More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3953 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3953  MCP methyltransferase, CheR-type  100 
 
 		 275 aa  570  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4392  chemotaxis protein methyltransferase CheR  99.27 
 
 		 275 aa  567  1e-161  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1462  protein-glutamate O-methyltransferase  99.27 
 
 		 275 aa  567  1e-161  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3733  MCP methyltransferase, CheR-type  98.18 
 
 		 275 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0499524  normal  0.833336 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4252  MCP methyltransferase, CheR-type  90.18 
 
 		 275 aa  525  1e-148  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3485  protein-glutamate O-methyltransferase  88.36 
 
 		 280 aa  510  1e-144  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.405571  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1928  chemotaxis protein methyltransferase CheR  88 
 
 		 280 aa  508  1e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.495072  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2851  MCP methyltransferase, CheR-type  85.09 
 
 		 282 aa  500  1e-140  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.188729 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20760  putative chemotaxis protein methyltransferase  85.45 
 
 		 274 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1782  putative chemotaxis protein methyltransferase  84.73 
 
 		 274 aa  489  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1177  protein-glutamate O-methyltransferase  58.36 
 
 		 275 aa  340  1e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0805405  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1069  protein-glutamate O-methyltransferase  56.02 
 
 		 278 aa  322  4e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0178115  normal  0.0152511 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2214  MCP methyltransferase, CheR-type  54.1 
 
 		 285 aa  319  3e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1216  MCP methyltransferase, CheR-type  54.24 
 
 		 275 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.189092  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1476  chemotaxis protein methyltransferase CheR  53.76 
 
 		 276 aa  309  4e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1160  MCP methyltransferase, CheR-type  53.65 
 
 		 277 aa  301  6.000000000000001e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1344  MCP methyltransferase, CheR-type  52.92 
 
 		 277 aa  301  8.000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.841955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1320  MCP methyltransferase, CheR-type  54.01 
 
 		 279 aa  301  8.000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1258  MCP methyltransferase, CheR-type  54.01 
 
 		 279 aa  301  9e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1328  MCP methyltransferase, CheR-type  54.01 
 
 		 279 aa  301  9e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2598  protein-glutamate O-methyltransferase  54.01 
 
 		 279 aa  301  1e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2963  protein-glutamate O-methyltransferase  53.65 
 
 		 279 aa  300  2e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.643676  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2948  protein-glutamate O-methyltransferase  53.65 
 
 		 279 aa  300  2e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3101  protein-glutamate O-methyltransferase  53.65 
 
 		 279 aa  300  2e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3251  chemotaxis protein methyltransferase CheR  53.65 
 
 		 279 aa  300  2e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1415  MCP methyltransferase, CheR-type  53.65 
 
 		 279 aa  300  2e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2319  protein-glutamate O-methyltransferase  54.01 
 
 		 277 aa  298  5e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.945432  normal  0.235837 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1302  protein-glutamate O-methyltransferase  54.28 
 
 		 279 aa  298  6e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1596  MCP methyltransferase, CheR-type  52.55 
 
 		 277 aa  297  1e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.935025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1339  MCP methyltransferase, CheR-type  53.53 
 
 		 277 aa  295  6e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3088  protein-glutamate O-methyltransferase  53.16 
 
 		 277 aa  294  1e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02929  chemotaxis protein methyltransferase CheR  53.36 
 
 		 276 aa  292  4e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.723494  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0521  protein-glutamate O-methyltransferase  50.18 
 
 		 275 aa  288  6e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.644079  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01283  chemotaxis methyltransferase CheR  50.55 
 
 		 275 aa  283  2.0000000000000002e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0892  MCP methyltransferase, CheR-type  49.63 
 
 		 275 aa  280  3e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.763334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004174  chemotaxis protein methyltransferase CheR  50.55 
 
 		 275 aa  279  4e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1793  chemotaxis protein methyltransferase CheR  49.45 
 
 		 275 aa  276  3e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2339  chemotaxis protein methyltransferase CheR  51.67 
 
 		 275 aa  275  6e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3101  MCP methyltransferase, CheR-type  46.59 
 
 		 278 aa  257  1e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0448745  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0925  MCP methyltransferase, CheR-type  47.21 
 
 		 271 aa  256  3e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1430  MCP methyltransferase, CheR-type  45.42 
 
 		 267 aa  227  1e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3582  MCP methyltransferase, CheR-type  43.07 
 
 		 302 aa  225  5.0000000000000005e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1494  protein-glutamate O-methyltransferase  44.4 
 
 		 292 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1874  MCP methyltransferase, CheR-type  43.23 
 
 		 291 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0589357  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3855  MCP methyltransferase, CheR-type  42.11 
 
 		 291 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.763244 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4031  MCP methyltransferase, CheR-type  42.58 
 
 		 287 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.236096  normal  0.66198 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3801  MCP methyltransferase, CheR-type  41.35 
 
 		 294 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30900  MCP methyltransferase, CheR-type  44.92 
 
 		 272 aa  208  9e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0871  MCP methyltransferase, CheR-type  39.22 
 
 		 414 aa  205  5e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3598  MCP methyltransferase, CheR-type  40 
 
