More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3498 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_3498  protein-glutamate O-methyltransferase  100 
 
 
273 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0110  MCP methyltransferase, CheR-type  65.54 
 
 
288 aa  365  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0183  protein-glutamate O-methyltransferase  64.12 
 
 
280 aa  364  1e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0163  MCP methyltransferase, CheR-type  64.89 
 
 
280 aa  363  2e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3104  MCP methyltransferase, CheR-type  50 
 
 
285 aa  273  2.0000000000000002e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.575775  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2146  MCP methyltransferase, CheR-type  45.83 
 
 
271 aa  245  6.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0757  MCP methyltransferase, CheR-type  42.26 
 
 
275 aa  239  4e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0089  MCP methyltransferase, CheR-type  43.01 
 
 
283 aa  238  9e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1617  MCP methyltransferase, CheR-type  48.7 
 
 
289 aa  237  1e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0569703 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0281  MCP methyltransferase, CheR-type  45.02 
 
 
292 aa  235  5.0000000000000005e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354754  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1932  MCP methyltransferase, CheR-type  46.59 
 
 
283 aa  231  9e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0255  putative chemotaxis protein methyltransferase  50 
 
 
280 aa  229  4e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2166  protein-glutamate O-methyltransferase  48.67 
 
 
292 aa  229  5e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00016475  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4052  MCP methyltransferase, CheR-type  45.49 
 
 
293 aa  227  1e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4164  MCP methyltransferase, CheR-type  45.49 
 
 
293 aa  227  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0152  chemotaxis protein methyltransferase CheR  43.45 
 
 
276 aa  226  3e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3811  MCP methyltransferase, CheR-type  47.74 
 
 
318 aa  226  4e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0159  chemotaxis protein methyltransferase CheR  44.53 
 
 
273 aa  225  7e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2021  MCP methyltransferase, CheR-type  45.28 
 
 
290 aa  225  7e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1405  chemotaxis protein methyltransferase  45.11 
 
 
292 aa  224  1e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.685879  normal  0.0669102 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0207  CheR methyltransferase SAM-binding domain-containing protein  44.53 
 
 
270 aa  224  1e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0730  MCP methyltransferase, CheR-type  45.38 
 
 
300 aa  223  2e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0443063  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2622  chemotaxis methyltransferase CheR  47.17 
 
 
286 aa  224  2e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000206628 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2162  protein-glutamate O-methyltransferase  44.74 
 
 
272 aa  223  2e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2117  chemotaxis methyltransferase CheR  47.55 
 
 
286 aa  224  2e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.396301  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4074  chemotaxis methyltransferase  43.01 
 
 
302 aa  223  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1756  MCP methyltransferase, CheR-type  47.17 
 
 
286 aa  223  3e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0553359  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1980  chemotaxis methyltransferase CheR  47.17 
 
 
286 aa  223  3e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2177  chemotaxis methyltransferase CheR  47.17 
 
 
286 aa  222  4e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1748  chemotaxis methyltransferase CheR  47.17 
 
 
286 aa  222  4e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01855  chemotaxis regulator, protein-glutamate methyltransferase  47.17 
 
 
286 aa  222  6e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.435118  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01844  hypothetical protein  47.17 
 
 
286 aa  222  6e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.370669  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02200  putative chemotaxis protein methyltransferase  48.48 
 
 
280 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.077708  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1845  MCP methyltransferase, CheR-type  47.17 
 
 
289 aa  220  1.9999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.516279 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1300  chemotaxis methyltransferase CheR  46.79 
 
 
286 aa  220  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000891589 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3625  MCP methyltransferase, CheR-type  44.84 
 
 
298 aa  219  3e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0636111 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2710  protein-glutamate O-methyltransferase  43.37 
 
 
298 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22590  Protein-glutamate O-methyltransferase  40.52 
 
 
309 aa  219  3.9999999999999997e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1444  MCP methyltransferase, CheR-type  42.91 
 
 
300 aa  219  5e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0332  MCP methyltransferase, CheR-type  43.12 
 
 
302 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.284961 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2078  chemotaxis methyltransferase CheR  46.49 
 
 
288 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.687941  hitchhiker  2.73756e-16 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1077  MCP methyltransferase, CheR-type  44.98 
 
 
300 aa  217  1e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00329536 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0300  MCP methyltransferase, CheR-type  43.7 
 
 
302 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000961073  normal  0.256387 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2073  chemotaxis methyltransferase CheR  46.49 
 
 
288 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.50771  hitchhiker  0.000251677 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1204  chemotaxis methyltransferase CheR  46.49 
 
 
288 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24390  protein-glutamate O-methyltransferase. chemotaxis protein  44.36 
 
 
287 aa  216  2.9999999999999998e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.273905  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4154  MCP methyltransferase, CheR-type  43.94 
 
 
273 aa  216  4e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2133  chemotaxis methyltransferase CheR  46.13 
 
 
288 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000021864 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1327  chemotaxis methyltransferase CheR  46.13 
 
 
288 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000151288 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3691  chemotaxis regulator, protein-glutamate methyltransferase  45.11 
 
