More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0747 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_0747  MCP methyltransferase, CheR-type  100 
 
 
288 aa  594  1e-169  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0762  MCP methyltransferase, CheR-type  96.88 
 
 
288 aa  555  1e-157  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.454256 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2215  chemotaxis protein methyltransferase CheR  72.89 
 
 
289 aa  447  1e-125  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.171483  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3139  protein-glutamate O-methyltransferase  73.59 
 
 
291 aa  448  1e-125  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2305  MCP methyltransferase, CheR-type  69.82 
 
 
291 aa  432  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2118  MCP methyltransferase, CheR-type  62.54 
 
 
283 aa  377  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1379  MCP methyltransferase, CheR-type  42.5 
 
 
553 aa  253  3e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.991559  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2731  MCP methyltransferase, CheR-type  47.14 
 
 
287 aa  251  9.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.377322  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2823  MCP methyltransferase, CheR-type  47.16 
 
 
287 aa  249  3e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.147208  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2915  MCP methyltransferase, CheR-type  47.16 
 
 
287 aa  249  3e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0347833  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1573  MCP methyltransferase, CheR-type  41.52 
 
 
292 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0438911  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1152  protein-glutamate O-methyltransferase  42.6 
 
 
291 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.14728 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0778  MCP methyltransferase, CheR-type  41.88 
 
 
292 aa  235  5.0000000000000005e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0203537 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0579  MCP methyltransferase, CheR-type  41.94 
 
 
280 aa  235  6e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1457  protein-glutamate O-methyltransferase  40.36 
 
 
276 aa  224  1e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0295  chemotaxis protein methyltransferase CheR  40.43 
 
 
277 aa  223  2e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.468009  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4027  MCP methyltransferase, CheR-type  40.36 
 
 
290 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000815784 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3943  MCP methyltransferase, CheR-type  40.36 
 
 
290 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.331314  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4421  protein-glutamate O-methyltransferase  39.35 
 
 
277 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2815  MCP methyltransferase, CheR-type  40.22 
 
 
275 aa  217  2e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.904459  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0878  MCP methyltransferase, CheR-type  39.49 
 
 
275 aa  216  4e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3267  MCP methyltransferase, CheR-type  39.71 
 
 
277 aa  215  5.9999999999999996e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.335431  hitchhiker  0.0000324119 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1198  protein-glutamate O-methyltransferase  40.15 
 
 
327 aa  212  4.9999999999999996e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.112441  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1011  chemotaxis protein methyltransferase CheR  37.32 
 
 
281 aa  210  2e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4609  MCP methyltransferase, CheR-type  37.14 
 
 
290 aa  208  6e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2325  MCP methyltransferase, CheR-type  36.59 
 
 
276 aa  205  7e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2689  protein-glutamate O-methyltransferase  40.44 
 
 
283 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000470829  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2820  MCP methyltransferase, CheR-type  39.02 
 
 
277 aa  199  5e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.353038  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0777  MCP methyltransferase, CheR-type  36.9 
 
 
297 aa  199  5e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.152669  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03244  chemotaxis protein methyltransferase CheR  35.16 
 
 
284 aa  196  3e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2282  MCP methyltransferase, CheR-type  38.64 
 
 
270 aa  196  5.000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.977677  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4168  response regulator receiver protein  40.49 
 
 
622 aa  193  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1772  MCP methyltransferase, CheR-type  35.71 
 
 
299 aa  193  3e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0764  MCP methyltransferase, CheR-type  34.29 
 
 
286 aa  187  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.872365  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1065  MCP methyltransferase, CheR-type  36.73 
 
 
271 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3302  MCP methyltransferase, CheR-type  35.38 
 
 
274 aa  183  3e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.905154 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2362  MCP methyltransferase, CheR-type  36.69 
 
 
478 aa  181  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3204  MCP methyltransferase, CheR-type  37.46 
 
 
285 aa  179  4.999999999999999e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.25041  normal  0.841939 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3855  MCP methyltransferase, CheR-type  34.74 
 
 
291 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.763244 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1494  protein-glutamate O-methyltransferase  36.68 
 
 
292 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2937  MCP methyltransferase, CheR-type  35.32 
 
 
285 aa  177  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.324206  normal  0.583593 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0993  protein-glutamate O-methyltransferase  35.27 
 
 
468 aa  177  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6555  MCP methyltransferase, CheR-type  37.07 
 
 
289 aa  176  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.842137  normal  0.205146 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4669  MCP methyltransferase, CheR-type  37.82 
 
 
283 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.225745  normal  0.563767 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22590  Protein-glutamate O-methyltransferase  35.4 
 
 
309 aa  176  4e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0871  MCP methyltransferase, CheR-type  34.84 
 
 
414 aa  176  5e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0647  chemotaxis protein methyltransferase  36.86 
 
 
271 aa  175  7e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.63831  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1731  MCP methyltransferase, CheR-type  35.79 
 
