28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1283 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1283  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 230 aa  469  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.873901 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2596  TPR repeat-containing protein  63.94 
 
 		 209 aa  273  2.0000000000000002e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.230663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2600  TPR repeat-containing protein  58.29 
 
 		 223 aa  238  5e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.167475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0648  hypothetical protein  38.65 
 
 		 224 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003616  hypothetical protein  37.86 
 
 		 211 aa  145  6e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2433  hypothetical protein  41.01 
 
 		 219 aa  141  8e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.28641  normal  0.541906 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3946  TPR repeat-containing protein  36.71 
 
 		 211 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3310  hypothetical protein  37.09 
 
 		 213 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.628665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2665  hypothetical protein  40.31 
 
 		 209 aa  139  3e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0845681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3020  hypothetical protein  38.03 
 
 		 213 aa  138  7e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.621257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3040  hypothetical protein  36.62 
 
 		 213 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.338752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4142  TPR repeat-containing protein  37.57 
 
 		 208 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2712  hypothetical protein  36.15 
 
 		 213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.160555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0293  hypothetical protein  42.6 
 
 		 206 aa  129  4.0000000000000003e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.545966  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2031  TPR repeat-containing protein  38.83 
 
 		 206 aa  125  7e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2843  hypothetical protein  33.99 
 
 		 256 aa  124  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03396  TPR repeats containing protein  36.36 
 
 		 233 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3832  TPR repeat-containing protein  34.78 
 
 		 211 aa  119  3.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.972183  normal  0.172551 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03397  TPR repeats containing protein  36.26 
 
 		 215 aa  116  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1939  hypothetical protein  42.55 
 
 		 238 aa  115  7.999999999999999e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0950  TPR repeat-containing protein  34.62 
 
 		 215 aa  111  9e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.265468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3353  hypothetical protein  39.9 
 
 		 214 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.782786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0138  hypothetical protein  52.17 
 
 		 93 aa  92.8  4e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.299058  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2557  hypothetical protein  38 
 
 		 227 aa  92  7e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02327  TPR repeat-containing protein  44.63 
 
 		 170 aa  89.7  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0734856  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02328  TPR repeats containing protein  34.18 
 
 		 87 aa  50.1  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.090455  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0691  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  33.33 
 
 		 883 aa  45.1  0.0008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.953113 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0376  tetratricopeptide TPR_4  30.43 
 
 		 929 aa  42.7  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>