138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1829 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_1829  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 322 aa  656    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.725463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3052  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 		 359 aa  118  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.1692  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05590  hypothetical protein  24.13 
 
 		 319 aa  78.6  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.901081  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1882  TPR repeat-containing protein  33.15 
 
 		 302 aa  77.4  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.442925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  26.87 
 
 		 1737 aa  76.3  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.61 
 
 		 810 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0302  TPR repeat-containing protein  32.76 
 
 		 337 aa  58.9  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.642139  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  20.27 
 
 		 3145 aa  58.9  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  27.24 
 
 		 878 aa  56.2  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1680  hypothetical protein  27.43 
 
 		 252 aa  55.8  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546626 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  27.21 
 
 		 808 aa  54.3  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  22.3 
 
 		 795 aa  54.3  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0812  tetratricopeptide TPR_2  33.71 
 
 		 452 aa  53.5  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.159009  normal  0.340374 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  21.47 
 
 		 573 aa  53.1  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  32.98 
 
 		 4079 aa  53.1  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  23.75 
 
 		 280 aa  53.1  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  24.54 
 
 		 828 aa  52.8  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2478  TPR repeat-containing protein  23.36 
 
 		 884 aa  52  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.599046  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  24.54 
 
 		 828 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.18 
 
 		 2240 aa  51.6  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0950  TPR repeat-containing protein  33.7 
 
 		 215 aa  51.6  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.265468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  24.83 
 
 		 361 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5021  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  38.81 
 
 		 295 aa  51.2  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.667321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  24.87 
 
 		 267 aa  50.8  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1567  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.48 
 
 		 339 aa  50.8  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00816314  normal  0.0470804 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  25.59 
 
 		 789 aa  50.8  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  25.8 
 
 		 714 aa  50.1  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3235  tetratricopeptide TPR_2  27.75 
 
 		 734 aa  50.1  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3430  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.51 
 
 		 633 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.345499 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3111  TPR repeat-containing protein  36.51 
 
 		 631 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.651134 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1834  tetratricopeptide TPR_2  26.72 
 
 		 367 aa  50.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0184634  normal  0.791476 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0183  cellulose synthase operon C domain protein  42.31 
 
 		 1157 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.89 
 
 		 758 aa  49.7  0.00007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4895  cellulose synthase subunit BcsC  42.31 
 
 		 1157 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03378  cellulose synthase subunit  42.31 
 
 		 1157 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0219  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 		 189 aa  49.3  0.00008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  24.92 
 
 		 1094 aa  49.3  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03331  hypothetical protein  42.31 
 
 		 1157 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4018  cellulose synthase subunit BcsC  42.31 
 
 		 1140 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0187  cellulose synthase subunit BcsC  42.31 
 
 		 1157 aa  49.7  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.865635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3839  cellulose synthase subunit BcsC  42.31 
 
 		 1157 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.503197 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  28.14 
 
 		 715 aa  49.7  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0243  TPR repeat-containing protein  30.63 
 
 		 208 aa  49.3  0.00009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.127552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5044  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31 
 
 		 233 aa  48.9  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  24.04 
 
 		 622 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1796  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.15 
 
 		 465 aa  48.9  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.769841  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 2262 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  25.96 
 
 		 828 aa  47.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4054  cytochrome c biogenesis protein  28.7 
 
 		 344 aa  47.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  23.45 
 
 		 566 aa  48.5  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4603  TPR repeat-containing protein  30.4 
 
 		 722 aa  48.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  23.03 
 
 		 3301 aa  48.5  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3305  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.92 
 
 		 633 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.412793 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4074  TPR repeat-containing protein  38.1 
 
 		 622 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1767  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  23.33 
 
 		 882 aa  47.8  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  22.59 
 
 		 3172 aa  47.8  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  22.88 
 
 		 448 aa  47.8  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  23.1 
 
 		 824 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4723  TPR repeat-containing protein  23.74 
 
 		 289 aa  47  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.939176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  26.6 
 
 		 754 aa  47  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2266  tetratricopeptide TPR_2  27.27 
 
 		 1213 aa  47  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  29.7 
 
 		 887 aa  46.6  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0699  TPR repeat-containing protein  26.55 
 
 		 563 aa  47  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000888687 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  29.52 
 
 		 605 aa  46.6  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  26.55 
 
 		 847 aa  46.6  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.46 
 
 		 632 aa  46.2  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  24.08 
 
 		 764 aa  46.2  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  25.49 
 
 		 573 aa  46.2  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3719  TPR repeat-containing protein  23.86 
 
 		 405 aa  46.2  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3949  TPR repeat-containing protein  25.23 
 
 		 361 aa  45.8  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  28.92 
 
 		 718 aa  45.4  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  29.27 
 
 		 597 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2708  tetratricopeptide TPR_2  20.28 
 
 		 979 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  30.91 
 
 		 465 aa  45.4  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4380  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.92 
 
 		 619 aa  45.4  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.842579  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3832  TPR repeat-containing protein  27.61 
 
 		 211 aa  45.4  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.972183  normal  0.172551 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0378  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.28 
 
 		 545 aa  45.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.579733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.12 
 
 		 738 aa  44.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0534  TPR repeat-containing protein  29.09 
 
 		 573 aa  44.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  23.5 
 
 		 265 aa  45.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1855  sulfotransferase  27.98 
 
 		 725 aa  44.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.5 
 
 		 265 aa  44.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  26.24 
 
 		 883 aa  44.3  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  27.83 
 
 		 875 aa  43.9  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  35.42 
 
 		 626 aa  44.3  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  27.89 
 
 		 634 aa  44.3  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0912  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 748 aa  44.3  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.795031  hitchhiker  0.00626987 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  26.86 
 
 		 832 aa  44.3  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00051  TPR-repeat pilus assembly protein TadD  22.92 
 
 		 287 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.589169  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3210  TPR domain-containing protein  27.55 
 
 		 781 aa  43.5  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  29.61 
 
 		 620 aa  43.9  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  23.13 
 
 		 816 aa  43.9  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2367  TPR repeat-containing protein  26.45 
 
 		 860 aa  43.9  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0520  TPR repeat-containing protein  31.34 
 
 		 621 aa  43.9  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2747  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 617 aa  43.9  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.538174  normal  0.232228 
 
 
-
 
NC_004310  BR0402  TPR domain-containing protein  31.34 
 
 		 621 aa  43.5  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3815  TPR repeat-containing protein  23.35 
 
 		 399 aa  43.5  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  23.61 
 
 		 1276 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3213  TPR repeat-containing protein  28.83 
 
 		 227 aa  43.5  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0411  TPR domain-containing protein  31.34 
 
 		 621 aa  43.5  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0673088  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>