More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3943 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_3943  MCP methyltransferase, CheR-type  100 
 
 
290 aa  605  9.999999999999999e-173  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.331314  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4027  MCP methyltransferase, CheR-type  98.97 
 
 
290 aa  601  1.0000000000000001e-171  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000815784 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4421  protein-glutamate O-methyltransferase  81.16 
 
 
277 aa  488  1e-137  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0295  chemotaxis protein methyltransferase CheR  78.26 
 
 
277 aa  464  9.999999999999999e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.468009  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0878  MCP methyltransferase, CheR-type  76.73 
 
 
275 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2815  MCP methyltransferase, CheR-type  77.45 
 
 
275 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.904459  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3267  MCP methyltransferase, CheR-type  76.36 
 
 
277 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.335431  hitchhiker  0.0000324119 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1152  protein-glutamate O-methyltransferase  42.07 
 
 
291 aa  255  6e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.14728 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1573  MCP methyltransferase, CheR-type  42.11 
 
 
292 aa  250  2e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0438911  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2118  MCP methyltransferase, CheR-type  44.93 
 
 
283 aa  246  3e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1379  MCP methyltransferase, CheR-type  42.03 
 
 
553 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.991559  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3139  protein-glutamate O-methyltransferase  42.55 
 
 
291 aa  239  4e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0778  MCP methyltransferase, CheR-type  41.43 
 
 
292 aa  237  2e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0203537 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0579  MCP methyltransferase, CheR-type  43.48 
 
 
280 aa  236  4e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2215  chemotaxis protein methyltransferase CheR  41.45 
 
 
289 aa  228  9e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.171483  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2305  MCP methyltransferase, CheR-type  41.09 
 
 
291 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0777  MCP methyltransferase, CheR-type  42.46 
 
 
297 aa  224  1e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.152669  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1198  protein-glutamate O-methyltransferase  37.85 
 
 
327 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.112441  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0762  MCP methyltransferase, CheR-type  40 
 
 
288 aa  209  5e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.454256 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0747  MCP methyltransferase, CheR-type  40.36 
 
 
288 aa  208  1e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1457  protein-glutamate O-methyltransferase  36.96 
 
 
276 aa  198  7.999999999999999e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1065  MCP methyltransferase, CheR-type  41.3 
 
 
271 aa  193  2e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03244  chemotaxis protein methyltransferase CheR  37.86 
 
 
284 aa  189  2.9999999999999997e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1330  protein-glutamate O-methyltransferase  37.22 
 
 
270 aa  188  1e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1011  chemotaxis protein methyltransferase CheR  37.32 
 
 
281 aa  187  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4609  MCP methyltransferase, CheR-type  33.92 
 
 
290 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3299  protein-glutamate O-methyltransferase  37.69 
 
 
275 aa  178  8e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1782  putative chemotaxis protein methyltransferase  36.03 
 
 
274 aa  177  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20760  putative chemotaxis protein methyltransferase  35.66 
 
 
274 aa  177  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2851  MCP methyltransferase, CheR-type  35.66 
 
 
282 aa  177  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.188729 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1772  MCP methyltransferase, CheR-type  33.89 
 
 
299 aa  175  7e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3302  MCP methyltransferase, CheR-type  33.09 
 
 
274 aa  174  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.905154 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0635  MCP methyltransferase, CheR-type  36.06 
 
 
301 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1143  chemotaxis protein methyltransferase CheR  36.03 
 
 
292 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0207024  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4392  chemotaxis protein methyltransferase CheR  35.16 
 
 
275 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1462  protein-glutamate O-methyltransferase  35.16 
 
 
275 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3953  MCP methyltransferase, CheR-type  35.16 
 
 
275 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4252  MCP methyltransferase, CheR-type  35.4 
 
 
275 aa  172  5e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0626  MCP methyltransferase, CheR-type  35.69 
 
 
301 aa  172  5e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.325159  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3733  MCP methyltransferase, CheR-type  35.16 
 
 
275 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0499524  normal  0.833336 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1382  MCP methyltransferase, CheR-type  36.63 
 
 
303 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1415  MCP methyltransferase, CheR-type  34.32 
 
 
281 aa  171  1e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.299383  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2475  MCP methyltransferase, CheR-type  36.16 
 
 
303 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0126751  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22590  Protein-glutamate O-methyltransferase  36.12 
 
 
309 aa  170  3e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0645  protein-glutamate O-methyltransferase  34.55 
 
 
302 aa  170  3e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0464454  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2571  MCP methyltransferase, CheR-type  36.16 
 
 
303 aa  168  8e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0040  CheR methyltransferase, SAM binding domain protein  36.58 
 
 
283 aa  168  9e-41  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01283  chemotaxis methyltransferase CheR  35.82 
 
 
275 aa  168  9e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0647  chemotaxis protein methyltransferase  36.12 
 
 
271 aa  167  1e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.63831  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0033  protein-glutamate O-methyltransferase  34.3 
 
