More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0527 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_0527  MCP methyltransferase, CheR-type  100 
 
 
289 aa  595  1e-169  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1533  putative chemotaxis protein methyltransferase cheR  79.51 
 
 
292 aa  483  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280544  normal  0.734911 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3372  MCP methyltransferase, CheR-type  72.92 
 
 
288 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491763  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0524  MCP methyltransferase, CheR-type  69.79 
 
 
288 aa  433  1e-120  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.39989 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6555  MCP methyltransferase, CheR-type  71.18 
 
 
289 aa  431  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.842137  normal  0.205146 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4243  MCP methyltransferase, CheR-type  71.28 
 
 
290 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115502  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1874  MCP methyltransferase, CheR-type  73.19 
 
 
291 aa  427  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0589357  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1821  MCP methyltransferase, CheR-type  71.08 
 
 
292 aa  430  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.101872  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3916  MCP methyltransferase, CheR-type  69.44 
 
 
289 aa  424  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.186094  normal  0.509616 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3674  protein-glutamate O-methyltransferase  69.93 
 
 
292 aa  424  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1494  protein-glutamate O-methyltransferase  72.14 
 
 
292 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3801  MCP methyltransferase, CheR-type  69.86 
 
 
294 aa  414  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3855  MCP methyltransferase, CheR-type  68.97 
 
 
291 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.763244 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4031  MCP methyltransferase, CheR-type  59.17 
 
 
287 aa  352  5e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.236096  normal  0.66198 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0524  MCP methyltransferase, CheR-type  58.87 
 
 
280 aa  339  4e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4834  MCP methyltransferase, CheR-type  58.03 
 
 
296 aa  334  1e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.162738  hitchhiker  0.00821783 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1813  MCP methyltransferase, CheR-type  56.47 
 
 
285 aa  333  2e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178161  normal  0.138477 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1533  protein-glutamate O-methyltransferase  56.47 
 
 
285 aa  333  2e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0781767 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1695  MCP methyltransferase, CheR-type  57.14 
 
 
289 aa  333  2e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34246  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1710  MCP methyltransferase, CheR-type  59.02 
 
 
285 aa  330  2e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151818  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0662  MCP methyltransferase, CheR-type  56.92 
 
 
278 aa  302  4.0000000000000003e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.893478 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1912  Protein-glutamate O-methyltransferase  50.74 
 
 
278 aa  277  2e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0842494  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1788  MCP methyltransferase, CheR-type  45.49 
 
 
316 aa  256  3e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.275448  normal  0.703081 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0322  Protein-glutamate O-methyltransferase  48.68 
 
 
276 aa  254  2.0000000000000002e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.191319  normal  0.294679 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3598  MCP methyltransferase, CheR-type  49.62 
 
 
278 aa  250  2e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0123942  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30900  MCP methyltransferase, CheR-type  47.6 
 
 
272 aa  242  6e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0871  MCP methyltransferase, CheR-type  40.94 
 
 
414 aa  235  5.0000000000000005e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5002  MCP methyltransferase, CheR-type  43.49 
 
 
274 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2320  MCP methyltransferase, CheR-type  43.07 
 
 
291 aa  229  3e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2001  MCP methyltransferase, CheR-type  45.14 
 
 
276 aa  228  1e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.349462  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0095  MCP methyltransferase, CheR-type  45.86 
 
 
275 aa  223  3e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4228  MCP methyltransferase, CheR-type  40.67 
 
 
274 aa  222  4.9999999999999996e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20760  putative chemotaxis protein methyltransferase  42.97 
 
 
274 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1782  putative chemotaxis protein methyltransferase  42.58 
 
 
274 aa  211  9e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2851  MCP methyltransferase, CheR-type  42.41 
 
 
282 aa  210  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.188729 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4252  MCP methyltransferase, CheR-type  43.19 
 
 
275 aa  206  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1216  MCP methyltransferase, CheR-type  41.86 
 
 
275 aa  205  7e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.189092  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02929  chemotaxis protein methyltransferase CheR  43.4 
 
 
276 aa  203  3e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.723494  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0892  MCP methyltransferase, CheR-type  39 
 
 
275 aa  203  3e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.763334  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3733  MCP methyltransferase, CheR-type  40.86 
 
 
275 aa  201  8e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0499524  normal  0.833336 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3485  protein-glutamate O-methyltransferase  42.25 
 
 
280 aa  201  9e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.405571  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1430  MCP methyltransferase, CheR-type  42.19 
 
 
267 aa  201  9.999999999999999e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1529  MCP methyltransferase, CheR-type  39.13 
 
 
273 aa  201  9.999999999999999e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2948  protein-glutamate O-methyltransferase  42.22 
 
 
279 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1415  MCP methyltransferase, CheR-type  42.22 
 
 
279 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2963  protein-glutamate O-methyltransferase  42.22 
 
 
279 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.643676  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3101  protein-glutamate O-methyltransferase  42.22 
 
 
279 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4392  chemotaxis protein methyltransferase CheR  40.47 
 
 
275 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3251  chemotaxis protein methyltransferase CheR  41.94 
 
