More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0152 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009456  VC0395_0152  chemotaxis protein methyltransferase CheR  100 
 
 
276 aa  575  1.0000000000000001e-163  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0163  MCP methyltransferase, CheR-type  45.83 
 
 
280 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0183  protein-glutamate O-methyltransferase  44.53 
 
 
280 aa  238  5.999999999999999e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0110  MCP methyltransferase, CheR-type  45.45 
 
 
288 aa  238  8e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3104  MCP methyltransferase, CheR-type  41.85 
 
 
285 aa  229  4e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.575775  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2146  MCP methyltransferase, CheR-type  42.12 
 
 
271 aa  227  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0757  MCP methyltransferase, CheR-type  40.66 
 
 
275 aa  227  2e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1077  MCP methyltransferase, CheR-type  42.44 
 
 
300 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00329536 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2162  protein-glutamate O-methyltransferase  40.96 
 
 
272 aa  220  1.9999999999999999e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3498  protein-glutamate O-methyltransferase  43.45 
 
 
273 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4154  MCP methyltransferase, CheR-type  40.96 
 
 
273 aa  212  5.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1043  MCP methyltransferase, CheR-type  41.42 
 
 
283 aa  210  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0657  MCP methyltransferase, CheR-type  40.88 
 
 
296 aa  210  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.120935 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1595  MCP methyltransferase, CheR-type  39.11 
 
 
284 aa  208  6e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0569  MCP methyltransferase, CheR-type  40.66 
 
 
298 aa  208  7e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.429442  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0645  protein-glutamate O-methyltransferase  37.78 
 
 
302 aa  208  7e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0464454  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0635  MCP methyltransferase, CheR-type  39.41 
 
 
301 aa  207  1e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2618  MCP methyltransferase, CheR-type  38.81 
 
 
292 aa  207  1e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3218  MCP methyltransferase, CheR-type  40.67 
 
 
295 aa  207  1e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.108561 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0626  MCP methyltransferase, CheR-type  39.03 
 
 
301 aa  206  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.325159  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3691  chemotaxis regulator, protein-glutamate methyltransferase  41.82 
 
 
303 aa  206  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00198927  normal  0.0225149 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2166  protein-glutamate O-methyltransferase  42.34 
 
 
292 aa  206  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00016475  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1617  MCP methyltransferase, CheR-type  39.93 
 
 
289 aa  205  5e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0569703 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2622  chemotaxis methyltransferase CheR  41.54 
 
 
286 aa  205  6e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000206628 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4376  MCP methyltransferase, CheR-type  40.29 
 
 
295 aa  205  8e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.525329  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1756  MCP methyltransferase, CheR-type  41.54 
 
 
286 aa  204  9e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0553359  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1405  chemotaxis protein methyltransferase  39.49 
 
 
292 aa  204  9e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.685879  normal  0.0669102 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1980  chemotaxis methyltransferase CheR  41.54 
 
 
286 aa  204  9e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2177  chemotaxis methyltransferase CheR  41.54 
 
 
286 aa  204  1e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2021  MCP methyltransferase, CheR-type  39.13 
 
 
290 aa  204  1e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1748  chemotaxis methyltransferase CheR  41.54 
 
 
286 aa  204  1e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01855  chemotaxis regulator, protein-glutamate methyltransferase  41.54 
 
 
286 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.435118  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1300  chemotaxis methyltransferase CheR  41.54 
 
 
286 aa  204  2e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000891589 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01844  hypothetical protein  41.54 
 
 
286 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.370669  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3204  MCP methyltransferase, CheR-type  39.78 
 
 
285 aa  203  2e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.25041  normal  0.841939 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3179  chemotaxis protein methyltransferase CheR  41.85 
 
 
314 aa  203  3e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2117  chemotaxis methyltransferase CheR  41.18 
 
 
286 aa  203  3e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.396301  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2078  chemotaxis methyltransferase CheR  40.44 
 
 
288 aa  202  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.687941  hitchhiker  2.73756e-16 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2073  chemotaxis methyltransferase CheR  40.44 
 
 
288 aa  202  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.50771  hitchhiker  0.000251677 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4052  MCP methyltransferase, CheR-type  39.86 
 
 
293 aa  202  5e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1327  chemotaxis methyltransferase CheR  40.44 
 
 
288 aa  202  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000151288 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2700  MCP methyltransferase, CheR-type  40 
 
 
288 aa  202  5e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1204  chemotaxis methyltransferase CheR  40.44 
 
 
288 aa  202  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2133  chemotaxis methyltransferase CheR  40.44 
 
 
288 aa  202  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000021864 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3062  MCP methyltransferase, CheR-type  39.71 
 
 
297 aa  202  5e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.509251  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22590  Protein-glutamate O-methyltransferase  42.08 
 
 
309 aa  202  5e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4164  MCP methyltransferase, CheR-type  39.86 
 
 
293 aa  202  5e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5610  MCP methyltransferase, CheR-type  40.51 
 
 
303 aa  202  6e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.503579  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3788  MCP methyltransferase, CheR-type  39.71 
 
