87 aa  175  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.090455  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3020  hypothetical protein  45.12 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.621257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3310  hypothetical protein  49.12 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.628665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0293  hypothetical protein  41.94 
 
 		 206 aa  52.8  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.545966  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3040  hypothetical protein  41.82 
 
 		 213 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.338752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3832  TPR repeat-containing protein  34.57 
 
 		 211 aa  49.3  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.972183  normal  0.172551 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1283  TPR repeat-containing protein  38.71 
 
 		 230 aa  49.3  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.873901 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2665  hypothetical protein  41.07 
 
 		 209 aa  48.5  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0845681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0648  hypothetical protein  44.64 
 
 		 224 aa  47.8  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2712  hypothetical protein  41.82 
 
 		 213 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.160555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2600  TPR repeat-containing protein  34.92 
 
 		 223 aa  44.3  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.167475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3353  hypothetical protein  45.1 
 
 		 214 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.782786  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3946  TPR repeat-containing protein  29.49 
 
 		 211 aa  43.5  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2596  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 209 aa  42  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.230663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03396  TPR repeats containing protein  37.74 
 
 		 233 aa  40.8  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4142  TPR repeat-containing protein  35.85 
 
 		 208 aa  40  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>