More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1756 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_1756  chemotaxis methyltransferase CheR  100 
 
 
295 aa  612  9.999999999999999e-175  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.456402  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1644  chemotaxis methyltransferase CheR  100 
 
 
272 aa  566  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3518  chemotaxis methyltransferase CheR  100 
 
 
272 aa  566  1e-160  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.577755 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2608  chemotaxis methyltransferase CheR  83.45 
 
 
290 aa  499  1e-140  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.215293  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1858  chemotaxis methyltransferase CheR  82.76 
 
 
290 aa  497  1e-140  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1515  chemotaxis methyltransferase CheR  81.38 
 
 
290 aa  495  1e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2981  chemotaxis methyltransferase CheR  83.45 
 
 
290 aa  491  9.999999999999999e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1543  chemotaxis methyltransferase CheR  81.38 
 
 
290 aa  489  1e-137  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.520759  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1327  chemotaxis methyltransferase CheR  72.89 
 
 
288 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000151288 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1204  chemotaxis methyltransferase CheR  72.89 
 
 
288 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2073  chemotaxis methyltransferase CheR  72.89 
 
 
288 aa  441  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.50771  hitchhiker  0.000251677 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2078  chemotaxis methyltransferase CheR  72.89 
 
 
288 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.687941  hitchhiker  2.73756e-16 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2133  chemotaxis methyltransferase CheR  72.89 
 
 
288 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000021864 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2455  chemotaxis methyltransferase CheR  71.33 
 
 
288 aa  436  1e-121  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1756  MCP methyltransferase, CheR-type  71.73 
 
 
286 aa  431  1e-120  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0553359  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1980  chemotaxis methyltransferase CheR  71.73 
 
 
286 aa  431  1e-120  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2622  chemotaxis methyltransferase CheR  71.73 
 
 
286 aa  432  1e-120  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000206628 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2177  chemotaxis methyltransferase CheR  71.73 
 
 
286 aa  431  1e-120  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1748  chemotaxis methyltransferase CheR  71.73 
 
 
286 aa  431  1e-120  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01855  chemotaxis regulator, protein-glutamate methyltransferase  71.73 
 
 
286 aa  431  1e-119  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.435118  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1300  chemotaxis methyltransferase CheR  71.38 
 
 
286 aa  427  1e-119  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000891589 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2117  chemotaxis methyltransferase CheR  71.38 
 
 
286 aa  430  1e-119  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.396301  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01844  hypothetical protein  71.73 
 
 
286 aa  431  1e-119  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.370669  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3691  chemotaxis regulator, protein-glutamate methyltransferase  63.4 
 
 
303 aa  353  2e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00198927  normal  0.0225149 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5610  MCP methyltransferase, CheR-type  61.13 
 
 
303 aa  349  4e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.503579  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2021  MCP methyltransferase, CheR-type  59.43 
 
 
290 aa  345  4e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24390  protein-glutamate O-methyltransferase. chemotaxis protein  61.57 
 
 
287 aa  337  1.9999999999999998e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.273905  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3811  MCP methyltransferase, CheR-type  55.82 
 
 
318 aa  333  2e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4154  MCP methyltransferase, CheR-type  55.51 
 
 
273 aa  322  6e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2971  MCP methyltransferase, CheR-type  54.98 
 
 
313 aa  320  3e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000784275 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0122  MCP methyltransferase, CheR-type  56.51 
 
 
316 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1932  MCP methyltransferase, CheR-type  55.97 
 
 
283 aa  316  2e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0168  MCP methyltransferase, CheR-type  58.62 
 
 
328 aa  315  8e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.419483 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1617  MCP methyltransferase, CheR-type  58.37 
 
 
289 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0569703 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0172  MCP methyltransferase, CheR-type  59 
 
 
325 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.581337  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0185  MCP methyltransferase, CheR-type  59 
 
 
325 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1405  chemotaxis protein methyltransferase  54.79 
 
 
292 aa  310  2e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.685879  normal  0.0669102 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3361  MCP methyltransferase, CheR-type  57.47 
 
 
327 aa  310  2e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0405517  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0241  MCP methyltransferase, CheR-type  58.24 
 
 
325 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0215152  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2848  MCP methyltransferase, CheR-type  58.24 
 
 
330 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.242371  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0259  MCP methyltransferase, CheR-type  58.24 
 
 
330 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.000294494  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3179  chemotaxis protein methyltransferase CheR  56.39 
 
 
314 aa  309  4e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3852  chemotaxis protein methyltransferase  56.77 
 
 
315 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3933  chemotaxis protein methyltransferase CheR  56.39 
 
 
315 aa  308  8e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2856  chemotaxis protein methyltransferase CheR  56.39 
 
 
314 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0073  chemotaxis protein methyltransferase  56.39 
 
 
314 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1687  chemotaxis protein methyltransferase CheR  56.39 
 
 
315 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.460756  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3119  chemotaxis protein methyltransferase CheR  56.39 
 
 
315 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.830428  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4052  MCP methyltransferase, CheR-type  53.26 
 
 
293 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4164  MCP methyltransferase, CheR-type  53.26 
 
