More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0657 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_0657  MCP methyltransferase, CheR-type  100 
 
 
296 aa  612  9.999999999999999e-175  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.120935 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0569  MCP methyltransferase, CheR-type  77.24 
 
 
298 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.429442  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4376  MCP methyltransferase, CheR-type  76.19 
 
 
295 aa  463  1e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.525329  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3788  MCP methyltransferase, CheR-type  78.15 
 
 
297 aa  442  1e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.236792  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3062  MCP methyltransferase, CheR-type  78.15 
 
 
297 aa  441  1e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.509251  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2174  protein-glutamate O-methyltransferase  70.1 
 
 
296 aa  423  1e-117  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.432884  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2700  MCP methyltransferase, CheR-type  61.64 
 
 
288 aa  355  5.999999999999999e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0700  MCP methyltransferase, CheR-type  60.07 
 
 
284 aa  348  6e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.531661 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1617  MCP methyltransferase, CheR-type  58.11 
 
 
289 aa  312  3.9999999999999997e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0569703 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1932  MCP methyltransferase, CheR-type  55.06 
 
 
283 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0730  MCP methyltransferase, CheR-type  54.65 
 
 
300 aa  303  2.0000000000000002e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0443063  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3811  MCP methyltransferase, CheR-type  55.15 
 
 
318 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0241  MCP methyltransferase, CheR-type  52.9 
 
 
325 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0215152  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1405  chemotaxis protein methyltransferase  51.82 
 
 
292 aa  290  2e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.685879  normal  0.0669102 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2848  MCP methyltransferase, CheR-type  54.65 
 
 
330 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.242371  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0259  MCP methyltransferase, CheR-type  54.65 
 
 
330 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.000294494  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0122  MCP methyltransferase, CheR-type  55.51 
 
 
316 aa  289  3e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0168  MCP methyltransferase, CheR-type  55.02 
 
 
328 aa  289  3e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.419483 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5610  MCP methyltransferase, CheR-type  54.48 
 
 
303 aa  289  5.0000000000000004e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.503579  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4164  MCP methyltransferase, CheR-type  51.46 
 
 
293 aa  287  1e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4052  MCP methyltransferase, CheR-type  51.46 
 
 
293 aa  287  1e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3691  chemotaxis regulator, protein-glutamate methyltransferase  54.51 
 
 
303 aa  287  1e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00198927  normal  0.0225149 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3179  chemotaxis protein methyltransferase CheR  53.15 
 
 
314 aa  286  2e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0172  MCP methyltransferase, CheR-type  52.63 
 
 
325 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.581337  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0185  MCP methyltransferase, CheR-type  54.28 
 
 
325 aa  285  7e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3361  MCP methyltransferase, CheR-type  53.53 
 
 
327 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0405517  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3852  chemotaxis protein methyltransferase  52.8 
 
 
315 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0073  chemotaxis protein methyltransferase  52.45 
 
 
314 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2608  chemotaxis methyltransferase CheR  55.94 
 
 
290 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.215293  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1515  chemotaxis methyltransferase CheR  55.56 
 
 
290 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2856  chemotaxis protein methyltransferase CheR  52.45 
 
 
314 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2971  MCP methyltransferase, CheR-type  54.07 
 
 
313 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000784275 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3933  chemotaxis protein methyltransferase CheR  52.45 
 
 
315 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3119  chemotaxis protein methyltransferase CheR  52.45 
 
 
315 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.830428  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1687  chemotaxis protein methyltransferase CheR  52.45 
 
 
315 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.460756  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4154  MCP methyltransferase, CheR-type  52.81 
 
 
273 aa  281  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1858  chemotaxis methyltransferase CheR  55.17 
 
 
290 aa  281  1e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1077  MCP methyltransferase, CheR-type  51.08 
 
 
300 aa  281  1e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00329536 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1543  chemotaxis methyltransferase CheR  54.86 
 
 
290 aa  280  3e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.520759  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1327  chemotaxis methyltransferase CheR  50.36 
 
 
288 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000151288 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2133  chemotaxis methyltransferase CheR  50.36 
 
 
288 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000021864 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1204  chemotaxis methyltransferase CheR  50.36 
 
 
288 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2078  chemotaxis methyltransferase CheR  50.36 
 
 
288 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.687941  hitchhiker  2.73756e-16 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2073  chemotaxis methyltransferase CheR  50.36 
 
 
288 aa  272  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.50771  hitchhiker  0.000251677 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2455  chemotaxis methyltransferase CheR  49.64 
 
 
288 aa  272  6e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2021  MCP methyltransferase, CheR-type  49.44 
 
 
290 aa  270  2e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2622  chemotaxis methyltransferase CheR  49.28 
 
 
286 aa  270  2e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000206628 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1300  chemotaxis methyltransferase CheR  49.64 
 
 
286 aa  269  4e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000891589 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1756  MCP methyltransferase, CheR-type  51.34 
 
 
286 aa  269  5e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0553359  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1980  chemotaxis methyltransferase CheR  51.34 
 
