More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1736 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_1736  MCP methyltransferase, CheR-type  100 
 
 
290 aa  592  1e-168  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0460074 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0069  MCP methyltransferase, CheR-type  49.23 
 
 
280 aa  239  2.9999999999999997e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4031  MCP methyltransferase, CheR-type  41.22 
 
 
287 aa  219  6e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.236096  normal  0.66198 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3855  MCP methyltransferase, CheR-type  39.29 
 
 
291 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.763244 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1494  protein-glutamate O-methyltransferase  40.15 
 
 
292 aa  216  5e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1874  MCP methyltransferase, CheR-type  39.03 
 
 
291 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0589357  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4834  MCP methyltransferase, CheR-type  42.48 
 
 
296 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.162738  hitchhiker  0.00821783 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1695  MCP methyltransferase, CheR-type  42.48 
 
 
289 aa  209  6e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34246  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3801  MCP methyltransferase, CheR-type  37.87 
 
 
294 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1533  protein-glutamate O-methyltransferase  39.42 
 
 
285 aa  198  7.999999999999999e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0781767 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1813  MCP methyltransferase, CheR-type  39.42 
 
 
285 aa  198  7.999999999999999e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178161  normal  0.138477 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1710  MCP methyltransferase, CheR-type  39.85 
 
 
285 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151818  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0527  MCP methyltransferase, CheR-type  38.11 
 
 
289 aa  193  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4243  MCP methyltransferase, CheR-type  37.31 
 
 
290 aa  192  5e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115502  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0524  MCP methyltransferase, CheR-type  37.5 
 
 
288 aa  192  6e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.39989 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3372  MCP methyltransferase, CheR-type  38.26 
 
 
288 aa  190  2e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491763  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6555  MCP methyltransferase, CheR-type  38.97 
 
 
289 aa  189  4e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.842137  normal  0.205146 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3916  MCP methyltransferase, CheR-type  37.5 
 
 
289 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.186094  normal  0.509616 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1533  putative chemotaxis protein methyltransferase cheR  37.36 
 
 
292 aa  189  4e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280544  normal  0.734911 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1821  MCP methyltransferase, CheR-type  37.12 
 
 
292 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.101872  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0524  MCP methyltransferase, CheR-type  35.94 
 
 
280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3674  protein-glutamate O-methyltransferase  38.26 
 
 
292 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1912  Protein-glutamate O-methyltransferase  36.73 
 
 
278 aa  177  1e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0842494  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0662  MCP methyltransferase, CheR-type  35.57 
 
 
278 aa  172  5e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.893478 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2339  chemotaxis protein methyltransferase CheR  34.72 
 
 
275 aa  157  2e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1788  MCP methyltransferase, CheR-type  33.46 
 
 
316 aa  157  2e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.275448  normal  0.703081 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004174  chemotaxis protein methyltransferase CheR  34.34 
 
 
275 aa  157  3e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0871  MCP methyltransferase, CheR-type  30.85 
 
 
414 aa  153  4e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01283  chemotaxis methyltransferase CheR  33.96 
 
 
275 aa  152  8e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1793  chemotaxis protein methyltransferase CheR  33.96 
 
 
275 aa  150  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1529  MCP methyltransferase, CheR-type  36.24 
 
 
273 aa  145  6e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2001  MCP methyltransferase, CheR-type  29.07 
 
 
276 aa  144  2e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.349462  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1339  MCP methyltransferase, CheR-type  30.83 
 
 
277 aa  143  4e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30900  MCP methyltransferase, CheR-type  34.24 
 
 
272 aa  142  6e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3598  MCP methyltransferase, CheR-type  30.53 
 
 
278 aa  142  9e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0123942  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0521  protein-glutamate O-methyltransferase  33.08 
 
 
275 aa  141  9.999999999999999e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.644079  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1430  MCP methyltransferase, CheR-type  30.95 
 
 
267 aa  141  9.999999999999999e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2320  MCP methyltransferase, CheR-type  34.02 
 
 
291 aa  140  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5002  MCP methyltransferase, CheR-type  33.76 
 
 
274 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1344  MCP methyltransferase, CheR-type  30.83 
 
 
277 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.841955  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3101  MCP methyltransferase, CheR-type  30.48 
 
 
278 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0448745  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0987  MCP methyltransferase, CheR-type  30.11 
 
 
283 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02929  chemotaxis protein methyltransferase CheR  29.86 
 
 
276 aa  135  7.000000000000001e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.723494  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0322  Protein-glutamate O-methyltransferase  29.69 
 
 
276 aa  134  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.191319  normal  0.294679 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1160  MCP methyltransferase, CheR-type  31.2 
 
 
277 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4252  MCP methyltransferase, CheR-type  32.8 
 
 
275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2319  protein-glutamate O-methyltransferase  31.95 
 
