More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2215 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_2215  MCP methyltransferase, CheR-type  100 
 
 
276 aa  578  1e-164  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.556164  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2090  MCP methyltransferase, CheR-type  96.01 
 
 
276 aa  554  1e-157  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.853389 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1884  MCP methyltransferase, CheR-type  95.29 
 
 
276 aa  551  1e-156  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0878954 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2115  protein-glutamate O-methyltransferase  79.35 
 
 
281 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2361  protein-glutamate O-methyltransferase  77.82 
 
 
281 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2244  protein-glutamate O-methyltransferase  77.82 
 
 
281 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00847323  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2101  MCP methyltransferase, CheR-type  77.45 
 
 
281 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.60784  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2124  chemotaxis protein methyltransferase CheR  74.63 
 
 
277 aa  424  1e-118  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3302  protein-glutamate O-methyltransferase  55.34 
 
 
265 aa  305  7e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1932  MCP methyltransferase, CheR-type  52.63 
 
 
283 aa  279  3e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0730  MCP methyltransferase, CheR-type  50.94 
 
 
300 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0443063  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1617  MCP methyltransferase, CheR-type  52.08 
 
 
289 aa  265  8e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0569703 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4154  MCP methyltransferase, CheR-type  48.12 
 
 
273 aa  263  3e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02200  putative chemotaxis protein methyltransferase  52.81 
 
 
280 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.077708  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1405  chemotaxis protein methyltransferase  48.31 
 
 
292 aa  260  2e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.685879  normal  0.0669102 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0159  chemotaxis protein methyltransferase CheR  46.27 
 
 
273 aa  259  3e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0255  putative chemotaxis protein methyltransferase  52.26 
 
 
280 aa  259  3e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4164  MCP methyltransferase, CheR-type  47.57 
 
 
293 aa  258  7e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4052  MCP methyltransferase, CheR-type  47.57 
 
 
293 aa  258  7e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2166  protein-glutamate O-methyltransferase  48.87 
 
 
292 aa  255  6e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00016475  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4376  MCP methyltransferase, CheR-type  47.74 
 
 
295 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.525329  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00055  chemotaxis protein methyltransferase 2  45.93 
 
 
286 aa  253  3e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00310975  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0207  CheR methyltransferase SAM-binding domain-containing protein  44.4 
 
 
270 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24390  protein-glutamate O-methyltransferase. chemotaxis protein  47.43 
 
 
287 aa  251  9.000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.273905  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1845  MCP methyltransferase, CheR-type  45.11 
 
 
289 aa  250  2e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.516279 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3788  MCP methyltransferase, CheR-type  47.41 
 
 
297 aa  246  2e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.236792  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0569  MCP methyltransferase, CheR-type  46.44 
 
 
298 aa  247  2e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.429442  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1077  MCP methyltransferase, CheR-type  46.49 
 
 
300 aa  246  3e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00329536 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3062  MCP methyltransferase, CheR-type  47.41 
 
 
297 aa  246  4e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.509251  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2078  chemotaxis methyltransferase CheR  47.04 
 
 
288 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.687941  hitchhiker  2.73756e-16 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0657  MCP methyltransferase, CheR-type  46.84 
 
 
296 aa  243  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.120935 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2073  chemotaxis methyltransferase CheR  47.04 
 
 
288 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.50771  hitchhiker  0.000251677 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1204  chemotaxis methyltransferase CheR  47.04 
 
 
288 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2174  protein-glutamate O-methyltransferase  47.43 
 
 
296 aa  242  5e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.432884  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2021  MCP methyltransferase, CheR-type  46.04 
 
 
290 aa  242  6e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2133  chemotaxis methyltransferase CheR  46.67 
 
 
288 aa  241  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000021864 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2455  chemotaxis methyltransferase CheR  44.56 
 
 
288 aa  241  7e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1327  chemotaxis methyltransferase CheR  46.67 
 
 
288 aa  241  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000151288 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2622  chemotaxis methyltransferase CheR  45.93 
 
 
286 aa  239  4e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000206628 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3691  chemotaxis regulator, protein-glutamate methyltransferase  46.62 
 
 
303 aa  239  4e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00198927  normal  0.0225149 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1300  chemotaxis methyltransferase CheR  46.3 
 
 
286 aa  239  5e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000891589 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1756  MCP methyltransferase, CheR-type  45.93 
 
 
286 aa  238  5.999999999999999e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0553359  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1980  chemotaxis methyltransferase CheR  45.93 
 
 
286 aa  238  5.999999999999999e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01855  chemotaxis regulator, protein-glutamate methyltransferase  45.93 
 
 
286 aa  238  8e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.435118  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01844  hypothetical protein  45.93 
 
 
286 aa  238  8e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.370669  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2177  chemotaxis methyltransferase CheR  45.93 
 
 
286 aa  238  1e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3811  MCP methyltransferase, CheR-type  44.12 
 
 
318 aa  237  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2117  chemotaxis methyltransferase CheR  45.56 
 
 
286 aa  238  1e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.396301  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1748  chemotaxis methyltransferase CheR  45.93 
 