 
297 aa  202  6e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.236792  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2856  chemotaxis protein methyltransferase CheR  41.85 
 
 
314 aa  201  9e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0073  chemotaxis protein methyltransferase  41.85 
 
 
314 aa  201  9e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3119  chemotaxis protein methyltransferase CheR  41.85 
 
 
315 aa  201  9e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.830428  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1687  chemotaxis protein methyltransferase CheR  41.85 
 
 
315 aa  201  9e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.460756  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3933  chemotaxis protein methyltransferase CheR  41.85 
 
 
315 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3811  MCP methyltransferase, CheR-type  38.52 
 
 
318 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2608  chemotaxis methyltransferase CheR  42.48 
 
 
290 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.215293  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3302  protein-glutamate O-methyltransferase  38.01 
 
 
265 aa  200  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3852  chemotaxis protein methyltransferase  41.48 
 
 
315 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2174  protein-glutamate O-methyltransferase  39.27 
 
 
296 aa  200  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.432884  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2124  chemotaxis protein methyltransferase CheR  39.63 
 
 
277 aa  199  3e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2090  MCP methyltransferase, CheR-type  40.15 
 
 
276 aa  199  3e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.853389 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1098  protein-glutamate O-methyltransferase  40.62 
 
 
305 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0159  chemotaxis protein methyltransferase CheR  37.59 
 
 
273 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0089  MCP methyltransferase, CheR-type  38.52 
 
 
283 aa  199  5e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2434  putative MCP methyltransferase, CheR1  40.62 
 
 
305 aa  199  6e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1884  MCP methyltransferase, CheR-type  40.15 
 
 
276 aa  198  6e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0878954 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1143  chemotaxis protein methyltransferase CheR  38.97 
 
 
292 aa  198  7e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0207024  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2455  chemotaxis methyltransferase CheR  39.71 
 
 
288 aa  198  7e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0730  MCP methyltransferase, CheR-type  39.49 
 
 
300 aa  198  7.999999999999999e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0443063  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0168  MCP methyltransferase, CheR-type  41.48 
 
 
328 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.419483 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1932  MCP methyltransferase, CheR-type  38.6 
 
 
283 aa  198  7.999999999999999e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0601  MCP methyltransferase, CheR-type  38.29 
 
 
299 aa  198  9e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0700  MCP methyltransferase, CheR-type  40 
 
 
284 aa  198  9e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.531661 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1858  chemotaxis methyltransferase CheR  42.11 
 
 
290 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2115  protein-glutamate O-methyltransferase  40.37 
 
 
281 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0281  MCP methyltransferase, CheR-type  39.29 
 
 
292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354754  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0255  putative chemotaxis protein methyltransferase  40.37 
 
 
280 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02200  putative chemotaxis protein methyltransferase  40.37 
 
 
280 aa  196  3e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.077708  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0207  CheR methyltransferase SAM-binding domain-containing protein  38.15 
 
 
270 aa  196  3e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2101  MCP methyltransferase, CheR-type  38.52 
 
 
281 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.60784  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00055  chemotaxis protein methyltransferase 2  38.99 
 
 
286 aa  195  6e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00310975  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1543  chemotaxis methyltransferase CheR  41.85 
 
 
290 aa  195  7e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.520759  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1845  MCP methyltransferase, CheR-type  39.35 
 
 
289 aa  195  9e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.516279 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2361  protein-glutamate O-methyltransferase  38.52 
 
 
281 aa  195  9e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1515  chemotaxis methyltransferase CheR  41.45 
 
 
290 aa  194  9e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1415  MCP methyltransferase, CheR-type  36.26 
 
 
281 aa  194  1e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.299383  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1756  chemotaxis methyltransferase CheR  41.7 
 
 
295 aa  194  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.456402  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2215  MCP methyltransferase, CheR-type  39.78 
 
 
276 aa  194  1e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.556164  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1644  chemotaxis methyltransferase CheR  41.7 
 
 
272 aa  194  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3518  chemotaxis methyltransferase CheR  41.7 
 
 
272 aa  194  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.577755 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0241  MCP methyltransferase, CheR-type  41.11 
 
 
325 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0215152  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0185  MCP methyltransferase, CheR-type  41.11 
 
 
325 aa  192  6e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2848  MCP methyltransferase, CheR-type  41.11 
 
 
330 aa  192  6e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.242371  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0172  MCP methyltransferase, CheR-type  41.11 
 
 
325 aa  192  6e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.581337  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0259  MCP methyltransferase, CheR-type  41.11 
 
 
330 aa  192  6e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.000294494  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2105  MCP methyltransferase, CheR-type  37.04 
 
 
283 aa  191  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0122  MCP methyltransferase, CheR-type  39.26 
 
 
316 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1405  MCP methyltransferase, CheR-type  37.96 
 
 
284 aa  190  2e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.216379  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2244  protein-glutamate O-methyltransferase  38.15 
 
 
281 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00847323  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2420  MCP methyltransferase, CheR-type  37.27 
 
 
289 aa  189  4e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.503139  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>