More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_1328 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1258  MCP methyltransferase, CheR-type  100 
 
 
279 aa  577  1e-164  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1328  MCP methyltransferase, CheR-type  100 
 
 
279 aa  577  1e-164  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1320  MCP methyltransferase, CheR-type  99.64 
 
 
279 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3251  chemotaxis protein methyltransferase CheR  98.57 
 
 
279 aa  571  1.0000000000000001e-162  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2598  protein-glutamate O-methyltransferase  97.49 
 
 
279 aa  565  1e-160  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3101  protein-glutamate O-methyltransferase  96.77 
 
 
279 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2948  protein-glutamate O-methyltransferase  96.77 
 
 
279 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1415  MCP methyltransferase, CheR-type  96.77 
 
 
279 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2963  protein-glutamate O-methyltransferase  96.77 
 
 
279 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.643676  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1302  protein-glutamate O-methyltransferase  92.11 
 
 
279 aa  541  1e-153  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1160  MCP methyltransferase, CheR-type  93.45 
 
 
277 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2319  protein-glutamate O-methyltransferase  92.36 
 
 
277 aa  533  1e-151  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.945432  normal  0.235837 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1596  MCP methyltransferase, CheR-type  90.58 
 
 
277 aa  522  1e-147  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.935025  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1344  MCP methyltransferase, CheR-type  90.97 
 
 
277 aa  523  1e-147  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.841955  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3088  protein-glutamate O-methyltransferase  89.89 
 
 
277 aa  521  1e-147  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1339  MCP methyltransferase, CheR-type  87.64 
 
 
277 aa  509  1e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1476  chemotaxis protein methyltransferase CheR  62.27 
 
 
276 aa  370  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004174  chemotaxis protein methyltransferase CheR  63.24 
 
 
275 aa  363  2e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1793  chemotaxis protein methyltransferase CheR  63.6 
 
 
275 aa  362  3e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01283  chemotaxis methyltransferase CheR  62.87 
 
 
275 aa  360  1e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2339  chemotaxis protein methyltransferase CheR  61.4 
 
 
275 aa  352  5e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02929  chemotaxis protein methyltransferase CheR  56.88 
 
 
276 aa  335  7e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.723494  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1928  chemotaxis protein methyltransferase CheR  55.84 
 
 
280 aa  308  5e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.495072  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3101  MCP methyltransferase, CheR-type  52.52 
 
 
278 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0448745  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3733  MCP methyltransferase, CheR-type  54.74 
 
 
275 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0499524  normal  0.833336 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3485  protein-glutamate O-methyltransferase  55.11 
 
 
280 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.405571  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4392  chemotaxis protein methyltransferase CheR  54.01 
 
 
275 aa  301  7.000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1462  protein-glutamate O-methyltransferase  54.01 
 
 
275 aa  301  7.000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2851  MCP methyltransferase, CheR-type  55.39 
 
 
282 aa  301  9e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.188729 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3953  MCP methyltransferase, CheR-type  54.01 
 
 
275 aa  301  9e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4252  MCP methyltransferase, CheR-type  54.74 
 
 
275 aa  300  2e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1782  putative chemotaxis protein methyltransferase  54.74 
 
 
274 aa  291  7e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1216  MCP methyltransferase, CheR-type  51.12 
 
 
275 aa  289  3e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.189092  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20760  putative chemotaxis protein methyltransferase  54.38 
 
 
274 aa  289  4e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1177  protein-glutamate O-methyltransferase  50.56 
 
 
275 aa  274  1.0000000000000001e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0805405  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2214  MCP methyltransferase, CheR-type  48.72 
 
 
285 aa  267  2e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0892  MCP methyltransferase, CheR-type  46.32 
 
 
275 aa  265  8.999999999999999e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.763334  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1069  protein-glutamate O-methyltransferase  46.99 
 
 
278 aa  264  1e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0178115  normal  0.0152511 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0521  protein-glutamate O-methyltransferase  47.45 
 
 
275 aa  254  1.0000000000000001e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.644079  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0925  MCP methyltransferase, CheR-type  46.21 
 
 
271 aa  241  7e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1430  MCP methyltransferase, CheR-type  48.3 
 
 
267 aa  230  2e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0527  MCP methyltransferase, CheR-type  41.58 
 
 
289 aa  198  9e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1874  MCP methyltransferase, CheR-type  41.79 
 
 
291 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0589357  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3855  MCP methyltransferase, CheR-type  41.04 
 
 
291 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.763244 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4031  MCP methyltransferase, CheR-type  39.63 
 
 
287 aa  195  9e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.236096  normal  0.66198 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6555  MCP methyltransferase, CheR-type  41.64 
 
 
289 aa  194  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.842137  normal  0.205146 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1494  protein-glutamate O-methyltransferase  41.79 
 
 
292 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1533  protein-glutamate O-methyltransferase  40.44 
 
 
285 aa  192  4e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0781767 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1813  MCP methyltransferase, CheR-type  40.44 
 
 
285 aa  192  4e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178161  normal  0.138477 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1710  MCP methyltransferase, CheR-type  41.86 
 
