More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4252 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4252  MCP methyltransferase, CheR-type  100 
 
 		 275 aa  570  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3485  protein-glutamate O-methyltransferase  93.09 
 
 		 280 aa  531  1e-150  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.405571  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4392  chemotaxis protein methyltransferase CheR  90.91 
 
 		 275 aa  528  1e-149  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1928  chemotaxis protein methyltransferase CheR  92 
 
 		 280 aa  527  1e-149  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.495072  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1462  protein-glutamate O-methyltransferase  90.91 
 
 		 275 aa  528  1e-149  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3733  MCP methyltransferase, CheR-type  90.55 
 
 		 275 aa  525  1e-148  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0499524  normal  0.833336 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3953  MCP methyltransferase, CheR-type  90.18 
 
 		 275 aa  525  1e-148  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2851  MCP methyltransferase, CheR-type  88.36 
 
 		 282 aa  513  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.188729 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20760  putative chemotaxis protein methyltransferase  85.09 
 
 		 274 aa  487  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1782  putative chemotaxis protein methyltransferase  84.36 
 
 		 274 aa  485  1e-136  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1177  protein-glutamate O-methyltransferase  59.85 
 
 		 275 aa  341  9e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0805405  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1069  protein-glutamate O-methyltransferase  57.89 
 
 		 278 aa  324  8.000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0178115  normal  0.0152511 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2214  MCP methyltransferase, CheR-type  53.73 
 
 		 285 aa  313  2.9999999999999996e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1216  MCP methyltransferase, CheR-type  54.28 
 
 		 275 aa  311  5.999999999999999e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.189092  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1476  chemotaxis protein methyltransferase CheR  54.12 
 
 		 276 aa  308  4e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1344  MCP methyltransferase, CheR-type  54.38 
 
 		 277 aa  306  3e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.841955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1596  MCP methyltransferase, CheR-type  55.11 
 
 		 277 aa  302  4.0000000000000003e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.935025  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3251  chemotaxis protein methyltransferase CheR  55.11 
 
 		 279 aa  300  1e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1258  MCP methyltransferase, CheR-type  54.74 
 
 		 279 aa  300  2e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1328  MCP methyltransferase, CheR-type  54.74 
 
 		 279 aa  300  2e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1160  MCP methyltransferase, CheR-type  54.38 
 
 		 277 aa  300  2e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1320  MCP methyltransferase, CheR-type  54.74 
 
 		 279 aa  300  2e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2319  protein-glutamate O-methyltransferase  54.74 
 
 		 277 aa  300  2e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.945432  normal  0.235837 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3088  protein-glutamate O-methyltransferase  55.02 
 
 		 277 aa  299  3e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2598  protein-glutamate O-methyltransferase  54.38 
 
 		 279 aa  298  6e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2963  protein-glutamate O-methyltransferase  54.01 
 
 		 279 aa  297  1e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.643676  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2948  protein-glutamate O-methyltransferase  54.01 
 
 		 279 aa  297  1e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3101  protein-glutamate O-methyltransferase  54.01 
 
 		 279 aa  297  1e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1415  MCP methyltransferase, CheR-type  54.01 
 
 		 279 aa  297  1e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1302  protein-glutamate O-methyltransferase  54.65 
 
 		 279 aa  296  4e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1339  MCP methyltransferase, CheR-type  53.9 
 
 		 277 aa  295  7e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02929  chemotaxis protein methyltransferase CheR  54.1 
 
 		 276 aa  294  8e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.723494  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01283  chemotaxis methyltransferase CheR  53.09 
 
 		 275 aa  293  2e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004174  chemotaxis protein methyltransferase CheR  53.09 
 
 		 275 aa  292  5e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1793  chemotaxis protein methyltransferase CheR  52 
 
 		 275 aa  287  1e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0521  protein-glutamate O-methyltransferase  48 
 
 		 275 aa  280  2e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.644079  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2339  chemotaxis protein methyltransferase CheR  52.04 
 
 		 275 aa  275  7e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0892  MCP methyltransferase, CheR-type  46.82 
 
 		 275 aa  270  2e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.763334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3101  MCP methyltransferase, CheR-type  45.16 
 
 		 278 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0448745  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0925  MCP methyltransferase, CheR-type  46.47 
 
 		 271 aa  249  3e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1430  MCP methyltransferase, CheR-type  47.33 
 
 		 267 aa  235  5.0000000000000005e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3582  MCP methyltransferase, CheR-type  43.7 
 
 		 302 aa  220  1.9999999999999999e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1494  protein-glutamate O-methyltransferase  44.78 
 
 		 292 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3801  MCP methyltransferase, CheR-type  42.86 
 
 		 294 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4031  MCP methyltransferase, CheR-type  43.75 
 
 		 287 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.236096  normal  0.66198 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3855  MCP methyltransferase, CheR-type  42.48 
 
 		 291 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.763244 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1874  MCP methyltransferase, CheR-type  43.61 
 
 		 291 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0589357  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6555  MCP methyltransferase, CheR-type  44.85 
 
 		 289 aa  209  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.842137  normal  0.205146 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1533  protein-glutamate O-methyltransferase  44.88 
 
 		 285 aa  208  7e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0781767 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1813  MCP methyltransferase, CheR-type  44.88 
 
