More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3305 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4380  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  73.68 
 
 		 619 aa  888    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.842579  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2747  TPR repeat-containing protein  72.48 
 
 		 617 aa  884    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.538174  normal  0.232228 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4074  TPR repeat-containing protein  79.13 
 
 		 622 aa  976    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3111  TPR repeat-containing protein  97.31 
 
 		 631 aa  1240    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.651134 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3430  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  97.31 
 
 		 633 aa  1246    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.345499 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3305  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 633 aa  1274    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.412793 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0857  TPR repeat-containing protein  52.79 
 
 		 572 aa  596  1e-169  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.6877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1117  TPR repeat-containing protein  52.11 
 
 		 585 aa  587  1e-166  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.573354 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3217  tetratricopeptide TPR_2  44.37 
 
 		 593 aa  521  1e-146  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.7268  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1382  TPR repeat-containing protein  48.26 
 
 		 579 aa  518  1e-146  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.18968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2594  TPR repeat-containing protein  45.5 
 
 		 617 aa  509  1e-143  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.390942 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1230  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  44.73 
 
 		 594 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4357  tetratricopeptide TPR_2  46.49 
 
 		 593 aa  504  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0312227  normal  0.0147446 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1085  TPR repeat-containing protein  44.14 
 
 		 592 aa  491  1e-137  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1212  tetratricopeptide TPR_2  44.14 
 
 		 592 aa  488  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2347  hypothetical protein  46.96 
 
 		 583 aa  475  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  0.172568 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0520  TPR repeat-containing protein  38.11 
 
 		 621 aa  384  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0942  hypothetical protein  37.2 
 
 		 619 aa  379  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0402  TPR domain-containing protein  38.75 
 
 		 621 aa  369  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0411  TPR domain-containing protein  38.75 
 
 		 621 aa  369  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0673088  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0457  TPR repeat-containing protein  36.96 
 
 		 607 aa  369  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.559359 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0720  TPR repeat-containing protein  39.78 
 
 		 595 aa  362  1e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.537549  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0566  TPR repeat-containing protein  36.57 
 
 		 610 aa  352  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0522  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.22 
 
 		 610 aa  348  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.133163  normal  0.433558 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0712  tetratricopeptide TPR_2  36.96 
 
 		 677 aa  335  2e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0382  TPR repeat-containing protein  30.85 
 
 		 576 aa  272  1e-71  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0425  TPR repeat-containing protein  36.42 
 
 		 566 aa  267  4e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2472  TPR repeat-containing protein  35.58 
 
 		 566 aa  261  3e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3744  tetratricopeptide TPR_2  33.98 
 
 		 572 aa  261  3e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1778  TPR domain-containing protein  37.71 
 
 		 425 aa  244  3e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.128909  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0424  TPR repeat-containing protein  32.04 
 
 		 642 aa  234  3e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0264  TPR repeat-containing protein  33.89 
 
 		 599 aa  234  5e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.907544  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3074  TPR domain protein  33.21 
 
 		 584 aa  231  3e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.83813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0485  tetratricopeptide TPR_2  31.65 
 
 		 566 aa  226  8e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2187  TPR repeat-containing protein  33.1 
 
 		 571 aa  220  6e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1284  TPR repeat-containing protein  29.14 
 
 		 612 aa  199  2.0000000000000003e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2168  TPR repeat-containing protein  39.37 
 
 		 573 aa  176  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.28547  normal  0.066147 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2662  tetratricopeptide domain-containing protein  32.6 
 
 		 557 aa  158  2e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0513511  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0817  TPR repeat-containing protein  33.57 
 
 		 594 aa  155  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.02661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4107  TPR repeat-containing protein  29.2 
 
 		 552 aa  143  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2098  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.6 
 
 		 566 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000120088  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4603  TPR repeat-containing protein  25.83 
 
 		 722 aa  129  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  31.13 
 
 		 573 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  31.09 
 
 		 568 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  25.43 
 
 		 573 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  23.18 
 
 		 573 aa  117  5e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.23 
 
 		 572 aa  115  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0511  TPR repeat-containing protein  25.7 
 
 		 581 aa  109  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0681  tetratricopeptide TPR_2  30.82 
 
 		 562 aa  109  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2645  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.18 
 
 		 572 aa  108  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000110346  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.16 
 
 		 557 aa  103  6e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  23.62 
 
 		 567 aa  103  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2475  peptidoglycan-binding LysM  29.06 
 