 
290 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3801  MCP methyltransferase, CheR-type  35.14 
 
 
294 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1874  MCP methyltransferase, CheR-type  35.91 
 
 
291 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0589357  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2051  MCP methyltransferase, CheR-type  33.45 
 
 
299 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.156898  hitchhiker  0.000266106 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0757  MCP methyltransferase, CheR-type  33.96 
 
 
275 aa  172  7.999999999999999e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1382  MCP methyltransferase, CheR-type  39.02 
 
 
303 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4243  MCP methyltransferase, CheR-type  34.36 
 
 
290 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115502  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0527  MCP methyltransferase, CheR-type  33.98 
 
 
289 aa  170  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1143  chemotaxis protein methyltransferase CheR  35.61 
 
 
292 aa  169  4e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0207024  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1849  Protein-glutamate O-methyltransferase  35.74 
 
 
291 aa  169  4e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.313486  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0183  protein-glutamate O-methyltransferase  34.62 
 
 
280 aa  169  6e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0625  MCP methyltransferase, CheR-type  34.96 
 
 
290 aa  169  6e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1533  putative chemotaxis protein methyltransferase cheR  34.23 
 
 
292 aa  168  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280544  normal  0.734911 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0635  MCP methyltransferase, CheR-type  36.84 
 
 
301 aa  167  1e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1539  protein-glutamate O-methyltransferase  32.27 
 
 
291 aa  167  1e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1988  Protein-glutamate O-methyltransferase  36.69 
 
 
275 aa  168  1e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3498  protein-glutamate O-methyltransferase  36.43 
 
 
273 aa  168  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0163  MCP methyltransferase, CheR-type  34.62 
 
 
280 aa  167  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2231  MCP methyltransferase, CheR-type  34.07 
 
 
279 aa  167  2e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004174  chemotaxis protein methyltransferase CheR  33.82 
 
 
275 aa  167  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3195  TPR repeat-containing CheR-type MCP methyltransferase  34.18 
 
 
463 aa  166  4e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.13083 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3674  protein-glutamate O-methyltransferase  34.75 
 
 
292 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1595  MCP methyltransferase, CheR-type  33.46 
 
 
284 aa  166  5e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2618  MCP methyltransferase, CheR-type  33.46 
 
 
292 aa  165  5.9999999999999996e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0626  MCP methyltransferase, CheR-type  36.47 
 
 
301 aa  166  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.325159  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0904  MCP methyltransferase, CheR-type  37.59 
 
 
267 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0110  MCP methyltransferase, CheR-type  34.34 
 
 
288 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1330  protein-glutamate O-methyltransferase  34.25 
 
 
270 aa  165  8e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1821  MCP methyltransferase, CheR-type  32.73 
 
 
292 aa  165  8e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.101872  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6731  MCP methyltransferase, CheR-type  37.31 
 
 
273 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.079631  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2379  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  34.75 
 
 
614 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1199  methylase of chemotaxis methyl-accepting protein, CheR-like  36.96 
 
 
291 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3299  protein-glutamate O-methyltransferase  35.14 
 
 
275 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01283  chemotaxis methyltransferase CheR  33.45 
 
 
275 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0645  protein-glutamate O-methyltransferase  35.34 
 
 
302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0464454  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3916  MCP methyltransferase, CheR-type  33.33 
 
 
289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.186094  normal  0.509616 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1146  MCP methyltransferase, CheR-type  38.13 
 
 
270 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.492811  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1610  MCP methyltransferase, CheR-type  34.23 
 
 
274 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2571  MCP methyltransferase, CheR-type  37.64 
 
 
303 aa  162  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0614  MCP methyltransferase, CheR-type  34.87 
 
 
275 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0483798 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2105  MCP methyltransferase, CheR-type  31.76 
 
 
283 aa  162  7e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0808  MCP methyltransferase, CheR-type  35.29 
 
 
272 aa  162  7e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0783  protein-glutamate O-methyltransferase  37.11 
 
 
269 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.827996  normal  0.901412 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1533  protein-glutamate O-methyltransferase  31.91 
 
 
285 aa  161  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0781767 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2475  MCP methyltransferase, CheR-type  37.26 
 
 
303 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0126751  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0141  MCP methyltransferase, CheR-type  36.29 
 
 
280 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0351158  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30900  MCP methyltransferase, CheR-type  33.82 
 
 
272 aa  161  1e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1813  MCP methyltransferase, CheR-type  31.91 
 
 
285 aa  161  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178161  normal  0.138477 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0428  MCP methyltransferase, CheR-type  35.14 
 
 
275 aa  161  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.235925  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2189  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  34.36 
 
 
481 aa  160  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7834  MCP methyltransferase, CheR-type  36.78 
 
 
275 aa  160  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3104  MCP methyltransferase, CheR-type  32.62 
 
 
285 aa  160  3e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.575775  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1320  MCP methyltransferase, CheR-type  36.58 
 
 
269 aa  159  3e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.711153  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>