34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3832 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3832  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 211 aa  429  1e-119  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.972183  normal  0.172551 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03396  TPR repeats containing protein  58.2 
 
 		 233 aa  222  4e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3310  hypothetical protein  50.7 
 
 		 213 aa  198  6e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.628665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3020  hypothetical protein  49.3 
 
 		 213 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.621257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03397  TPR repeats containing protein  46.92 
 
 		 215 aa  190  1e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003616  hypothetical protein  46.57 
 
 		 211 aa  189  2.9999999999999997e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2843  hypothetical protein  50.81 
 
 		 256 aa  186  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3040  hypothetical protein  50.23 
 
 		 213 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.338752  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2712  hypothetical protein  50.23 
 
 		 213 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.160555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2665  hypothetical protein  46.57 
 
 		 209 aa  174  9e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0845681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0648  hypothetical protein  50.29 
 
 		 224 aa  172  1.9999999999999998e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3946  TPR repeat-containing protein  45.45 
 
 		 211 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2031  TPR repeat-containing protein  51.69 
 
 		 206 aa  171  7.999999999999999e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0950  TPR repeat-containing protein  47.26 
 
 		 215 aa  170  1e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.265468  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4142  TPR repeat-containing protein  44.26 
 
 		 208 aa  165  5e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3353  hypothetical protein  48.6 
 
 		 214 aa  152  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.782786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0293  hypothetical protein  51.19 
 
 		 206 aa  148  5e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.545966  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2596  TPR repeat-containing protein  40.21 
 
 		 209 aa  143  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.230663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2433  hypothetical protein  45.35 
 
 		 219 aa  142  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.28641  normal  0.541906 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1939  hypothetical protein  46.41 
 
 		 238 aa  137  7.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1283  TPR repeat-containing protein  34.78 
 
 		 230 aa  119  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.873901 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2557  hypothetical protein  37.7 
 
 		 227 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02327  TPR repeat-containing protein  50.82 
 
 		 170 aa  116  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0734856  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2600  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 223 aa  105  5e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.167475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0138  hypothetical protein  51.09 
 
 		 93 aa  103  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.299058  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1015  hypothetical protein  35.8 
 
 		 267 aa  51.2  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02328  TPR repeats containing protein  34.57 
 
 		 87 aa  49.3  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.090455  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0584  hypothetical protein  24.73 
 
 		 292 aa  47.4  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2878  hypothetical protein  24.67 
 
 		 296 aa  45.8  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.484673 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1829  TPR repeat-containing protein  32.69 
 
 		 322 aa  44.7  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.725463  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  23.02 
 
 		 265 aa  42.4  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3871  TPR repeat-containing protein  25.66 
 
 		 196 aa  42  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2346  TPR repeat-containing protein  27.43 
 
 		 244 aa  41.6  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1683  TPR repeat-containing protein  31.75 
 
 		 942 aa  41.6  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.354598 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>