More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2001 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_2001  MCP methyltransferase, CheR-type  100 
 
 
276 aa  572  1.0000000000000001e-162  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.349462  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30900  MCP methyltransferase, CheR-type  66.3 
 
 
272 aa  374  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5002  MCP methyltransferase, CheR-type  56.68 
 
 
274 aa  301  1e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0322  Protein-glutamate O-methyltransferase  55.07 
 
 
276 aa  290  2e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.191319  normal  0.294679 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3598  MCP methyltransferase, CheR-type  54.91 
 
 
278 aa  290  2e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0123942  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2320  MCP methyltransferase, CheR-type  49.82 
 
 
291 aa  275  8e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1788  MCP methyltransferase, CheR-type  50.92 
 
 
316 aa  262  4e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.275448  normal  0.703081 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1529  MCP methyltransferase, CheR-type  43.38 
 
 
273 aa  229  3e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3801  MCP methyltransferase, CheR-type  45.15 
 
 
294 aa  228  8e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0527  MCP methyltransferase, CheR-type  45.14 
 
 
289 aa  228  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1494  protein-glutamate O-methyltransferase  43.8 
 
 
292 aa  226  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6555  MCP methyltransferase, CheR-type  45.35 
 
 
289 aa  223  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.842137  normal  0.205146 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1874  MCP methyltransferase, CheR-type  44.03 
 
 
291 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0589357  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3855  MCP methyltransferase, CheR-type  43.43 
 
 
291 aa  223  4e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.763244 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4243  MCP methyltransferase, CheR-type  44.98 
 
 
290 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115502  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4228  MCP methyltransferase, CheR-type  40.81 
 
 
274 aa  219  3.9999999999999997e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1533  putative chemotaxis protein methyltransferase cheR  43.23 
 
 
292 aa  216  4e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280544  normal  0.734911 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4031  MCP methyltransferase, CheR-type  45.31 
 
 
287 aa  215  5e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.236096  normal  0.66198 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4834  MCP methyltransferase, CheR-type  43.63 
 
 
296 aa  215  7e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.162738  hitchhiker  0.00821783 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1912  Protein-glutamate O-methyltransferase  42.44 
 
 
278 aa  213  1.9999999999999998e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0842494  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3674  protein-glutamate O-methyltransferase  42.28 
 
 
292 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3372  MCP methyltransferase, CheR-type  44.75 
 
 
288 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491763  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0662  MCP methyltransferase, CheR-type  43.45 
 
 
278 aa  212  7e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.893478 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1821  MCP methyltransferase, CheR-type  46.06 
 
 
292 aa  211  9e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.101872  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1695  MCP methyltransferase, CheR-type  42.18 
 
 
289 aa  211  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34246  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0524  MCP methyltransferase, CheR-type  44.23 
 
 
288 aa  209  5e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.39989 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1710  MCP methyltransferase, CheR-type  44.36 
 
 
285 aa  208  1e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151818  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1533  protein-glutamate O-methyltransferase  43.97 
 
 
285 aa  207  1e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0781767 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3916  MCP methyltransferase, CheR-type  41.7 
 
 
289 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.186094  normal  0.509616 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1813  MCP methyltransferase, CheR-type  43.97 
 
 
285 aa  207  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178161  normal  0.138477 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3733  MCP methyltransferase, CheR-type  40.86 
 
 
275 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0499524  normal  0.833336 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0524  MCP methyltransferase, CheR-type  39.34 
 
 
280 aa  199  3e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3953  MCP methyltransferase, CheR-type  40.78 
 
 
275 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4392  chemotaxis protein methyltransferase CheR  40.43 
 
 
275 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1462  protein-glutamate O-methyltransferase  40.43 
 
 
275 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20760  putative chemotaxis protein methyltransferase  41.01 
 
 
274 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1782  putative chemotaxis protein methyltransferase  40.65 
 
 
274 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2851  MCP methyltransferase, CheR-type  39.85 
 
 
282 aa  196  3e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.188729 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4252  MCP methyltransferase, CheR-type  40.07 
 
 
275 aa  195  7e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1928  chemotaxis protein methyltransferase CheR  40.44 
 
 
280 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.495072  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3485  protein-glutamate O-methyltransferase  40.44 
 
 
280 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.405571  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1177  protein-glutamate O-methyltransferase  39.34 
 
 
275 aa  192  4e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0805405  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1069  protein-glutamate O-methyltransferase  40.62 
 
 
278 aa  191  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0178115  normal  0.0152511 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3582  MCP methyltransferase, CheR-type  34.64 
 
 
302 aa  189  4e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1216  MCP methyltransferase, CheR-type  39.2 
 
 
275 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.189092  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0521  protein-glutamate O-methyltransferase  36.96 
 
 
275 aa  181  1e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.644079  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004174  chemotaxis protein methyltransferase CheR  35.53 
 
 
275 aa  178  7e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0871  MCP methyltransferase, CheR-type  37.23 
 
 
414 aa  177  1e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1430  MCP methyltransferase, CheR-type  38.46 
 
