30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03397 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03397  TPR repeats containing protein  100 
 
 		 215 aa  431  1e-120  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03396  TPR repeats containing protein  54.21 
 
 		 233 aa  214  7e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3832  TPR repeat-containing protein  46.92 
 
 		 211 aa  190  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.972183  normal  0.172551 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2843  hypothetical protein  47.59 
 
 		 256 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003616  hypothetical protein  42.93 
 
 		 211 aa  163  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0950  TPR repeat-containing protein  42.03 
 
 		 215 aa  156  2e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.265468  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2031  TPR repeat-containing protein  41.92 
 
 		 206 aa  155  3e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3020  hypothetical protein  41.67 
 
 		 213 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.621257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3310  hypothetical protein  41.15 
 
 		 213 aa  151  7e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.628665  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3946  TPR repeat-containing protein  41.12 
 
 		 211 aa  149  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0648  hypothetical protein  36.45 
 
 		 224 aa  149  4e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2665  hypothetical protein  42.29 
 
 		 209 aa  143  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0845681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2433  hypothetical protein  43.24 
 
 		 219 aa  134  8e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.28641  normal  0.541906 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4142  TPR repeat-containing protein  39.88 
 
 		 208 aa  132  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3040  hypothetical protein  38.76 
 
 		 213 aa  127  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.338752  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2712  hypothetical protein  38.76 
 
 		 213 aa  127  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.160555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2557  hypothetical protein  43.62 
 
 		 227 aa  125  6e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1283  TPR repeat-containing protein  36.26 
 
 		 230 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.873901 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2596  TPR repeat-containing protein  35.52 
 
 		 209 aa  115  3.9999999999999997e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.230663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3353  hypothetical protein  40.98 
 
 		 214 aa  115  6e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.782786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2600  TPR repeat-containing protein  33.95 
 
 		 223 aa  111  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.167475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1939  hypothetical protein  40.51 
 
 		 238 aa  107  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0293  hypothetical protein  38.18 
 
 		 206 aa  105  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.545966  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0138  hypothetical protein  52.27 
 
 		 93 aa  104  8e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.299058  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02327  TPR repeat-containing protein  39.81 
 
 		 170 aa  90.9  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0734856  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2878  hypothetical protein  27.12 
 
 		 296 aa  53.9  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.484673 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1015  hypothetical protein  35.11 
 
 		 267 aa  48.5  0.00008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1434  hypothetical protein  26.29 
 
 		 273 aa  46.6  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0584  hypothetical protein  28.81 
 
 		 292 aa  44.7  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0172  glycosyl transferase family protein  35.38 
 
 		 991 aa  42.7  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>