 
286 aa  238  1e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2700  MCP methyltransferase, CheR-type  45.52 
 
 
288 aa  237  1e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1543  chemotaxis methyltransferase CheR  48.91 
 
 
290 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.520759  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2608  chemotaxis methyltransferase CheR  49.24 
 
 
290 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.215293  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0700  MCP methyltransferase, CheR-type  44.8 
 
 
284 aa  233  3e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.531661 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5610  MCP methyltransferase, CheR-type  44.44 
 
 
303 aa  232  4.0000000000000004e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.503579  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0241  MCP methyltransferase, CheR-type  46.32 
 
 
325 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0215152  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2848  MCP methyltransferase, CheR-type  46.32 
 
 
330 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.242371  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0259  MCP methyltransferase, CheR-type  46.32 
 
 
330 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.000294494  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1515  chemotaxis methyltransferase CheR  47.46 
 
 
290 aa  232  5e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1858  chemotaxis methyltransferase CheR  48.86 
 
 
290 aa  232  6e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3218  MCP methyltransferase, CheR-type  46.82 
 
 
295 aa  231  7.000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.108561 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0168  MCP methyltransferase, CheR-type  46.69 
 
 
328 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.419483 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1043  MCP methyltransferase, CheR-type  46.44 
 
 
283 aa  230  2e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3179  chemotaxis protein methyltransferase CheR  44.85 
 
 
314 aa  230  2e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0757  MCP methyltransferase, CheR-type  44.89 
 
 
275 aa  229  4e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0185  MCP methyltransferase, CheR-type  45.96 
 
 
325 aa  228  6e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3933  chemotaxis protein methyltransferase CheR  44.81 
 
 
315 aa  228  6e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0172  MCP methyltransferase, CheR-type  45.96 
 
 
325 aa  228  6e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.581337  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0073  chemotaxis protein methyltransferase  44.81 
 
 
314 aa  228  8e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3361  MCP methyltransferase, CheR-type  45.22 
 
 
327 aa  228  8e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0405517  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3852  chemotaxis protein methyltransferase  44.81 
 
 
315 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3119  chemotaxis protein methyltransferase CheR  44.44 
 
 
315 aa  226  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.830428  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1687  chemotaxis protein methyltransferase CheR  44.44 
 
 
315 aa  226  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.460756  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2856  chemotaxis protein methyltransferase CheR  44.44 
 
 
314 aa  226  3e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2971  MCP methyltransferase, CheR-type  44.81 
 
 
313 aa  223  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000784275 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0122  MCP methyltransferase, CheR-type  44.12 
 
 
316 aa  223  4e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1756  chemotaxis methyltransferase CheR  46.15 
 
 
295 aa  216  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.456402  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1644  chemotaxis methyltransferase CheR  46.15 
 
 
272 aa  216  2.9999999999999998e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3518  chemotaxis methyltransferase CheR  46.15 
 
 
272 aa  216  2.9999999999999998e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.577755 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2981  chemotaxis methyltransferase CheR  47.69 
 
 
290 aa  216  2.9999999999999998e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2162  protein-glutamate O-methyltransferase  42.54 
 
 
272 aa  213  1.9999999999999998e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0110  MCP methyltransferase, CheR-type  42.76 
 
 
288 aa  210  2e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1595  MCP methyltransferase, CheR-type  39.64 
 
 
284 aa  198  9e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3104  MCP methyltransferase, CheR-type  39.34 
 
 
285 aa  197  2.0000000000000003e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.575775  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2618  MCP methyltransferase, CheR-type  39.48 
 
 
292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0152  chemotaxis protein methyltransferase CheR  39.78 
 
 
276 aa  194  1e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0183  protein-glutamate O-methyltransferase  37.97 
 
 
280 aa  193  3e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2984  protein-glutamate O-methyltransferase  37.59 
 
 
285 aa  191  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0625  MCP methyltransferase, CheR-type  37.81 
 
 
290 aa  188  7e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1143  chemotaxis protein methyltransferase CheR  39.08 
 
 
292 aa  187  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0207024  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2420  MCP methyltransferase, CheR-type  40.3 
 
 
289 aa  187  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.503139  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0163  MCP methyltransferase, CheR-type  38.49 
 
 
280 aa  186  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22590  Protein-glutamate O-methyltransferase  38.06 
 
 
309 aa  187  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3498  protein-glutamate O-methyltransferase  41.79 
 
 
273 aa  187  2e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0281  MCP methyltransferase, CheR-type  38.04 
 
 
292 aa  186  3e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354754  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0783  protein-glutamate O-methyltransferase  39.39 
 
 
269 aa  186  4e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.827996  normal  0.901412 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1405  MCP methyltransferase, CheR-type  38.66 
 
 
284 aa  184  9e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.216379  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0910  chemotaxis protein methyltransferase CheR  38.85 
 
 
269 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2146  MCP methyltransferase, CheR-type  38.38 
 
 
271 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0089  MCP methyltransferase, CheR-type  38.24 
 
 
283 aa  183  2.0000000000000003e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0645  protein-glutamate O-methyltransferase  35.23 
 
 
302 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0464454  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>