More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02929 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_02929  chemotaxis protein methyltransferase CheR  100 
 
 
276 aa  565  1e-160  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.723494  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2319  protein-glutamate O-methyltransferase  58.33 
 
 
277 aa  341  7e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.945432  normal  0.235837 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1596  MCP methyltransferase, CheR-type  56.88 
 
 
277 aa  340  2e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.935025  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1476  chemotaxis protein methyltransferase CheR  55.8 
 
 
276 aa  338  4e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1344  MCP methyltransferase, CheR-type  56.52 
 
 
277 aa  338  4e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.841955  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3088  protein-glutamate O-methyltransferase  56.88 
 
 
277 aa  338  7e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2598  protein-glutamate O-methyltransferase  57.25 
 
 
279 aa  336  1.9999999999999998e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1160  MCP methyltransferase, CheR-type  56.88 
 
 
277 aa  336  2.9999999999999997e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3251  chemotaxis protein methyltransferase CheR  57.25 
 
 
279 aa  335  3.9999999999999995e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2963  protein-glutamate O-methyltransferase  56.88 
 
 
279 aa  335  5.999999999999999e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.643676  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1415  MCP methyltransferase, CheR-type  56.88 
 
 
279 aa  335  5.999999999999999e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3101  protein-glutamate O-methyltransferase  56.88 
 
 
279 aa  335  5.999999999999999e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2948  protein-glutamate O-methyltransferase  56.88 
 
 
279 aa  335  5.999999999999999e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1320  MCP methyltransferase, CheR-type  56.88 
 
 
279 aa  335  5.999999999999999e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1258  MCP methyltransferase, CheR-type  56.88 
 
 
279 aa  335  7e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1328  MCP methyltransferase, CheR-type  56.88 
 
 
279 aa  335  7e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1339  MCP methyltransferase, CheR-type  55.43 
 
 
277 aa  330  2e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1302  protein-glutamate O-methyltransferase  56.52 
 
 
279 aa  330  2e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004174  chemotaxis protein methyltransferase CheR  54.35 
 
 
275 aa  325  7e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1793  chemotaxis protein methyltransferase CheR  55.07 
 
 
275 aa  323  2e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01283  chemotaxis methyltransferase CheR  53.99 
 
 
275 aa  321  7e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2339  chemotaxis protein methyltransferase CheR  51.45 
 
 
275 aa  304  9.000000000000001e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1928  chemotaxis protein methyltransferase CheR  54.14 
 
 
280 aa  298  7e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.495072  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3485  protein-glutamate O-methyltransferase  54.14 
 
 
280 aa  296  3e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.405571  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1782  putative chemotaxis protein methyltransferase  54.04 
 
 
274 aa  295  4e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20760  putative chemotaxis protein methyltransferase  54.41 
 
 
274 aa  295  4e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4252  MCP methyltransferase, CheR-type  54.1 
 
 
275 aa  294  8e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3733  MCP methyltransferase, CheR-type  53.73 
 
 
275 aa  294  9e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0499524  normal  0.833336 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2851  MCP methyltransferase, CheR-type  54.14 
 
 
282 aa  294  1e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.188729 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4392  chemotaxis protein methyltransferase CheR  53.36 
 
 
275 aa  292  4e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3953  MCP methyltransferase, CheR-type  53.36 
 
 
275 aa  292  4e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1462  protein-glutamate O-methyltransferase  53.36 
 
 
275 aa  292  4e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3101  MCP methyltransferase, CheR-type  52.71 
 
 
278 aa  291  7e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0448745  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1177  protein-glutamate O-methyltransferase  50.73 
 
 
275 aa  289  3e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0805405  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1216  MCP methyltransferase, CheR-type  50.18 
 
 
275 aa  281  1e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.189092  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1069  protein-glutamate O-methyltransferase  47.23 
 
 
278 aa  277  1e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0178115  normal  0.0152511 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2214  MCP methyltransferase, CheR-type  48.3 
 
 
285 aa  256  3e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1430  MCP methyltransferase, CheR-type  50.96 
 
 
267 aa  249  5e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0925  MCP methyltransferase, CheR-type  47.31 
 
 
271 aa  245  4.9999999999999997e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0521  protein-glutamate O-methyltransferase  47.14 
 
 
275 aa  243  3e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.644079  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0892  MCP methyltransferase, CheR-type  43.84 
 
 
275 aa  238  6.999999999999999e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.763334  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0662  MCP methyltransferase, CheR-type  46.54 
 
 
278 aa  221  8e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.893478 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6555  MCP methyltransferase, CheR-type  44.32 
 
 
289 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.842137  normal  0.205146 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4031  MCP methyltransferase, CheR-type  42.97 
 
 
287 aa  206  3e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.236096  normal  0.66198 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1710  MCP methyltransferase, CheR-type  42.44 
 
 
285 aa  203  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151818  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0527  MCP methyltransferase, CheR-type  43.4 
 
 
289 aa  203  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1813  MCP methyltransferase, CheR-type  41.76 
 
 
285 aa  202  7e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178161  normal  0.138477 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1533  protein-glutamate O-methyltransferase  41.76 
 
 
285 aa  202  7e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0781767 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4243  MCP methyltransferase, CheR-type  42.49 
 
