More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4209 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0033  protein-glutamate O-methyltransferase  76.75 
 
 
490 aa  748    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4209  TPR repeat-containing CheR-type MCP methyltransferase  100 
 
 
502 aa  1020    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.135133  normal  0.0700485 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2402  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  46.75 
 
 
477 aa  386  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.168241 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0728  TPR repeat-containing CheR-type MCP methyltransferase  43.56 
 
 
486 aa  351  2e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4168  response regulator receiver protein  32.83 
 
 
622 aa  219  6e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2379  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  32.78 
 
 
614 aa  205  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1839  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  32.92 
 
 
611 aa  189  7e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00242701 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2030  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  32.16 
 
 
481 aa  181  4e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2459  MCP methyltransferase, CheR-type  31.03 
 
 
502 aa  176  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.143998  normal  0.100833 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0640  MCP methyltransferase, CheR-type  32.96 
 
 
500 aa  173  5e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0792  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  28.4 
 
 
527 aa  173  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0649  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  32.96 
 
 
500 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3195  TPR repeat-containing CheR-type MCP methyltransferase  32.47 
 
 
463 aa  171  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.13083 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0223  MCP methyltransferase, CheR-type  33.11 
 
 
492 aa  172  2e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.17897 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0766  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  27.37 
 
 
527 aa  170  4e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2370  protein-glutamate O-methyltransferase  33.33 
 
 
513 aa  169  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.470912  hitchhiker  0.000464427 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0993  protein-glutamate O-methyltransferase  31.9 
 
 
468 aa  167  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0330  MCP methyltransferase, CheR-type  30.66 
 
 
494 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2215  chemotaxis protein methyltransferase CheR  35.94 
 
 
289 aa  164  3e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.171483  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1573  MCP methyltransferase, CheR-type  35.14 
 
 
292 aa  164  5.0000000000000005e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0438911  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0659  protein-glutamate O-methyltransferase  32.84 
 
 
499 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.289083  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2189  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  31.06 
 
 
481 aa  161  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0615  MCP methyltransferase, CheR-type  32.75 
 
 
500 aa  160  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.276071  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3943  MCP methyltransferase, CheR-type  34.77 
 
 
290 aa  160  4e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.331314  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4027  MCP methyltransferase, CheR-type  34.29 
 
 
290 aa  160  5e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000815784 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0295  chemotaxis protein methyltransferase CheR  35.38 
 
 
277 aa  158  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.468009  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2707  MCP methyltransferase, CheR-type  34.18 
 
 
505 aa  157  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2305  MCP methyltransferase, CheR-type  34.04 
 
 
291 aa  155  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0757  MCP methyltransferase, CheR-type  34.06 
 
 
275 aa  155  2e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0777  MCP methyltransferase, CheR-type  34.78 
 
 
297 aa  155  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.152669  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1065  MCP methyltransferase, CheR-type  33.46 
 
 
271 aa  155  2e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0878  MCP methyltransferase, CheR-type  33.58 
 
 
275 aa  155  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1152  protein-glutamate O-methyltransferase  32.4 
 
 
291 aa  154  4e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.14728 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3267  MCP methyltransferase, CheR-type  34.18 
 
 
277 aa  151  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.335431  hitchhiker  0.0000324119 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0778  MCP methyltransferase, CheR-type  33.7 
 
 
292 aa  150  5e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0203537 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2815  MCP methyltransferase, CheR-type  32.97 
 
 
275 aa  150  6e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.904459  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3139  protein-glutamate O-methyltransferase  32.99 
 
 
291 aa  149  8e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4421  protein-glutamate O-methyltransferase  33.09 
 
 
277 aa  149  9e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2820  MCP methyltransferase, CheR-type  34.47 
 
 
277 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.353038  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2689  protein-glutamate O-methyltransferase  36.33 
 
 
283 aa  146  7.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000470829  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2282  MCP methyltransferase, CheR-type  33.33 
 
 
270 aa  146  9e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.977677  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0747  MCP methyltransferase, CheR-type  34.04 
 
 
288 aa  145  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6555  MCP methyltransferase, CheR-type  36.07 
 
 
289 aa  146  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.842137  normal  0.205146 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2118  MCP methyltransferase, CheR-type  34.91 
 
 
283 aa  145  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1379  MCP methyltransferase, CheR-type  31.79 
 
 
553 aa  145  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.991559  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0314  Signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  37.45 
 
 
1399 aa  144  4e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03244  chemotaxis protein methyltransferase CheR  29.52 
 
 
284 aa  144  4e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22590  Protein-glutamate O-methyltransferase  32.85 
 
 
309 aa  143  8e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1772  MCP methyltransferase, CheR-type  30.48 
 
 
299 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30900  MCP methyltransferase, CheR-type  32.97 
 
 
272 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0762  MCP methyltransferase, CheR-type  32.98 
 
