140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0219 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0219  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 189 aa  376  1e-103  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0634  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  52.72 
 
 		 186 aa  191  7e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000563815  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  27.45 
 
 		 615 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  27.45 
 
 		 620 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  25.49 
 
 		 620 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  27.63 
 
 		 626 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  28.29 
 
 		 626 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  28.29 
 
 		 626 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  28.29 
 
 		 614 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  28.29 
 
 		 614 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  28.29 
 
 		 614 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  28.29 
 
 		 614 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  32.39 
 
 		 864 aa  64.3  0.0000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  30.61 
 
 		 448 aa  63.5  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  27.63 
 
 		 639 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  26.97 
 
 		 636 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  26.97 
 
 		 612 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 637 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20571  SAM-binding motif-containing protein  27.44 
 
 		 780 aa  58.5  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.183834 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3719  TPR repeat-containing protein  25.67 
 
 		 405 aa  58.2  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  25.68 
 
 		 605 aa  58.2  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  26.78 
 
 		 448 aa  57.4  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 635 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 635 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66638  glucose repression mediator protein  31.58 
 
 		 815 aa  57.4  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 611 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3815  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 399 aa  56.2  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2708  tetratricopeptide TPR_2  24.68 
 
 		 979 aa  56.6  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0927  TPR repeat-containing protein  28.3 
 
 		 291 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2957  TPR repeat-containing protein  26.8 
 
 		 297 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.338311  normal  0.060469 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3556  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 291 aa  53.1  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.276509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0362  TPR repeat-containing protein  26.47 
 
 		 804 aa  53.5  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.587657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  31.68 
 
 		 614 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3161  TPR repeat-containing protein  26.8 
 
 		 297 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  21.94 
 
 		 597 aa  52.4  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  26.05 
 
 		 585 aa  51.2  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.32 
 
 		 810 aa  51.6  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02410  general transcriptional repressor, putative  24.83 
 
 		 1101 aa  51.2  0.000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  25.32 
 
 		 878 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2475  peptidoglycan-binding LysM  24.16 
 
 		 632 aa  50.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00625277  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  26.45 
 
 		 795 aa  49.7  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.5 
 
 		 586 aa  50.1  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  25.3 
 
 		 1069 aa  50.4  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1829  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 		 322 aa  49.7  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.725463  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  26.28 
 
 		 265 aa  49.3  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3268  TPR repeat-containing protein  24.84 
 
 		 441 aa  48.9  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2853  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.84 
 
 		 441 aa  48.9  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0260503 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0699  TPR repeat-containing protein  24.69 
 
 		 563 aa  48.9  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000888687 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4071  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.58 
 
 		 291 aa  48.5  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14411  Flp pilus assembly protein TadD  30 
 
 		 594 aa  48.5  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00033533 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  27.13 
 
 		 3301 aa  48.5  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  25.98 
 
 		 968 aa  48.5  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  27.27 
 
 		 1676 aa  48.5  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5110  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 288 aa  48.1  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  24.84 
 
 		 847 aa  48.1  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.11 
 
 		 265 aa  47.4  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  25.47 
 
 		 827 aa  47.4  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  25.5 
 
 		 1085 aa  47.8  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  27.83 
 
 		 267 aa  46.6  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0712  tetratricopeptide TPR_2  25.46 
 
 		 677 aa  47  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  23.56 
 
 		 3172 aa  47  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  29.06 
 
 		 681 aa  46.2  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  24.85 
 
 		 573 aa  46.2  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0516  TPR repeat-containing protein  30.13 
 
 		 673 aa  45.8  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000776603  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0253  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.25 
 
 		 645 aa  45.8  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16401  hypothetical protein  25.77 
 
 		 779 aa  45.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.659248 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  22.82 
 
 		 2262 aa  45.8  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0689  TPR repeat-containing protein  27.46 
 
 		 632 aa  45.4  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000734837  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3799  TPR repeat-containing protein  26.47 
 
 		 691 aa  45.4  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.487228 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0280  Tetratricopeptide domain protein  31.25 
 
 		 645 aa  45.4  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  27.68 
 
 		 265 aa  45.1  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  26.95 
 
 		 808 aa  45.1  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  21.6 
 
 		 576 aa  45.1  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.16 
 
 		 758 aa  44.7  0.0007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2981  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25 
 
 		 383 aa  45.1  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000586322  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1202  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 		 632 aa  44.7  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0666  protein kinase  25.77 
 
 		 889 aa  44.7  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.415154 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0857  TPR repeat-containing protein  28.76 
 
 		 572 aa  44.7  0.0009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.6877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0840  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 1371 aa  44.3  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0531  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 287 aa  43.9  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.259397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1657  tetratricopeptide TPR_4  27.04 
 
 		 587 aa  43.9  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0003  TPR repeat-containing protein  23.76 
 
 		 466 aa  44.3  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  27.33 
 
 		 1297 aa  44.7  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  27.43 
 
 		 1154 aa  43.9  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2231  TPR repeat-containing protein  23.87 
 
 		 265 aa  43.9  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000660918  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0525  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.15 
 
 		 880 aa  44.3  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1350  TPR repeat-containing protein  27.74 
 
 		 766 aa  43.9  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  30.51 
 
 		 1252 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  27.21 
 
 		 602 aa  43.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1550  TPR repeat-containing protein  27.03 
 
 		 562 aa  43.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.119519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4209  TPR repeat-containing CheR-type MCP methyltransferase  32.43 
 
 		 502 aa  43.5  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.135133  normal  0.0700485 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0447  TPR domain-containing protein  24.14 
 
 		 992 aa  43.1  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000620141  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0309  TPR domain-containing protein  33.08 
 
 		 914 aa  42.7  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  30.1 
 
 		 863 aa  42.7  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.93 
 
 		 632 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1755  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 265 aa  42.7  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000044478  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2825  Methyltransferase type 12  22.02 
 
 		 436 aa  42.7  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  32.61 
 
 		 409 aa  42.7  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3296  TPR repeat-containing protein  36.84 
 
 		 193 aa  42.7  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.173177  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0594  tetratricopeptide TPR_4  28.67 
 
 		 601 aa  43.1  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>