 
290 aa  201  9e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115502  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3372  MCP methyltransferase, CheR-type  41.76 
 
 
288 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491763  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1821  MCP methyltransferase, CheR-type  41.18 
 
 
292 aa  199  5e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.101872  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1874  MCP methyltransferase, CheR-type  40 
 
 
291 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0589357  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3801  MCP methyltransferase, CheR-type  39.26 
 
 
294 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1494  protein-glutamate O-methyltransferase  39.26 
 
 
292 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3916  MCP methyltransferase, CheR-type  41.45 
 
 
289 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.186094  normal  0.509616 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0524  MCP methyltransferase, CheR-type  40.66 
 
 
288 aa  192  5e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.39989 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3855  MCP methyltransferase, CheR-type  38.15 
 
 
291 aa  191  8e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.763244 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3674  protein-glutamate O-methyltransferase  39.63 
 
 
292 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4834  MCP methyltransferase, CheR-type  40.15 
 
 
296 aa  190  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.162738  hitchhiker  0.00821783 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1533  putative chemotaxis protein methyltransferase cheR  40.3 
 
 
292 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280544  normal  0.734911 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0524  MCP methyltransferase, CheR-type  37.41 
 
 
280 aa  185  8e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3582  MCP methyltransferase, CheR-type  37.5 
 
 
302 aa  182  4.0000000000000006e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1695  MCP methyltransferase, CheR-type  38.87 
 
 
289 aa  181  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34246  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0871  MCP methyltransferase, CheR-type  36.98 
 
 
414 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30900  MCP methyltransferase, CheR-type  39.41 
 
 
272 aa  174  9.999999999999999e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2320  MCP methyltransferase, CheR-type  39.06 
 
 
291 aa  173  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1788  MCP methyltransferase, CheR-type  38.26 
 
 
316 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.275448  normal  0.703081 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3598  MCP methyltransferase, CheR-type  38.67 
 
 
278 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0123942  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5002  MCP methyltransferase, CheR-type  37.45 
 
 
274 aa  172  6.999999999999999e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4228  MCP methyltransferase, CheR-type  38.26 
 
 
274 aa  172  7.999999999999999e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0322  Protein-glutamate O-methyltransferase  36.33 
 
 
276 aa  168  9e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.191319  normal  0.294679 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0987  MCP methyltransferase, CheR-type  33.81 
 
 
283 aa  168  1e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2001  MCP methyltransferase, CheR-type  36.4 
 
 
276 aa  167  2.9999999999999998e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.349462  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1912  Protein-glutamate O-methyltransferase  38.52 
 
 
278 aa  165  9e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0842494  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0635  MCP methyltransferase, CheR-type  37.41 
 
 
301 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0626  MCP methyltransferase, CheR-type  37.04 
 
 
301 aa  161  9e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.325159  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0777  MCP methyltransferase, CheR-type  32.23 
 
 
297 aa  161  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.152669  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0215  MCP methyltransferase, CheR-type  37.4 
 
 
294 aa  159  6e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.177352  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0207  CheR methyltransferase SAM-binding domain-containing protein  35.66 
 
 
270 aa  158  7e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2166  protein-glutamate O-methyltransferase  35.5 
 
 
292 aa  156  4e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00016475  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0700  MCP methyltransferase, CheR-type  33.72 
 
 
284 aa  155  5.0000000000000005e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.531661 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0159  chemotaxis protein methyltransferase CheR  35.11 
 
 
273 aa  155  7e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2118  MCP methyltransferase, CheR-type  32.38 
 
 
283 aa  155  8e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2710  protein-glutamate O-methyltransferase  35.74 
 
 
298 aa  154  1e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1849  Protein-glutamate O-methyltransferase  33.92 
 
 
291 aa  154  1e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.313486  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0601  MCP methyltransferase, CheR-type  35.93 
 
 
299 aa  154  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1932  MCP methyltransferase, CheR-type  33.96 
 
 
283 aa  154  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3811  MCP methyltransferase, CheR-type  32.58 
 
 
318 aa  154  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2571  MCP methyltransferase, CheR-type  34.41 
 
 
303 aa  154  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3498  protein-glutamate O-methyltransferase  36.11 
 
 
273 aa  154  1e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1382  MCP methyltransferase, CheR-type  34.31 
 
 
303 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2475  MCP methyltransferase, CheR-type  34.41 
 
 
303 aa  153  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0126751  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2700  MCP methyltransferase, CheR-type  34.46 
 
 
288 aa  154  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2162  protein-glutamate O-methyltransferase  33.71 
 
 
272 aa  152  5e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1617  MCP methyltransferase, CheR-type  34.11 
 
 
289 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0569703 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2434  putative MCP methyltransferase, CheR1  33.07 
 
 
305 aa  152  7e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0237  protein-glutamate O-methyltransferase  35.95 
 
 
307 aa  152  7e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.291409 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0183  protein-glutamate O-methyltransferase  33.47 
 
 
280 aa  152  8e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2021  MCP methyltransferase, CheR-type  33.83 
 
 
290 aa  151  8.999999999999999e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0730  MCP methyltransferase, CheR-type  34.24 
 
 
300 aa  151  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0443063  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>