29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2600 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2600  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 223 aa  459  9.999999999999999e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.167475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1283  TPR repeat-containing protein  58.02 
 
 		 230 aa  255  4e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.873901 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2596  TPR repeat-containing protein  57.77 
 
 		 209 aa  245  4e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.230663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2433  hypothetical protein  39.66 
 
 		 219 aa  137  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.28641  normal  0.541906 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03396  TPR repeats containing protein  35.5 
 
 		 233 aa  126  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4142  TPR repeat-containing protein  37.64 
 
 		 208 aa  126  3e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2665  hypothetical protein  38.04 
 
 		 209 aa  126  3e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0845681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3020  hypothetical protein  33.01 
 
 		 213 aa  125  5e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.621257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0648  hypothetical protein  32.65 
 
 		 224 aa  124  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3310  hypothetical protein  32.38 
 
 		 213 aa  121  8e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.628665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2843  hypothetical protein  33.33 
 
 		 256 aa  121  9e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2031  TPR repeat-containing protein  35.82 
 
 		 206 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3946  TPR repeat-containing protein  29.81 
 
 		 211 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03397  TPR repeats containing protein  33.49 
 
 		 215 aa  118  9e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3040  hypothetical protein  33.81 
 
 		 213 aa  118  9e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.338752  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2712  hypothetical protein  33.81 
 
 		 213 aa  118  9e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.160555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3832  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 211 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.972183  normal  0.172551 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0293  hypothetical protein  35.45 
 
 		 206 aa  115  3.9999999999999997e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.545966  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3353  hypothetical protein  36.72 
 
 		 214 aa  107  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.782786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003616  hypothetical protein  29.89 
 
 		 211 aa  107  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1939  hypothetical protein  42.86 
 
 		 238 aa  100  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0950  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 		 215 aa  95.1  7e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.265468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2557  hypothetical protein  34.07 
 
 		 227 aa  90.1  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02327  TPR repeat-containing protein  42.24 
 
 		 170 aa  81.6  0.000000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0734856  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0138  hypothetical protein  43.48 
 
 		 93 aa  76.3  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.299058  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4917  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.77 
 
 		 214 aa  47.8  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000226435  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1452  hypothetical protein  30 
 
 		 243 aa  45.1  0.0008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2878  hypothetical protein  22.67 
 
 		 296 aa  44.3  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.484673 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02328  TPR repeats containing protein  34.92 
 
 		 87 aa  43.9  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.090455  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>