 
285 aa  192  7e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151818  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0662  MCP methyltransferase, CheR-type  39.77 
 
 
278 aa  191  1e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.893478 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4834  MCP methyltransferase, CheR-type  40 
 
 
296 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.162738  hitchhiker  0.00821783 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3916  MCP methyltransferase, CheR-type  41.95 
 
 
289 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.186094  normal  0.509616 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3674  protein-glutamate O-methyltransferase  40.82 
 
 
292 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1533  putative chemotaxis protein methyltransferase cheR  40.15 
 
 
292 aa  188  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280544  normal  0.734911 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1695  MCP methyltransferase, CheR-type  38.52 
 
 
289 aa  187  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34246  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1821  MCP methyltransferase, CheR-type  40.07 
 
 
292 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.101872  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3372  MCP methyltransferase, CheR-type  40.47 
 
 
288 aa  185  8e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491763  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3801  MCP methyltransferase, CheR-type  38.95 
 
 
294 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4243  MCP methyltransferase, CheR-type  38.75 
 
 
290 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115502  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1912  Protein-glutamate O-methyltransferase  38.95 
 
 
278 aa  179  4.999999999999999e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0842494  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3582  MCP methyltransferase, CheR-type  38.35 
 
 
302 aa  179  5.999999999999999e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0524  MCP methyltransferase, CheR-type  40.47 
 
 
288 aa  178  7e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.39989 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30900  MCP methyltransferase, CheR-type  40.08 
 
 
272 aa  176  3e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0871  MCP methyltransferase, CheR-type  34.88 
 
 
414 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1788  MCP methyltransferase, CheR-type  37.64 
 
 
316 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.275448  normal  0.703081 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4228  MCP methyltransferase, CheR-type  37.73 
 
 
274 aa  171  9e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2320  MCP methyltransferase, CheR-type  40.7 
 
 
291 aa  171  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0987  MCP methyltransferase, CheR-type  35.04 
 
 
283 aa  170  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0322  Protein-glutamate O-methyltransferase  37.36 
 
 
276 aa  168  1e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.191319  normal  0.294679 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1065  MCP methyltransferase, CheR-type  36.63 
 
 
271 aa  167  2e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5002  MCP methyltransferase, CheR-type  38.29 
 
 
274 aa  165  6.9999999999999995e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0163  MCP methyltransferase, CheR-type  34.35 
 
 
280 aa  165  9e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0524  MCP methyltransferase, CheR-type  35.52 
 
 
280 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3598  MCP methyltransferase, CheR-type  38.64 
 
 
278 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0123942  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0237  protein-glutamate O-methyltransferase  36.06 
 
 
307 aa  159  6e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.291409 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2001  MCP methyltransferase, CheR-type  33.94 
 
 
276 aa  158  1e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.349462  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0183  protein-glutamate O-methyltransferase  33.33 
 
 
280 aa  157  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2118  MCP methyltransferase, CheR-type  32.38 
 
 
283 aa  155  7e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0647  chemotaxis protein methyltransferase  33.82 
 
 
271 aa  155  8e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.63831  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1382  MCP methyltransferase, CheR-type  36.23 
 
 
303 aa  153  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2571  MCP methyltransferase, CheR-type  35.84 
 
 
303 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0808  MCP methyltransferase, CheR-type  33.58 
 
 
272 aa  150  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1529  MCP methyltransferase, CheR-type  36.36 
 
 
273 aa  150  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3498  protein-glutamate O-methyltransferase  37.02 
 
 
273 aa  149  3e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2475  MCP methyltransferase, CheR-type  35.48 
 
 
303 aa  149  5e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0126751  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0300  MCP methyltransferase, CheR-type  35.58 
 
 
302 aa  149  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000961073  normal  0.256387 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3139  protein-glutamate O-methyltransferase  31.93 
 
 
291 aa  148  7e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1415  MCP methyltransferase, CheR-type  32.17 
 
 
281 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.299383  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4203  MCP methyltransferase, CheR-type  36.19 
 
 
264 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0106813  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0332  MCP methyltransferase, CheR-type  35.21 
 
 
302 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.284961 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0809  MCP methyltransferase, CheR-type  35.63 
 
 
269 aa  148  1.0000000000000001e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4074  chemotaxis methyltransferase  34.7 
 
 
302 aa  147  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0757  MCP methyltransferase, CheR-type  31.97 
 
 
275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0471  MCP methyltransferase, CheR-type  35.16 
 
 
282 aa  145  5e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0110  MCP methyltransferase, CheR-type  33.59 
 
 
288 aa  145  6e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3691  chemotaxis regulator, protein-glutamate methyltransferase  34.83 
 
 
303 aa  145  6e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00198927  normal  0.0225149 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0579  MCP methyltransferase, CheR-type  33.81 
 
 
280 aa  145  8.000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0215  MCP methyltransferase, CheR-type  34.8 
 
 
294 aa  145  8.000000000000001e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.177352  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2215  chemotaxis protein methyltransferase CheR  31.58 
 
 
289 aa  144  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.171483  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>