More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1567 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1567  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 339 aa  696    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00816314  normal  0.0470804 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1535  Tetratricopeptide domain protein  41.67 
 
 		 322 aa  241  2e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148756  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 362 aa  70.1  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  29.48 
 
 		 718 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  28.1 
 
 		 681 aa  67.8  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  28 
 
 		 739 aa  67.4  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.08 
 
 		 352 aa  66.6  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.913573  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  28.08 
 
 		 878 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  26.35 
 
 		 3035 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  30.9 
 
 		 1005 aa  64.3  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  26.45 
 
 		 661 aa  63.9  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  25.71 
 
 		 764 aa  63.5  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  25.71 
 
 		 622 aa  63.2  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  25.34 
 
 		 909 aa  62.8  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3697  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.71 
 
 		 293 aa  62.8  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  26.47 
 
 		 739 aa  62.8  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  25.15 
 
 		 634 aa  62  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 		 4489 aa  62.4  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.51 
 
 		 689 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  26.47 
 
 		 1486 aa  62.4  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2476  TPR domain-containing protein  29.52 
 
 		 566 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.834275  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  26.57 
 
 		 685 aa  61.6  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3102  TPR repeat-containing protein  26.14 
 
 		 313 aa  61.6  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000142669  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2356  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.95 
 
 		 359 aa  61.6  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.337618  normal  0.0354802 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  25.4 
 
 		 1154 aa  61.2  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.88 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0322  TPR repeat-containing protein  30.7 
 
 		 401 aa  60.5  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000024467  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  26.57 
 
 		 637 aa  60.5  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 543 aa  60.5  0.00000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  26.34 
 
 		 725 aa  60.5  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0955  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.16 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  24.88 
 
 		 265 aa  59.7  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0516  TPR repeat-containing protein  26.79 
 
 		 673 aa  60.1  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000776603  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  29.48 
 
 		 1276 aa  59.7  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  29.41 
 
 		 1694 aa  59.7  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  29.6 
 
 		 594 aa  59.7  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  32.43 
 
 		 626 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11910  TPR repeat-containing protein  24.69 
 
 		 394 aa  59.3  0.00000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000944223  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  29.25 
 
 		 936 aa  58.5  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0699  TPR repeat-containing protein  28.08 
 
 		 563 aa  59.3  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000888687 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.09 
 
 		 1034 aa  58.9  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3871  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 196 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  23.45 
 
 		 279 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  24.54 
 
 		 3145 aa  58.9  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  27.16 
 
 		 561 aa  58.5  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  27.41 
 
 		 1979 aa  58.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  24.24 
 
 		 311 aa  58.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  31.08 
 
 		 626 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  27.16 
 
 		 561 aa  58.5  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  23.93 
 
 		 733 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  31.08 
 
 		 614 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3605  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.72 
 
 		 248 aa  58.2  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1187  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.14 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0548059  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.15 
 
 		 810 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  31.08 
 
 		 614 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  30.82 
 
 		 2262 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  26.85 
 
 		 883 aa  57.4  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  25.31 
 
 		 1827 aa  56.6  0.0000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0433  TPR repeat-containing protein  26.29 
 
 		 254 aa  57  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.017119  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2196  sulfotransferase  28.12 
 
 		 648 aa  57  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0055  type III secretion chaperone, putative  37.36 
 
 		 335 aa  56.6  0.0000006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  24.25 
 
 		 577 aa  56.6  0.0000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  26.27 
 
 		 4079 aa  56.6  0.0000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  21.85 
 
 		 392 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1755  TPR repeat-containing protein  30.28 
 
 		 647 aa  56.6  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0455441 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  27.89 
 
 		 837 aa  56.2  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  28.77 
 
 		 1676 aa  56.2  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  30.41 
 
 		 626 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10800  TPR repeat-containing protein  25.56 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  29.03 
 
 		 715 aa  56.2  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  26.09 
 
 		 865 aa  56.2  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0991  TPR repeat-containing protein  28.19 
 
 		 357 aa  55.8  0.0000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161827  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0730  TPR repeat-containing protein  30.07 
 
 		 518 aa  55.8  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.444597  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2747  TPR repeat-containing protein  35.11 
 
 		 248 aa  55.8  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  30.41 
 
 		 614 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  30.41 
 
 		 614 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.49 
 
 		 237 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0774  tetratricopeptide TPR_2  27.69 
 
 		 519 aa  55.5  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.169881  normal  0.452711 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  30.41 
 
 		 614 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  28.93 
 
 		 833 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1972  TPR repeat-containing protein  25.76 
 
 		 255 aa  54.7  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  26.71 
 
 		 875 aa  54.7  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  22.36 
 
 		 750 aa  54.7  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  25.71 
 
 		 732 aa  54.7  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2957  TPR repeat-containing protein  25.95 
 
 		 297 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.338311  normal  0.060469 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3161  TPR repeat-containing protein  25.95 
 
 		 297 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2708  tetratricopeptide TPR_2  22.73 
 
 		 979 aa  54.7  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  24.65 
 
 		 887 aa  54.7  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1897  TPR repeat-containing protein  26.12 
 
 		 214 aa  54.7  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1114  TPR domain-containing protein  28.7 
 
 		 299 aa  54.7  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0729535  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2615  TPR domain-containing protein  33.33 
 
 		 196 aa  54.7  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0738  TPR repeat-containing protein  22.54 
 
 		 323 aa  53.9  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00630781  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 		 1406 aa  54.3  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1605  tetratricopeptide TPR_2  22.44 
 
 		 252 aa  54.3  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.790082 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3073  TPR repeat-containing protein  28.74 
 
 		 886 aa  54.3  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3925  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 1180 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3220  TPR repeat-containing protein  26.16 
 
 		 1178 aa  53.9  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.166794 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2201  Tfp pilus assembly protein PilF-like  26.81 
 
 		 542 aa  53.9  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2936  TPR repeat-containing protein  30.58 
 
 		 200 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.196962 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  29.57 
 
 		 808 aa  53.9  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>