 		 278 aa  204  9e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0123942  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1533  protein-glutamate O-methyltransferase  43.31 
 
 		 285 aa  204  1e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0781767 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1813  MCP methyltransferase, CheR-type  43.31 
 
 		 285 aa  204  1e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178161  normal  0.138477 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1821  MCP methyltransferase, CheR-type  43.46 
 
 		 292 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.101872  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6555  MCP methyltransferase, CheR-type  43.54 
 
 		 289 aa  204  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.842137  normal  0.205146 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2320  MCP methyltransferase, CheR-type  39.78 
 
 		 291 aa  202  4e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3916  MCP methyltransferase, CheR-type  41.64 
 
 		 289 aa  202  7e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.186094  normal  0.509616 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1710  MCP methyltransferase, CheR-type  42.91 
 
 		 285 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0527  MCP methyltransferase, CheR-type  40.47 
 
 		 289 aa  200  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2001  MCP methyltransferase, CheR-type  40.78 
 
 		 276 aa  199  3e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.349462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3372  MCP methyltransferase, CheR-type  41.86 
 
 		 288 aa  200  3e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491763  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0662  MCP methyltransferase, CheR-type  41.41 
 
 		 278 aa  199  5e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.893478 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4243  MCP methyltransferase, CheR-type  42.59 
 
 		 290 aa  198  7e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1529  MCP methyltransferase, CheR-type  39.11 
 
 		 273 aa  197  1.0000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3674  protein-glutamate O-methyltransferase  41.15 
 
 		 292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1533  putative chemotaxis protein methyltransferase cheR  39.93 
 
 		 292 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280544  normal  0.734911 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4228  MCP methyltransferase, CheR-type  36.46 
 
 		 274 aa  195  6e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0524  MCP methyltransferase, CheR-type  41.09 
 
 		 288 aa  195  7e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.39989 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1788  MCP methyltransferase, CheR-type  39.49 
 
 		 316 aa  195  7e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.275448  normal  0.703081 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4834  MCP methyltransferase, CheR-type  40.94 
 
 		 296 aa  194  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.162738  hitchhiker  0.00821783 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5002  MCP methyltransferase, CheR-type  36.6 
 
 		 274 aa  190  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0322  Protein-glutamate O-methyltransferase  39.61 
 
 		 276 aa  189  5.999999999999999e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.191319  normal  0.294679 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1912  Protein-glutamate O-methyltransferase  38.69 
 
 		 278 aa  185  6e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0842494  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1695  MCP methyltransferase, CheR-type  38.58 
 
 		 289 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34246  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0987  MCP methyltransferase, CheR-type  34.55 
 
 		 283 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0524  MCP methyltransferase, CheR-type  34.44 
 
 		 280 aa  175  9e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3943  MCP methyltransferase, CheR-type  35.16 
 
 		 290 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.331314  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4027  MCP methyltransferase, CheR-type  35.16 
 
 		 290 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000815784 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0215  MCP methyltransferase, CheR-type  37.6 
 
 		 294 aa  169  5e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.177352  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0783  protein-glutamate O-methyltransferase  37.36 
 
 		 269 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.827996  normal  0.901412 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2710  protein-glutamate O-methyltransferase  35.41 
 
 		 298 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0700  MCP methyltransferase, CheR-type  38.61 
 
 		 284 aa  164  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.531661 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0614  MCP methyltransferase, CheR-type  33.21 
 
 		 275 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0483798 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0183  protein-glutamate O-methyltransferase  32.45 
 
 		 280 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0777  MCP methyltransferase, CheR-type  34.31 
 
 		 297 aa  160  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.152669  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0878  MCP methyltransferase, CheR-type  33.33 
 
 		 275 aa  160  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0910  chemotaxis protein methyltransferase CheR  35.19 
 
 		 269 aa  159  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4421  protein-glutamate O-methyltransferase  32.62 
 
 		 277 aa  159  4e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1595  MCP methyltransferase, CheR-type  34.5 
 
 		 284 aa  159  4e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2618  MCP methyltransferase, CheR-type  34.5 
 
 		 292 aa  159  5e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1152  protein-glutamate O-methyltransferase  33.21 
 
 		 291 aa  158  7e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.14728 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2021  MCP methyltransferase, CheR-type  37.2 
 
 		 256 aa  157  1e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0428  MCP methyltransferase, CheR-type  35.06 
 
 		 275 aa  157  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.235925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0163  MCP methyltransferase, CheR-type  33.98 
 
 		 280 aa  156  4e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1573  MCP methyltransferase, CheR-type  32.58 
 
 		 292 aa  155  7e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0438911  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0808  MCP methyltransferase, CheR-type  33.59 
 
 		 272 aa  155  9e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2815  MCP methyltransferase, CheR-type  32.26 
 
 		 275 aa  154  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.904459  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0110  MCP methyltransferase, CheR-type  33.59 
 
 		 288 aa  153  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0904  MCP methyltransferase, CheR-type  35.56 
 
 		 267 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2700  MCP methyltransferase, CheR-type  37.94 
 
 		 288 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0040  CheR methyltransferase, SAM binding domain protein  33.61 
 
 		 283 aa  152  4e-36  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>