 
288 aa  141  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.454256 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4609  MCP methyltransferase, CheR-type  34.18 
 
 
290 aa  140  7e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1011  chemotaxis protein methyltransferase CheR  32.35 
 
 
281 aa  139  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2362  MCP methyltransferase, CheR-type  27.34 
 
 
478 aa  138  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0871  MCP methyltransferase, CheR-type  30.77 
 
 
414 aa  138  3.0000000000000003e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2376  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  33.96 
 
 
1407 aa  137  3.0000000000000003e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2823  MCP methyltransferase, CheR-type  36.07 
 
 
287 aa  137  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.147208  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2325  MCP methyltransferase, CheR-type  30.63 
 
 
276 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0089  MCP methyltransferase, CheR-type  30.22 
 
 
283 aa  136  8e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2231  MCP methyltransferase, CheR-type  29.78 
 
 
279 aa  136  9e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2070  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  29.58 
 
 
431 aa  136  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0814478 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2915  MCP methyltransferase, CheR-type  36.07 
 
 
287 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0347833  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1533  putative chemotaxis protein methyltransferase cheR  35.25 
 
 
292 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280544  normal  0.734911 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1326  MCP methyltransferase, CheR-type  28.5 
 
 
498 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.631295  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1320  MCP methyltransferase, CheR-type  34.22 
 
 
269 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.711153  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2731  MCP methyltransferase, CheR-type  35.71 
 
 
287 aa  134  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.377322  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0527  MCP methyltransferase, CheR-type  33.07 
 
 
289 aa  134  5e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1457  protein-glutamate O-methyltransferase  31.79 
 
 
276 aa  134  5e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2691  protein-glutamate O-methyltransferase  33.56 
 
 
298 aa  134  5e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.286445  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1731  MCP methyltransferase, CheR-type  31.79 
 
 
290 aa  134  5e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1595  MCP methyltransferase, CheR-type  35.41 
 
 
284 aa  133  6.999999999999999e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2618  MCP methyltransferase, CheR-type  35.02 
 
 
292 aa  133  9e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0524  MCP methyltransferase, CheR-type  32.98 
 
 
288 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.39989 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0428  MCP methyltransferase, CheR-type  34 
 
 
275 aa  132  1.0000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.235925  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3256  MCP methyltransferase, CheR-type  28.69 
 
 
488 aa  132  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.941528  normal  0.0154039 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0992  MCP methyltransferase, CheR-type  26.14 
 
 
513 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0110  MCP methyltransferase, CheR-type  33.58 
 
 
288 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1494  protein-glutamate O-methyltransferase  31.63 
 
 
292 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0579  MCP methyltransferase, CheR-type  32.06 
 
 
280 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2162  protein-glutamate O-methyltransferase  33.57 
 
 
272 aa  131  3e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3498  protein-glutamate O-methyltransferase  38.57 
 
 
273 aa  131  3e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2937  MCP methyltransferase, CheR-type  35.23 
 
 
285 aa  130  4.0000000000000003e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.324206  normal  0.583593 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1840  MCP methyltransferase, CheR-type  34.3 
 
 
840 aa  130  6e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.59391  normal  0.603716 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1246  methyltransferase CheR, putative  37.55 
 
 
1378 aa  130  7.000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.271052  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1198  protein-glutamate O-methyltransferase  31.77 
 
 
327 aa  130  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.112441  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3128  MCP methyltransferase, CheR-type  36.79 
 
 
840 aa  130  7.000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1821  MCP methyltransferase, CheR-type  33.46 
 
 
292 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.101872  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1604  MCP methyltransferase, CheR-type  31.73 
 
 
260 aa  129  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0143514  unclonable  1.76137e-23 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1988  Protein-glutamate O-methyltransferase  32.61 
 
 
275 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0407  protein-glutamate O-methyltransferase  35.29 
 
 
286 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0163  MCP methyltransferase, CheR-type  31.25 
 
 
280 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4243  MCP methyltransferase, CheR-type  31.17 
 
 
290 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115502  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0466  protein-glutamate O-methyltransferase  32.25 
 
 
492 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.451123  normal  0.766858 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0322  Protein-glutamate O-methyltransferase  32.58 
 
 
276 aa  128  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.191319  normal  0.294679 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1545  protein-glutamate O-methyltransferase  37 
 
 
264 aa  128  3e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.474689  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0764  MCP methyltransferase, CheR-type  33.09 
 
 
286 aa  128  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.872365  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2001  MCP methyltransferase, CheR-type  31 
 
 
276 aa  127  3e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.349462  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0730  MCP methyltransferase, CheR-type  31.09 
 
 
300 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0443063  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5176  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  37.24 
 
 
1404 aa  127  5e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.190634 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0892  MCP methyltransferase, CheR-type  33.57 
 
 
275 aa  127  6e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.763334  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>