40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003616 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003616  hypothetical protein  100 
 
 		 211 aa  430  1e-120  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0950  TPR repeat-containing protein  56.65 
 
 		 215 aa  229  2e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.265468  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3946  TPR repeat-containing protein  50.24 
 
 		 211 aa  208  4e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2031  TPR repeat-containing protein  50.48 
 
 		 206 aa  196  3e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0648  hypothetical protein  49.53 
 
 		 224 aa  192  2e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3832  TPR repeat-containing protein  46.57 
 
 		 211 aa  189  2.9999999999999997e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.972183  normal  0.172551 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2665  hypothetical protein  51.04 
 
 		 209 aa  188  5e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0845681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03396  TPR repeats containing protein  48.45 
 
 		 233 aa  187  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4142  TPR repeat-containing protein  48.62 
 
 		 208 aa  186  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3020  hypothetical protein  46.6 
 
 		 213 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.621257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3310  hypothetical protein  47.83 
 
 		 213 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.628665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3040  hypothetical protein  48.31 
 
 		 213 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.338752  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2712  hypothetical protein  48.31 
 
 		 213 aa  164  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.160555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03397  TPR repeats containing protein  42.93 
 
 		 215 aa  163  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1939  hypothetical protein  54.35 
 
 		 238 aa  162  3e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0293  hypothetical protein  51.79 
 
 		 206 aa  161  7e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.545966  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2843  hypothetical protein  43.89 
 
 		 256 aa  152  4e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2433  hypothetical protein  44.63 
 
 		 219 aa  146  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.28641  normal  0.541906 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3353  hypothetical protein  47.09 
 
 		 214 aa  142  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.782786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1283  TPR repeat-containing protein  39.04 
 
 		 230 aa  142  4e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.873901 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2596  TPR repeat-containing protein  39.6 
 
 		 209 aa  140  9.999999999999999e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.230663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0138  hypothetical protein  63.04 
 
 		 93 aa  126  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.299058  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2557  hypothetical protein  38.29 
 
 		 227 aa  125  6e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02327  TPR repeat-containing protein  49.58 
 
 		 170 aa  117  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0734856  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2600  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 223 aa  94  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.167475  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1015  hypothetical protein  37.84 
 
 		 267 aa  52.4  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1609  TPR repeat-containing protein  32.5 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.994867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2878  hypothetical protein  26.06 
 
 		 296 aa  50.4  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.484673 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0584  hypothetical protein  29.84 
 
 		 292 aa  47.8  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  35.06 
 
 		 816 aa  45.8  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00391  TPR repeat-containing protein  32 
 
 		 502 aa  45.4  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.264497  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  26.38 
 
 		 543 aa  44.3  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  32.99 
 
 		 750 aa  44.7  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1528  TPR repeat-containing protein  35.62 
 
 		 275 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1166  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  33.7 
 
 		 261 aa  42.7  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.327307 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  35.53 
 
 		 795 aa  42.7  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0840  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.04 
 
 		 199 aa  42.4  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1523  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.07 
 
 		 245 aa  42.4  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.52918  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2346  TPR repeat-containing protein  30.34 
 
 		 244 aa  42  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1618  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.07 
 
 		 245 aa  41.6  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.127216  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>