 
490 aa  167  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1595  MCP methyltransferase, CheR-type  36.43 
 
 
284 aa  167  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1199  methylase of chemotaxis methyl-accepting protein, CheR-like  36.64 
 
 
291 aa  167  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1988  Protein-glutamate O-methyltransferase  38.35 
 
 
275 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2420  MCP methyltransferase, CheR-type  36.33 
 
 
289 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.503139  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1494  protein-glutamate O-methyltransferase  35.79 
 
 
292 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2618  MCP methyltransferase, CheR-type  36.06 
 
 
292 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0601  MCP methyltransferase, CheR-type  34.57 
 
 
299 aa  166  4e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1539  protein-glutamate O-methyltransferase  34.31 
 
 
291 aa  166  5e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2325  MCP methyltransferase, CheR-type  33.82 
 
 
276 aa  165  8e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004174  chemotaxis protein methyltransferase CheR  35.11 
 
 
275 aa  165  8e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0764  MCP methyltransferase, CheR-type  32.04 
 
 
286 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.872365  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0110  MCP methyltransferase, CheR-type  33.71 
 
 
288 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3485  protein-glutamate O-methyltransferase  36.23 
 
 
280 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.405571  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2339  chemotaxis protein methyltransferase CheR  35.74 
 
 
275 aa  164  2.0000000000000002e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1529  MCP methyltransferase, CheR-type  34.7 
 
 
273 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2689  protein-glutamate O-methyltransferase  33.57 
 
 
283 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000470829  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0993  protein-glutamate O-methyltransferase  33.09 
 
 
468 aa  163  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1793  chemotaxis protein methyltransferase CheR  35.46 
 
 
275 aa  163  3e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1928  chemotaxis protein methyltransferase CheR  36.23 
 
 
280 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.495072  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0625  MCP methyltransferase, CheR-type  33.97 
 
 
290 aa  162  4.0000000000000004e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1216  MCP methyltransferase, CheR-type  34.86 
 
 
275 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.189092  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2820  MCP methyltransferase, CheR-type  36.76 
 
 
277 aa  162  5.0000000000000005e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.353038  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0783  protein-glutamate O-methyltransferase  36.67 
 
 
269 aa  162  6e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.827996  normal  0.901412 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1821  MCP methyltransferase, CheR-type  34.53 
 
 
292 aa  162  6e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.101872  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2731  MCP methyltransferase, CheR-type  32.03 
 
 
287 aa  162  7e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.377322  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0871  MCP methyltransferase, CheR-type  33.11 
 
 
414 aa  161  1e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0614  MCP methyltransferase, CheR-type  36.03 
 
 
275 aa  161  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0483798 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0183  protein-glutamate O-methyltransferase  34.29 
 
 
280 aa  160  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1874  MCP methyltransferase, CheR-type  35.38 
 
 
291 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0589357  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2823  MCP methyltransferase, CheR-type  32.49 
 
 
287 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.147208  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4209  TPR repeat-containing CheR-type MCP methyltransferase  34.77 
 
 
502 aa  160  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.135133  normal  0.0700485 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0163  MCP methyltransferase, CheR-type  36.36 
 
 
280 aa  160  3e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2915  MCP methyltransferase, CheR-type  32.13 
 
 
287 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0347833  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3855  MCP methyltransferase, CheR-type  34.32 
 
 
291 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.763244 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2282  MCP methyltransferase, CheR-type  36.03 
 
 
270 aa  160  3e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.977677  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1320  MCP methyltransferase, CheR-type  33.83 
 
 
269 aa  159  6e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.711153  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0910  chemotaxis protein methyltransferase CheR  35.82 
 
 
269 aa  158  8e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4243  MCP methyltransferase, CheR-type  35.21 
 
 
290 aa  158  8e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115502  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1177  protein-glutamate O-methyltransferase  32.5 
 
 
275 aa  158  9e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0805405  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2105  MCP methyltransferase, CheR-type  34.96 
 
 
283 aa  158  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3916  MCP methyltransferase, CheR-type  35.38 
 
 
289 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.186094  normal  0.509616 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0527  MCP methyltransferase, CheR-type  32.71 
 
 
289 aa  157  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0975  MCP methyltransferase, CheR-type  35.82 
 
 
281 aa  157  2e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2984  protein-glutamate O-methyltransferase  34.94 
 
 
285 aa  157  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2691  protein-glutamate O-methyltransferase  33.78 
 
 
298 aa  157  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.286445  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2146  MCP methyltransferase, CheR-type  34.83 
 
 
271 aa  157  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4168  response regulator receiver protein  36.43 
 
 
622 aa  156  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1813  MCP methyltransferase, CheR-type  33.46 
 
 
285 aa  157  3e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178161  normal  0.138477 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1731  MCP methyltransferase, CheR-type  33.33 
 
 
290 aa  156  3e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1533  protein-glutamate O-methyltransferase  33.46 
 
 
285 aa  157  3e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0781767 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>