 		 285 aa  208  7e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178161  normal  0.138477 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30900  MCP methyltransferase, CheR-type  44.14 
 
 		 272 aa  206  2e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3598  MCP methyltransferase, CheR-type  40 
 
 		 278 aa  207  2e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0123942  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0527  MCP methyltransferase, CheR-type  43.19 
 
 		 289 aa  206  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1710  MCP methyltransferase, CheR-type  44.09 
 
 		 285 aa  204  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3372  MCP methyltransferase, CheR-type  42.64 
 
 		 288 aa  202  4e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491763  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2320  MCP methyltransferase, CheR-type  39.78 
 
 		 291 aa  201  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1788  MCP methyltransferase, CheR-type  39.13 
 
 		 316 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.275448  normal  0.703081 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0871  MCP methyltransferase, CheR-type  39.15 
 
 		 414 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1529  MCP methyltransferase, CheR-type  40.59 
 
 		 273 aa  200  1.9999999999999998e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0662  MCP methyltransferase, CheR-type  41.96 
 
 		 278 aa  200  1.9999999999999998e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.893478 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1821  MCP methyltransferase, CheR-type  43.02 
 
 		 292 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.101872  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1533  putative chemotaxis protein methyltransferase cheR  41.13 
 
 		 292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280544  normal  0.734911 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4228  MCP methyltransferase, CheR-type  37.55 
 
 		 274 aa  196  3e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4834  MCP methyltransferase, CheR-type  42.13 
 
 		 296 aa  196  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.162738  hitchhiker  0.00821783 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2001  MCP methyltransferase, CheR-type  40.07 
 
 		 276 aa  195  7e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.349462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3916  MCP methyltransferase, CheR-type  41.73 
 
 		 289 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.186094  normal  0.509616 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0524  MCP methyltransferase, CheR-type  41.47 
 
 		 288 aa  193  2e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.39989 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3674  protein-glutamate O-methyltransferase  41.47 
 
 		 292 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0322  Protein-glutamate O-methyltransferase  40.39 
 
 		 276 aa  193  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.191319  normal  0.294679 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5002  MCP methyltransferase, CheR-type  37.36 
 
 		 274 aa  192  7e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4243  MCP methyltransferase, CheR-type  41.44 
 
 		 290 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115502  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1912  Protein-glutamate O-methyltransferase  39.78 
 
 		 278 aa  189  4e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0842494  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1695  MCP methyltransferase, CheR-type  40.94 
 
 		 289 aa  188  9e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34246  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0524  MCP methyltransferase, CheR-type  37.04 
 
 		 280 aa  180  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4027  MCP methyltransferase, CheR-type  36.13 
 
 		 290 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000815784 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3943  MCP methyltransferase, CheR-type  35.4 
 
 		 290 aa  172  5e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.331314  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0987  MCP methyltransferase, CheR-type  33.09 
 
 		 283 aa  172  5e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0910  chemotaxis protein methyltransferase CheR  37.41 
 
 		 269 aa  169  3e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1152  protein-glutamate O-methyltransferase  35.77 
 
 		 291 aa  166  5e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.14728 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0783  protein-glutamate O-methyltransferase  37.32 
 
 		 269 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.827996  normal  0.901412 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0183  protein-glutamate O-methyltransferase  33.21 
 
 		 280 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0215  MCP methyltransferase, CheR-type  35.48 
 
 		 294 aa  162  7e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.177352  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0614  MCP methyltransferase, CheR-type  34.32 
 
 		 275 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0483798 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0777  MCP methyltransferase, CheR-type  33.82 
 
 		 297 aa  159  4e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.152669  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0163  MCP methyltransferase, CheR-type  33.59 
 
 		 280 aa  159  5e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1573  MCP methyltransferase, CheR-type  34.46 
 
 		 292 aa  159  5e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0438911  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0700  MCP methyltransferase, CheR-type  36.15 
 
 		 284 aa  159  6e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.531661 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0878  MCP methyltransferase, CheR-type  32.01 
 
 		 275 aa  158  7e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4421  protein-glutamate O-methyltransferase  32.62 
 
 		 277 aa  156  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2710  protein-glutamate O-methyltransferase  34.24 
 
 		 298 aa  156  3e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2815  MCP methyltransferase, CheR-type  33.33 
 
 		 275 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.904459  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0428  MCP methyltransferase, CheR-type  33.58 
 
 		 275 aa  155  8e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.235925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2118  MCP methyltransferase, CheR-type  31.75 
 
 		 283 aa  154  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2021  MCP methyltransferase, CheR-type  37.6 
 
 		 256 aa  155  1e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0808  MCP methyltransferase, CheR-type  33.71 
 
 		 272 aa  151  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0778  MCP methyltransferase, CheR-type  32.12 
 
 		 292 aa  150  2e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0203537 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1595  MCP methyltransferase, CheR-type  34.5 
 
 		 284 aa  150  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2618  MCP methyltransferase, CheR-type  34.5 
 
 		 292 aa  150  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0040  CheR methyltransferase, SAM binding domain protein  34.44 
 
 		 283 aa  150  2e-35  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0904  MCP methyltransferase, CheR-type  35.16 
 
 		 267 aa  150  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>