 
277 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.945432  normal  0.235837 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3088  protein-glutamate O-methyltransferase  29.7 
 
 
277 aa  132  9e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3485  protein-glutamate O-methyltransferase  32.94 
 
 
280 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.405571  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1596  MCP methyltransferase, CheR-type  30.08 
 
 
277 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.935025  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1782  putative chemotaxis protein methyltransferase  33.21 
 
 
274 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4228  MCP methyltransferase, CheR-type  26.59 
 
 
274 aa  130  4.0000000000000003e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20760  putative chemotaxis protein methyltransferase  32.84 
 
 
274 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1320  MCP methyltransferase, CheR-type  30.15 
 
 
279 aa  129  6e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1928  chemotaxis protein methyltransferase CheR  32.54 
 
 
280 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.495072  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3101  protein-glutamate O-methyltransferase  30.15 
 
 
279 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1302  protein-glutamate O-methyltransferase  30.5 
 
 
279 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2963  protein-glutamate O-methyltransferase  30.15 
 
 
279 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.643676  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2948  protein-glutamate O-methyltransferase  30.15 
 
 
279 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1415  MCP methyltransferase, CheR-type  30.15 
 
 
279 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1476  chemotaxis protein methyltransferase CheR  28.74 
 
 
276 aa  128  9.000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2214  MCP methyltransferase, CheR-type  29.62 
 
 
285 aa  128  9.000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2851  MCP methyltransferase, CheR-type  31.87 
 
 
282 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.188729 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1258  MCP methyltransferase, CheR-type  30.15 
 
 
279 aa  128  9.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1328  MCP methyltransferase, CheR-type  30.15 
 
 
279 aa  128  9.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3251  chemotaxis protein methyltransferase CheR  30.15 
 
 
279 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2598  protein-glutamate O-methyltransferase  30.15 
 
 
279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1199  methylase of chemotaxis methyl-accepting protein, CheR-like  30.43 
 
 
291 aa  125  6e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3582  MCP methyltransferase, CheR-type  29.3 
 
 
302 aa  125  6e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4392  chemotaxis protein methyltransferase CheR  32.14 
 
 
275 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1216  MCP methyltransferase, CheR-type  31.73 
 
 
275 aa  125  8.000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.189092  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1462  protein-glutamate O-methyltransferase  32.14 
 
 
275 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0040  CheR methyltransferase, SAM binding domain protein  25.9 
 
 
283 aa  124  2e-27  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3733  MCP methyltransferase, CheR-type  31.47 
 
 
275 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0499524  normal  0.833336 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3953  MCP methyltransferase, CheR-type  32.14 
 
 
275 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2305  MCP methyltransferase, CheR-type  29.55 
 
 
291 aa  122  8e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2215  chemotaxis protein methyltransferase CheR  29.23 
 
 
289 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.171483  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0095  MCP methyltransferase, CheR-type  29.59 
 
 
275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0892  MCP methyltransferase, CheR-type  31.32 
 
 
275 aa  121  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.763334  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1069  protein-glutamate O-methyltransferase  30.68 
 
 
278 aa  121  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0178115  normal  0.0152511 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0428  MCP methyltransferase, CheR-type  28.52 
 
 
275 aa  118  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.235925  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1177  protein-glutamate O-methyltransferase  30.12 
 
 
275 aa  118  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0805405  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2118  MCP methyltransferase, CheR-type  29.92 
 
 
283 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0993  protein-glutamate O-methyltransferase  29.96 
 
 
468 aa  116  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0747  MCP methyltransferase, CheR-type  35.06 
 
 
288 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0295  chemotaxis protein methyltransferase CheR  25.95 
 
 
277 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.468009  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1528  MCP methyltransferase, CheR-type  31.4 
 
 
266 aa  114  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.168715 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3195  TPR repeat-containing CheR-type MCP methyltransferase  30.35 
 
 
463 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.13083 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0762  MCP methyltransferase, CheR-type  34.48 
 
 
288 aa  113  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.454256 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4168  response regulator receiver protein  31.16 
 
 
622 aa  113  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03244  chemotaxis protein methyltransferase CheR  27.54 
 
 
284 aa  113  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0808  MCP methyltransferase, CheR-type  25.9 
 
 
272 aa  113  4.0000000000000004e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2325  MCP methyltransferase, CheR-type  28.73 
 
 
276 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0327  putative PAS/PAC sensor protein  29.01 
 
 
1008 aa  112  7.000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3139  protein-glutamate O-methyltransferase  26.41 
 
 
291 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0647  chemotaxis protein methyltransferase  24.71 
 
 
271 aa  112  1.0000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.63831  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2815  MCP methyltransferase, CheR-type  25 
 
 
275 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.904459  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0780  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  29.5 
 
 
887 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2189  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  28.57 
 
 
481 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1118  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  31.62 
 
 
852 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.742809 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>