 
279 aa  199  3e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1928  chemotaxis protein methyltransferase CheR  42.25 
 
 
280 aa  200  3e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.495072  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3953  MCP methyltransferase, CheR-type  40.47 
 
 
275 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1462  protein-glutamate O-methyltransferase  40.47 
 
 
275 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1069  protein-glutamate O-methyltransferase  40.53 
 
 
278 aa  198  7.999999999999999e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0178115  normal  0.0152511 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2598  protein-glutamate O-methyltransferase  41.85 
 
 
279 aa  198  7.999999999999999e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1320  MCP methyltransferase, CheR-type  41.58 
 
 
279 aa  198  9e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2339  chemotaxis protein methyltransferase CheR  40.38 
 
 
275 aa  198  1.0000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1344  MCP methyltransferase, CheR-type  41.33 
 
 
277 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.841955  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1258  MCP methyltransferase, CheR-type  41.58 
 
 
279 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1328  MCP methyltransferase, CheR-type  41.58 
 
 
279 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1793  chemotaxis protein methyltransferase CheR  41.02 
 
 
275 aa  196  4.0000000000000005e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0215  MCP methyltransferase, CheR-type  41.6 
 
 
294 aa  195  8.000000000000001e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.177352  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004174  chemotaxis protein methyltransferase CheR  40.62 
 
 
275 aa  195  9e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01283  chemotaxis methyltransferase CheR  40.23 
 
 
275 aa  195  9e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1177  protein-glutamate O-methyltransferase  41.02 
 
 
275 aa  194  1e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0805405  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1736  MCP methyltransferase, CheR-type  38.11 
 
 
290 aa  193  3e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0460074 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1339  MCP methyltransferase, CheR-type  40.45 
 
 
277 aa  192  4e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2319  protein-glutamate O-methyltransferase  40.59 
 
 
277 aa  192  6e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.945432  normal  0.235837 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0521  protein-glutamate O-methyltransferase  37.98 
 
 
275 aa  191  1e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.644079  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1596  MCP methyltransferase, CheR-type  39.55 
 
 
277 aa  190  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.935025  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1302  protein-glutamate O-methyltransferase  39.71 
 
 
279 aa  190  2e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0163  MCP methyltransferase, CheR-type  37.5 
 
 
280 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3088  protein-glutamate O-methyltransferase  40.45 
 
 
277 aa  189  4e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1160  MCP methyltransferase, CheR-type  39.78 
 
 
277 aa  189  5e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2214  MCP methyltransferase, CheR-type  39.27 
 
 
285 aa  188  1e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3101  MCP methyltransferase, CheR-type  37.64 
 
 
278 aa  187  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0448745  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3582  MCP methyltransferase, CheR-type  36.88 
 
 
302 aa  187  2e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3104  MCP methyltransferase, CheR-type  36.3 
 
 
285 aa  182  4.0000000000000006e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.575775  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0069  MCP methyltransferase, CheR-type  37.22 
 
 
280 aa  182  7e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0925  MCP methyltransferase, CheR-type  36.09 
 
 
271 aa  181  1e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0987  MCP methyltransferase, CheR-type  34.06 
 
 
283 aa  180  2e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0428  MCP methyltransferase, CheR-type  37.23 
 
 
275 aa  181  2e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.235925  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0183  protein-glutamate O-methyltransferase  36.36 
 
 
280 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1476  chemotaxis protein methyltransferase CheR  37.41 
 
 
276 aa  179  4e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3139  protein-glutamate O-methyltransferase  35.71 
 
 
291 aa  177  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0110  MCP methyltransferase, CheR-type  38.91 
 
 
288 aa  178  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3498  protein-glutamate O-methyltransferase  37.45 
 
 
273 aa  171  1e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2215  chemotaxis protein methyltransferase CheR  34.6 
 
 
289 aa  170  3e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.171483  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2305  MCP methyltransferase, CheR-type  34.22 
 
 
291 aa  170  3e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0635  MCP methyltransferase, CheR-type  40.54 
 
 
301 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0777  MCP methyltransferase, CheR-type  31.58 
 
 
297 aa  166  5e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.152669  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0626  MCP methyltransferase, CheR-type  40.15 
 
 
301 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.325159  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0040  CheR methyltransferase, SAM binding domain protein  35.08 
 
 
283 aa  164  2.0000000000000002e-39  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2146  MCP methyltransferase, CheR-type  36.57 
 
 
271 aa  163  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0601  MCP methyltransferase, CheR-type  39.77 
 
 
299 aa  163  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0295  chemotaxis protein methyltransferase CheR  33.08 
 
 
277 aa  161  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.468009  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0089  MCP methyltransferase, CheR-type  34.33 
 
 
283 aa  161  1e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3299  protein-glutamate O-methyltransferase  36.68 
 
 
275 aa  161  1e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1379  MCP methyltransferase, CheR-type  33.97 
 
 
553 aa  160  3e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.991559  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0579  MCP methyltransferase, CheR-type  32.32 
 
 
280 aa  160  3e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1573  MCP methyltransferase, CheR-type  34.6 
 
 
292 aa  159  4e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0438911  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>