More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0110 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0110  MCP methyltransferase, CheR-type  100 
 
 		 288 aa  601  1.0000000000000001e-171  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0183  protein-glutamate O-methyltransferase  63.36 
 
 		 280 aa  364  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0163  MCP methyltransferase, CheR-type  64.12 
 
 		 280 aa  361  6e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3498  protein-glutamate O-methyltransferase  65.54 
 
 		 273 aa  345  3e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3104  MCP methyltransferase, CheR-type  47.97 
 
 		 285 aa  273  2.0000000000000002e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.575775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0757  MCP methyltransferase, CheR-type  44.85 
 
 		 275 aa  260  2e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2146  MCP methyltransferase, CheR-type  49.63 
 
 		 271 aa  256  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22590  Protein-glutamate O-methyltransferase  46.67 
 
 		 309 aa  252  4.0000000000000004e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0152  chemotaxis protein methyltransferase CheR  45.45 
 
 		 276 aa  238  9e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1617  MCP methyltransferase, CheR-type  46.13 
 
 		 289 aa  234  9e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0569703 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2622  chemotaxis methyltransferase CheR  48.33 
 
 		 286 aa  232  5e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000206628 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1756  MCP methyltransferase, CheR-type  48.33 
 
 		 286 aa  231  8.000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0553359  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2177  chemotaxis methyltransferase CheR  48.33 
 
 		 286 aa  231  8.000000000000001e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1980  chemotaxis methyltransferase CheR  48.33 
 
 		 286 aa  231  8.000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1748  chemotaxis methyltransferase CheR  48.33 
 
 		 286 aa  231  8.000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01855  chemotaxis regulator, protein-glutamate methyltransferase  48.33 
 
 		 286 aa  231  1e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.435118  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01844  hypothetical protein  48.33 
 
 		 286 aa  231  1e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.370669  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2117  chemotaxis methyltransferase CheR  47.96 
 
 		 286 aa  229  3e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.396301  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1300  chemotaxis methyltransferase CheR  47.96 
 
 		 286 aa  229  4e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000891589 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1204  chemotaxis methyltransferase CheR  47.58 
 
 		 288 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2078  chemotaxis methyltransferase CheR  47.58 
 
 		 288 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.687941  hitchhiker  2.73756e-16 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2073  chemotaxis methyltransferase CheR  47.58 
 
 		 288 aa  226  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.50771  hitchhiker  0.000251677 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1515  chemotaxis methyltransferase CheR  47.96 
 
 		 290 aa  226  4e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2133  chemotaxis methyltransferase CheR  47.21 
 
 		 288 aa  225  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000021864 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1327  chemotaxis methyltransferase CheR  47.21 
 
 		 288 aa  225  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000151288 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2434  putative MCP methyltransferase, CheR1  43.45 
 
 		 305 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1098  protein-glutamate O-methyltransferase  43.45 
 
 		 305 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2162  protein-glutamate O-methyltransferase  43.59 
 
 		 272 aa  224  2e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1543  chemotaxis methyltransferase CheR  47.96 
 
 		 290 aa  223  4e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.520759  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2455  chemotaxis methyltransferase CheR  45.72 
 
 		 288 aa  223  4e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2608  chemotaxis methyltransferase CheR  47.57 
 
 		 290 aa  222  6e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.215293  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4052  MCP methyltransferase, CheR-type  44.72 
 
 		 293 aa  222  7e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4164  MCP methyltransferase, CheR-type  44.72 
 
 		 293 aa  222  7e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2166  protein-glutamate O-methyltransferase  46.27 
 
 		 292 aa  221  8e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00016475  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0730  MCP methyltransferase, CheR-type  43.82 
 
 		 300 aa  221  9e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0443063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1932  MCP methyltransferase, CheR-type  44.57 
 
 		 283 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1858  chemotaxis methyltransferase CheR  47.57 
 
 		 290 aa  221  9.999999999999999e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0089  MCP methyltransferase, CheR-type  40.66 
 
 		 283 aa  221  1.9999999999999999e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0281  MCP methyltransferase, CheR-type  41.76 
 
 		 292 aa  220  1.9999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5610  MCP methyltransferase, CheR-type  45.29 
 
 		 303 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.503579  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4074  chemotaxis methyltransferase  42.28 
 
 		 302 aa  219  3.9999999999999997e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1405  chemotaxis protein methyltransferase  43.66 
 
 		 292 aa  218  7.999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.685879  normal  0.0669102 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1444  MCP methyltransferase, CheR-type  41.73 
 
 		 300 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3625  MCP methyltransferase, CheR-type  42.12 
 
 		 298 aa  217  2e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0636111 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1043  MCP methyltransferase, CheR-type  46.24 
 
 		 283 aa  217  2e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1077  MCP methyltransferase, CheR-type  43.8 
 
 		 300 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329536 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0300  MCP methyltransferase, CheR-type  41.28 
 
 		 302 aa  216  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000961073  normal  0.256387 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0332  MCP methyltransferase, CheR-type  41.28 
 
 		 302 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.284961 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3691  chemotaxis regulator, protein-glutamate methyltransferase  44.81 
 
