45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2557 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_2557  hypothetical protein  100 
 
 
227 aa  438  9.999999999999999e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03396  TPR repeats containing protein  41.49 
 
 
233 aa  158  7e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3946  TPR repeat-containing protein  41.55 
 
 
211 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0648  hypothetical protein  40.93 
 
 
224 aa  148  6e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3020  hypothetical protein  42.46 
 
 
213 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.621257  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2031  TPR repeat-containing protein  40.56 
 
 
206 aa  137  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3310  hypothetical protein  39.66 
 
 
213 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.628665  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3832  TPR repeat-containing protein  35.24 
 
 
211 aa  133  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.972183  normal  0.172551 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03397  TPR repeats containing protein  43.62 
 
 
215 aa  133  3e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4142  TPR repeat-containing protein  38.71 
 
 
208 aa  131  9e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2665  hypothetical protein  37.16 
 
 
209 aa  126  3e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0845681  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003616  hypothetical protein  38.29 
 
 
211 aa  125  5e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0293  hypothetical protein  37.3 
 
 
206 aa  120  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.545966  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2712  hypothetical protein  39.11 
 
 
213 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.160555  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0950  TPR repeat-containing protein  34.16 
 
 
215 aa  116  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.265468  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3040  hypothetical protein  38.55 
 
 
213 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.338752  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3353  hypothetical protein  38.58 
 
 
214 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.782786  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2843  hypothetical protein  36.24 
 
 
256 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2433  hypothetical protein  39.62 
 
 
219 aa  108  6e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.28641  normal  0.541906 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1939  hypothetical protein  45 
 
 
238 aa  105  7e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1283  TPR repeat-containing protein  38.1 
 
 
230 aa  101  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.873901 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2596  TPR repeat-containing protein  37.14 
 
 
209 aa  93.6  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.230663  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2600  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 
223 aa  88.6  7e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.167475  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02327  TPR repeat-containing protein  52.7 
 
 
170 aa  83.2  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0734856  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0138  hypothetical protein  43.96 
 
 
93 aa  79.7  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.299058  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1015  hypothetical protein  41.33 
 
 
267 aa  52.8  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2878  hypothetical protein  28.83 
 
 
296 aa  51.6  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.484673 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  34.04 
 
 
865 aa  50.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00391  TPR repeat-containing protein  29.31 
 
 
502 aa  50.1  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.264497  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  30.51 
 
 
603 aa  48.5  0.00009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  32.79 
 
 
685 aa  48.5  0.00009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
681 aa  47  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  34.51 
 
 
362 aa  46.6  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 
739 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 
637 aa  44.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0487  TPR repeat-containing protein  34.72 
 
 
566 aa  45.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  29.63 
 
 
795 aa  45.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0038  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 
494 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 
909 aa  43.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2852  tetratricopeptide TPR_2  35.64 
 
 
269 aa  43.5  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  29.84 
 
 
612 aa  43.5  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  30.58 
 
 
583 aa  42.7  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0584  hypothetical protein  29.89 
 
 
292 aa  43.1  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  39.22 
 
 
816 aa  42.7  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20571  SAM-binding motif-containing protein  30.94 
 
 
780 aa  42.4  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.183834 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>