 
303 aa  216  4e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00198927  normal  0.0225149 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2455  chemotaxis methyltransferase CheR  45.76 
 
 
288 aa  215  5.9999999999999996e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0237  protein-glutamate O-methyltransferase  41.91 
 
 
307 aa  214  9.999999999999999e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.291409 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1098  protein-glutamate O-methyltransferase  39.78 
 
 
305 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2434  putative MCP methyltransferase, CheR1  39.78 
 
 
305 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2115  protein-glutamate O-methyltransferase  42.07 
 
 
281 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3218  MCP methyltransferase, CheR-type  44.19 
 
 
295 aa  212  3.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.108561 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1043  MCP methyltransferase, CheR-type  44.57 
 
 
283 aa  212  4.9999999999999996e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5610  MCP methyltransferase, CheR-type  45.11 
 
 
303 aa  212  5.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.503579  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1515  chemotaxis methyltransferase CheR  44.91 
 
 
290 aa  210  2e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0122  MCP methyltransferase, CheR-type  47.74 
 
 
316 aa  209  4e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1543  chemotaxis methyltransferase CheR  46.54 
 
 
290 aa  208  8e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.520759  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2608  chemotaxis methyltransferase CheR  45.28 
 
 
290 aa  208  8e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.215293  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3179  chemotaxis protein methyltransferase CheR  45.86 
 
 
314 aa  208  9e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3469  MCP methyltransferase, CheR-type  39.25 
 
 
280 aa  208  9e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.912759  normal  0.640591 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0185  MCP methyltransferase, CheR-type  47.37 
 
 
325 aa  207  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1858  chemotaxis methyltransferase CheR  44.91 
 
 
290 aa  207  2e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2124  chemotaxis protein methyltransferase CheR  42.07 
 
 
277 aa  207  2e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0172  MCP methyltransferase, CheR-type  47.37 
 
 
325 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.581337  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2215  MCP methyltransferase, CheR-type  41.79 
 
 
276 aa  207  2e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.556164  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3933  chemotaxis protein methyltransferase CheR  45.49 
 
 
315 aa  206  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2848  MCP methyltransferase, CheR-type  46.99 
 
 
330 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.242371  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0259  MCP methyltransferase, CheR-type  46.99 
 
 
330 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.000294494  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0073  chemotaxis protein methyltransferase  45.49 
 
 
314 aa  206  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0241  MCP methyltransferase, CheR-type  46.99 
 
 
325 aa  206  4e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0215152  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2101  MCP methyltransferase, CheR-type  39.85 
 
 
281 aa  205  5e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.60784  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0428  MCP methyltransferase, CheR-type  42.07 
 
 
275 aa  205  6e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.235925  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1756  chemotaxis methyltransferase CheR  46.92 
 
 
295 aa  205  6e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.456402  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00055  chemotaxis protein methyltransferase 2  42.44 
 
 
286 aa  205  6e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00310975  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2981  chemotaxis methyltransferase CheR  47.31 
 
 
290 aa  205  7e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1644  chemotaxis methyltransferase CheR  46.92 
 
 
272 aa  204  9e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0168  MCP methyltransferase, CheR-type  46.24 
 
 
328 aa  204  9e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.419483 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3518  chemotaxis methyltransferase CheR  46.92 
 
 
272 aa  204  9e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.577755 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2856  chemotaxis protein methyltransferase CheR  45.11 
 
 
314 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1687  chemotaxis protein methyltransferase CheR  45.11 
 
 
315 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.460756  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1884  MCP methyltransferase, CheR-type  41.04 
 
 
276 aa  204  1e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0878954 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3119  chemotaxis protein methyltransferase CheR  45.11 
 
 
315 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.830428  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2361  protein-glutamate O-methyltransferase  39.48 
 
 
281 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3852  chemotaxis protein methyltransferase  45.11 
 
 
315 aa  203  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2090  MCP methyltransferase, CheR-type  41.04 
 
 
276 aa  204  2e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.853389 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2244  protein-glutamate O-methyltransferase  39.48 
 
 
281 aa  203  3e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00847323  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3361  MCP methyltransferase, CheR-type  46.24 
 
 
327 aa  202  4e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0405517  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3302  protein-glutamate O-methyltransferase  42.21 
 
 
265 aa  201  9.999999999999999e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0569  MCP methyltransferase, CheR-type  40.82 
 
 
298 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.429442  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0661  MCP methyltransferase, CheR-type  40.3 
 
 
271 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1796  protein-glutamate O-methyltransferase  42.22 
 
 
294 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2700  MCP methyltransferase, CheR-type  40.91 
 
 
288 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0635  MCP methyltransferase, CheR-type  40.89 
 
 
301 aa  199  3e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2971  MCP methyltransferase, CheR-type  44.74 
 
 
313 aa  199  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000784275 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4376  MCP methyltransferase, CheR-type  40.29 
 
 
295 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.525329  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3204  MCP methyltransferase, CheR-type  41.11 
 
 
285 aa  199  5e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.25041  normal  0.841939 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>