 		 632 aa  103  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00625277  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1872  TPR repeat-containing protein  27.8 
 
 		 594 aa  102  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0261679  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1186  tetratricopeptide TPR_2  36.77 
 
 		 482 aa  101  4e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0407507  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1053  TPR domain-containing protein  28.97 
 
 		 586 aa  100  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.038306  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2934  TPR domain-containing protein  30.41 
 
 		 606 aa  98.2  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152208  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3116  TPR domain-containing protein  30.41 
 
 		 606 aa  98.2  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.56398  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0589  TPR repeat-containing protein  30.41 
 
 		 606 aa  98.2  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0397506  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0757  hypothetical protein  30.41 
 
 		 606 aa  98.2  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0573  TPR repeat-containing protein  30.41 
 
 		 606 aa  98.2  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.054966  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0318  TPR repeat-containing protein  30.87 
 
 		 613 aa  98.6  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0135252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1506  TPR domain-containing protein  30.41 
 
 		 606 aa  98.2  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000406366  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0084  TPR domain-containing protein  30.41 
 
 		 606 aa  98.2  4e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2762  TPR domain protein  27.62 
 
 		 603 aa  96.7  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0478  TPR domain-containing protein  29.22 
 
 		 606 aa  96.7  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2382  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.1 
 
 		 553 aa  95.9  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.407653 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0588  TPR repeat-containing protein  34.44 
 
 		 613 aa  95.5  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.498138  decreased coverage  0.00128079 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1918  outer membrane lipoprotein LolB  35.76 
 
 		 494 aa  94.4  6e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2717  TPR repeat-containing protein  28 
 
 		 607 aa  94  7e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0254637  normal  0.13639 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2859  TPR repeat-containing protein  28 
 
 		 607 aa  94  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.504005  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0516  TPR repeat-containing protein  28.81 
 
 		 607 aa  94  8e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6129  TPR repeat-containing protein  28.11 
 
 		 607 aa  92.8  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00611296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4130  hypothetical protein  33.11 
 
 		 613 aa  92.4  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.533551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3232  hypothetical protein  32.88 
 
 		 609 aa  92.8  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0129967  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4342  Tetratricopeptide domain protein  33.55 
 
 		 616 aa  92  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118826  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2555  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.22 
 
 		 804 aa  92  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152731  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3727  TPR repeat-containing protein  34.42 
 
 		 572 aa  92  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.239991 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3694  TPR repeat-containing protein  33.54 
 
 		 638 aa  91.7  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.663272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2799  TPR repeat-containing protein  27.6 
 
 		 607 aa  91.7  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414914  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2185  tetratricopeptide TPR_2  27.6 
 
 		 607 aa  91.7  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2810  TPR repeat-containing protein  27.6 
 
 		 607 aa  91.7  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0384  TPR repeat-containing protein  31.09 
 
 		 592 aa  88.6  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.315529  normal  0.0233306 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0856  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.32 
 
 		 563 aa  87.8  6e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000292509  normal  0.491449 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3624  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.27 
 
 		 571 aa  87.8  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  27.41 
 
 		 878 aa  87.4  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1623  outer membrane lipoprotein LolB  35.04 
 
 		 495 aa  87  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.84859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0280  tetratricopeptide TPR_4  25.69 
 
 		 584 aa  87  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3253  TPR domain-containing protein  34.19 
 
 		 591 aa  86.3  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000563369  normal  0.0756352 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0586  hypothetical protein  29.44 
 
 		 573 aa  85.5  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0723  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 564 aa  84.7  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.686717  normal  0.618233 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61720  hypothetical protein  27.55 
 
 		 590 aa  84.3  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.541036  decreased coverage  0.00206868 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04546  tetratricopeptide repeat family  28.46 
 
 		 551 aa  84.3  0.000000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5316  hypothetical protein  28.01 
 
 		 575 aa  84  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.348635  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3607  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 		 584 aa  83.2  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277474 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  27.14 
 
 		 1737 aa  83.6  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1657  tetratricopeptide TPR_4  29.44 
 
 		 587 aa  82.8  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4458  TPR repeat-containing protein  28.77 
 
 		 573 aa  82  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0342  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.6 
 
 		 582 aa  82  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.351016 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2121  TPR repeat-containing protein  33.57 
 
 		 559 aa  81.6  0.00000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.0000963892  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>