 
286 aa  269  5e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2117  chemotaxis methyltransferase CheR  51.34 
 
 
286 aa  268  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.396301  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1748  chemotaxis methyltransferase CheR  51.34 
 
 
286 aa  268  7e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2177  chemotaxis methyltransferase CheR  51.34 
 
 
286 aa  268  7e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01855  chemotaxis regulator, protein-glutamate methyltransferase  51.34 
 
 
286 aa  268  8e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.435118  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01844  hypothetical protein  51.34 
 
 
286 aa  268  8e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.370669  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2166  protein-glutamate O-methyltransferase  48.01 
 
 
292 aa  268  8e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00016475  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0159  chemotaxis protein methyltransferase CheR  49.25 
 
 
273 aa  268  1e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1756  chemotaxis methyltransferase CheR  52.53 
 
 
295 aa  266  4e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.456402  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0207  CheR methyltransferase SAM-binding domain-containing protein  48.5 
 
 
270 aa  265  8e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3518  chemotaxis methyltransferase CheR  52.53 
 
 
272 aa  265  1e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.577755 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1644  chemotaxis methyltransferase CheR  52.53 
 
 
272 aa  265  1e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2981  chemotaxis methyltransferase CheR  55.04 
 
 
290 aa  263  2e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24390  protein-glutamate O-methyltransferase. chemotaxis protein  50 
 
 
287 aa  263  2e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.273905  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00055  chemotaxis protein methyltransferase 2  48.35 
 
 
286 aa  263  3e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00310975  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1043  MCP methyltransferase, CheR-type  49.28 
 
 
283 aa  259  4e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1845  MCP methyltransferase, CheR-type  48.91 
 
 
289 aa  258  7e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.516279 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3218  MCP methyltransferase, CheR-type  48.56 
 
 
295 aa  257  2e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.108561 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2124  chemotaxis protein methyltransferase CheR  46.47 
 
 
277 aa  245  6e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2215  MCP methyltransferase, CheR-type  46.84 
 
 
276 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.556164  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2090  MCP methyltransferase, CheR-type  46.1 
 
 
276 aa  241  7e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.853389 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2115  protein-glutamate O-methyltransferase  46.82 
 
 
281 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3302  protein-glutamate O-methyltransferase  43.23 
 
 
265 aa  241  1e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1884  MCP methyltransferase, CheR-type  46.1 
 
 
276 aa  241  1e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0878954 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2361  protein-glutamate O-methyltransferase  45.62 
 
 
281 aa  235  6e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2101  MCP methyltransferase, CheR-type  45.62 
 
 
281 aa  235  6e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.60784  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2244  protein-glutamate O-methyltransferase  45.26 
 
 
281 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00847323  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0757  MCP methyltransferase, CheR-type  40.81 
 
 
275 aa  229  3e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02200  putative chemotaxis protein methyltransferase  48.91 
 
 
280 aa  229  4e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.077708  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0255  putative chemotaxis protein methyltransferase  49.1 
 
 
280 aa  228  8e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2162  protein-glutamate O-methyltransferase  44.61 
 
 
272 aa  228  1e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0152  chemotaxis protein methyltransferase CheR  40.88 
 
 
276 aa  210  3e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0110  MCP methyltransferase, CheR-type  40.37 
 
 
288 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3104  MCP methyltransferase, CheR-type  39.13 
 
 
285 aa  199  3e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.575775  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0661  MCP methyltransferase, CheR-type  37.69 
 
 
271 aa  198  7.999999999999999e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0183  protein-glutamate O-methyltransferase  39.08 
 
 
280 aa  197  3e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22590  Protein-glutamate O-methyltransferase  36.92 
 
 
309 aa  196  5.000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0163  MCP methyltransferase, CheR-type  38.31 
 
 
280 aa  194  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0089  MCP methyltransferase, CheR-type  37.02 
 
 
283 aa  192  6e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0281  MCP methyltransferase, CheR-type  39.86 
 
 
292 aa  192  6e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354754  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2618  MCP methyltransferase, CheR-type  38.19 
 
 
292 aa  191  1e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2325  chemotaxis protein methyltransferase CheR  36.26 
 
 
275 aa  190  2e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1796  protein-glutamate O-methyltransferase  40.94 
 
 
294 aa  190  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1595  MCP methyltransferase, CheR-type  38.19 
 
 
284 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2710  protein-glutamate O-methyltransferase  40.29 
 
 
298 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2146  MCP methyltransferase, CheR-type  38.27 
 
 
271 aa  186  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3498  protein-glutamate O-methyltransferase  39.7 
 
 
273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4074  chemotaxis methyltransferase  36.69 
 
 
302 aa  183  4.0000000000000006e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2420  MCP methyltransferase, CheR-type  38.13 
 
 
289 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.503139  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1143  chemotaxis protein methyltransferase CheR  37.13 
 
 
292 aa  181  9.000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0207024  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0332  MCP methyltransferase, CheR-type  36.46 
 
 
302 aa  180  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.284961 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>