 
267 aa  176  4e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01283  chemotaxis methyltransferase CheR  34.8 
 
 
275 aa  175  8e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2214  MCP methyltransferase, CheR-type  36.25 
 
 
285 aa  174  9e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1476  chemotaxis protein methyltransferase CheR  34.56 
 
 
276 aa  174  9.999999999999999e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2339  chemotaxis protein methyltransferase CheR  35.38 
 
 
275 aa  173  1.9999999999999998e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0163  MCP methyltransferase, CheR-type  40.82 
 
 
280 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0925  MCP methyltransferase, CheR-type  41.2 
 
 
271 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0892  MCP methyltransferase, CheR-type  37.89 
 
 
275 aa  172  3.9999999999999995e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.763334  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1793  chemotaxis protein methyltransferase CheR  34.43 
 
 
275 aa  172  6.999999999999999e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0095  MCP methyltransferase, CheR-type  40.39 
 
 
275 aa  169  5e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0183  protein-glutamate O-methyltransferase  37.93 
 
 
280 aa  167  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02929  chemotaxis protein methyltransferase CheR  36.4 
 
 
276 aa  167  2.9999999999999998e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.723494  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1344  MCP methyltransferase, CheR-type  33.94 
 
 
277 aa  166  4e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.841955  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3088  protein-glutamate O-methyltransferase  34.53 
 
 
277 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1596  MCP methyltransferase, CheR-type  33.33 
 
 
277 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.935025  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2319  protein-glutamate O-methyltransferase  34.43 
 
 
277 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.945432  normal  0.235837 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1339  MCP methyltransferase, CheR-type  34.3 
 
 
277 aa  162  6e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3101  MCP methyltransferase, CheR-type  34.91 
 
 
278 aa  160  3e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0448745  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1160  MCP methyltransferase, CheR-type  33.21 
 
 
277 aa  160  3e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0215  MCP methyltransferase, CheR-type  37.55 
 
 
294 aa  159  4e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.177352  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0777  MCP methyltransferase, CheR-type  34.3 
 
 
297 aa  158  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.152669  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1258  MCP methyltransferase, CheR-type  33.94 
 
 
279 aa  158  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1328  MCP methyltransferase, CheR-type  33.94 
 
 
279 aa  158  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1320  MCP methyltransferase, CheR-type  33.94 
 
 
279 aa  158  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2963  protein-glutamate O-methyltransferase  34.05 
 
 
279 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.643676  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1415  MCP methyltransferase, CheR-type  34.05 
 
 
279 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2948  protein-glutamate O-methyltransferase  34.05 
 
 
279 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3101  protein-glutamate O-methyltransferase  34.05 
 
 
279 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3299  protein-glutamate O-methyltransferase  34.78 
 
 
275 aa  157  2e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2598  protein-glutamate O-methyltransferase  34.05 
 
 
279 aa  156  3e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1302  protein-glutamate O-methyltransferase  34.06 
 
 
279 aa  156  3e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3251  chemotaxis protein methyltransferase CheR  33.69 
 
 
279 aa  156  4e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0110  MCP methyltransferase, CheR-type  37.13 
 
 
288 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3498  protein-glutamate O-methyltransferase  35.38 
 
 
273 aa  153  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3139  protein-glutamate O-methyltransferase  32.37 
 
 
291 aa  150  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0987  MCP methyltransferase, CheR-type  32.62 
 
 
283 aa  150  3e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0428  MCP methyltransferase, CheR-type  35.25 
 
 
275 aa  149  4e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.235925  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1539  protein-glutamate O-methyltransferase  33.72 
 
 
291 aa  149  6e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2815  MCP methyltransferase, CheR-type  31.52 
 
 
275 aa  148  9e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.904459  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0647  chemotaxis protein methyltransferase  32.97 
 
 
271 aa  148  1.0000000000000001e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.63831  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0069  MCP methyltransferase, CheR-type  33.98 
 
 
280 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2305  MCP methyltransferase, CheR-type  32.13 
 
 
291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1604  MCP methyltransferase, CheR-type  33.6 
 
 
260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0143514  unclonable  1.76137e-23 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0661  MCP methyltransferase, CheR-type  35.94 
 
 
271 aa  146  3e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2118  MCP methyltransferase, CheR-type  34.04 
 
 
283 aa  146  3e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1320  MCP methyltransferase, CheR-type  36.64 
 
 
269 aa  147  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.711153  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03244  chemotaxis protein methyltransferase CheR  31.3 
 
 
284 aa  145  8.000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1849  Protein-glutamate O-methyltransferase  34.06 
 
 
291 aa  144  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.313486  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4027  MCP methyltransferase, CheR-type  31.07 
 
 
290 aa  144  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000815784 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1736  MCP methyltransferase, CheR-type  29.07 
 
 
290 aa  144  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0460074 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3546  MCP methyltransferase, CheR-type  34.7 
 
 
267 aa  144  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.203132  normal  0.882443 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2820  MCP methyltransferase, CheR-type  36.53 
 
 
277 aa  143  3e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.353038  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>