 
293 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1077  MCP methyltransferase, CheR-type  54.55 
 
 
300 aa  297  2e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00329536 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0730  MCP methyltransferase, CheR-type  49.65 
 
 
300 aa  287  1e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0443063  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2166  protein-glutamate O-methyltransferase  53.61 
 
 
292 aa  285  5.999999999999999e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00016475  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0159  chemotaxis protein methyltransferase CheR  51.32 
 
 
273 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3788  MCP methyltransferase, CheR-type  55.86 
 
 
297 aa  282  5.000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.236792  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3062  MCP methyltransferase, CheR-type  55.47 
 
 
297 aa  281  7.000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.509251  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0207  CheR methyltransferase SAM-binding domain-containing protein  50.57 
 
 
270 aa  279  3e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0657  MCP methyltransferase, CheR-type  52.53 
 
 
296 aa  278  8e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.120935 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4376  MCP methyltransferase, CheR-type  50.18 
 
 
295 aa  277  2e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.525329  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1845  MCP methyltransferase, CheR-type  51.08 
 
 
289 aa  275  7e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.516279 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2174  protein-glutamate O-methyltransferase  50.17 
 
 
296 aa  272  5.000000000000001e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.432884  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2700  MCP methyltransferase, CheR-type  53.28 
 
 
288 aa  271  7e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00055  chemotaxis protein methyltransferase 2  51.15 
 
 
286 aa  270  2e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00310975  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0569  MCP methyltransferase, CheR-type  50.96 
 
 
298 aa  268  5.9999999999999995e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.429442  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0700  MCP methyltransferase, CheR-type  52.45 
 
 
284 aa  267  1e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.531661 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0255  putative chemotaxis protein methyltransferase  57.36 
 
 
280 aa  259  3e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1043  MCP methyltransferase, CheR-type  51.33 
 
 
283 aa  258  8e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3218  MCP methyltransferase, CheR-type  50.19 
 
 
295 aa  257  2e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.108561 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02200  putative chemotaxis protein methyltransferase  55.43 
 
 
280 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.077708  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2124  chemotaxis protein methyltransferase CheR  46.54 
 
 
277 aa  236  2e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0163  MCP methyltransferase, CheR-type  48.46 
 
 
280 aa  235  5.0000000000000005e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1884  MCP methyltransferase, CheR-type  45.77 
 
 
276 aa  235  8e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0878954 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2215  MCP methyltransferase, CheR-type  46.15 
 
 
276 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.556164  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2162  protein-glutamate O-methyltransferase  47.27 
 
 
272 aa  233  2.0000000000000002e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2244  protein-glutamate O-methyltransferase  46.33 
 
 
281 aa  232  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00847323  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2115  protein-glutamate O-methyltransferase  44.73 
 
 
281 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2090  MCP methyltransferase, CheR-type  45.77 
 
 
276 aa  232  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.853389 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2101  MCP methyltransferase, CheR-type  46.33 
 
 
281 aa  232  5e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.60784  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0757  MCP methyltransferase, CheR-type  43.61 
 
 
275 aa  231  1e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2361  protein-glutamate O-methyltransferase  46.33 
 
 
281 aa  230  2e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0110  MCP methyltransferase, CheR-type  46.84 
 
 
288 aa  229  5e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0183  protein-glutamate O-methyltransferase  47.31 
 
 
280 aa  226  3e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3302  protein-glutamate O-methyltransferase  42.75 
 
 
265 aa  220  1.9999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2146  MCP methyltransferase, CheR-type  43.43 
 
 
271 aa  217  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3104  MCP methyltransferase, CheR-type  40.64 
 
 
285 aa  211  1e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.575775  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0661  MCP methyltransferase, CheR-type  40.93 
 
 
271 aa  205  7e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3498  protein-glutamate O-methyltransferase  45.99 
 
 
273 aa  205  7e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0152  chemotaxis protein methyltransferase CheR  41.7 
 
 
276 aa  203  3e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0281  MCP methyltransferase, CheR-type  41.42 
 
 
292 aa  202  6e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354754  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22590  Protein-glutamate O-methyltransferase  38.67 
 
 
309 aa  202  7e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0089  MCP methyltransferase, CheR-type  37.01 
 
 
283 aa  202  8e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1796  protein-glutamate O-methyltransferase  41.07 
 
 
294 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1143  chemotaxis protein methyltransferase CheR  38.79 
 
 
292 aa  191  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0207024  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2710  protein-glutamate O-methyltransferase  40.58 
 
 
298 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0904  MCP methyltransferase, CheR-type  40.98 
 
 
267 aa  188  7e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0428  MCP methyltransferase, CheR-type  40.15 
 
 
275 aa  188  7e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.235925  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0910  chemotaxis protein methyltransferase CheR  38.87 
 
 
269 aa  188  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0335  MCP methyltransferase, CheR-type  42.52 
 
 
280 aa  187  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2420  MCP methyltransferase, CheR-type  38.38 
 
 
289 aa  186  3e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.503139  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0635  MCP methyltransferase, CheR-type  36.48 
 
 
301 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>