 		 303 aa  215  7e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00198927  normal  0.0225149 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1756  chemotaxis methyltransferase CheR  46.84 
 
 		 295 aa  214  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.456402  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3518  chemotaxis methyltransferase CheR  46.84 
 
 		 272 aa  214  1.9999999999999998e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.577755 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1644  chemotaxis methyltransferase CheR  46.84 
 
 		 272 aa  214  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0237  protein-glutamate O-methyltransferase  42.28 
 
 		 307 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.291409 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0635  MCP methyltransferase, CheR-type  42.01 
 
 		 301 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0626  MCP methyltransferase, CheR-type  42.01 
 
 		 301 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.325159  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2710  protein-glutamate O-methyltransferase  41.02 
 
 		 298 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3218  MCP methyltransferase, CheR-type  45.49 
 
 		 295 aa  212  4.9999999999999996e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.108561 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3811  MCP methyltransferase, CheR-type  44.93 
 
 		 318 aa  211  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4154  MCP methyltransferase, CheR-type  43.28 
 
 		 273 aa  211  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0159  chemotaxis protein methyltransferase CheR  41.54 
 
 		 273 aa  210  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2021  MCP methyltransferase, CheR-type  40.66 
 
 		 290 aa  210  2e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2215  MCP methyltransferase, CheR-type  42.76 
 
 		 276 aa  210  2e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.556164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1845  MCP methyltransferase, CheR-type  43.96 
 
 		 289 aa  209  4e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.516279 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1796  protein-glutamate O-methyltransferase  44.2 
 
 		 294 aa  209  4e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0645  protein-glutamate O-methyltransferase  40.37 
 
 		 302 aa  209  5e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0464454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2981  chemotaxis methyltransferase CheR  46.84 
 
 		 290 aa  207  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3469  MCP methyltransferase, CheR-type  41.35 
 
 		 280 aa  207  2e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.912759  normal  0.640591 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0601  MCP methyltransferase, CheR-type  41.26 
 
 		 299 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0428  MCP methyltransferase, CheR-type  42.22 
 
 		 275 aa  207  2e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.235925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0207  CheR methyltransferase SAM-binding domain-containing protein  41.26 
 
 		 270 aa  206  3e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0255  putative chemotaxis protein methyltransferase  44.78 
 
 		 280 aa  205  9e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0700  MCP methyltransferase, CheR-type  41.3 
 
 		 284 aa  204  1e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.531661 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24390  protein-glutamate O-methyltransferase. chemotaxis protein  41.61 
 
 		 287 aa  204  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.273905  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2115  protein-glutamate O-methyltransferase  40.81 
 
 		 281 aa  203  2e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2090  MCP methyltransferase, CheR-type  41.7 
 
 		 276 aa  203  3e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.853389 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2361  protein-glutamate O-methyltransferase  40.74 
 
 		 281 aa  202  5e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2101  MCP methyltransferase, CheR-type  40.74 
 
 		 281 aa  202  5e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.60784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00055  chemotaxis protein methyltransferase 2  40.81 
 
 		 286 aa  202  7e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00310975  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02200  putative chemotaxis protein methyltransferase  43.49 
 
 		 280 aa  202  7e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.077708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1884  MCP methyltransferase, CheR-type  41.45 
 
 		 276 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0878954 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2700  MCP methyltransferase, CheR-type  40 
 
 		 288 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0657  MCP methyltransferase, CheR-type  40.37 
 
 		 296 aa  200  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120935 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2244  protein-glutamate O-methyltransferase  40.37 
 
 		 281 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00847323  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4376  MCP methyltransferase, CheR-type  41.26 
 
 		 295 aa  200  3e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.525329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3788  MCP methyltransferase, CheR-type  39.78 
 
 		 297 aa  198  7.999999999999999e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.236792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3062  MCP methyltransferase, CheR-type  39.78 
 
 		 297 aa  198  7.999999999999999e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.509251  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0569  MCP methyltransferase, CheR-type  40.52 
 
 		 298 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.429442  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1143  chemotaxis protein methyltransferase CheR  39.34 
 
 		 292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0207024  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3179  chemotaxis protein methyltransferase CheR  43.54 
 
 		 314 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2984  protein-glutamate O-methyltransferase  37.32 
 
 		 285 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2124  chemotaxis protein methyltransferase CheR  40.74 
 
 		 277 aa  196  3e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3933  chemotaxis protein methyltransferase CheR  43.91 
 
 		 315 aa  196  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1988  Protein-glutamate O-methyltransferase  39.41 
 
 		 275 aa  196  3e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0073  chemotaxis protein methyltransferase  43.54 
 
 		 314 aa  195  9e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2856  chemotaxis protein methyltransferase CheR  43.54 
 
 		 314 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1687  chemotaxis protein methyltransferase CheR  43.54 
 
 		 315 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.460756  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0122  MCP methyltransferase, CheR-type  44.93 
 
 		 316 aa  194  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3119  chemotaxis protein methyltransferase CheR  43.54 
 
 		 315 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.830428  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3302  protein-glutamate O-methyltransferase  41.95 
 
 		 265 aa  194  1e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0625  MCP methyltransferase, CheR-type  39.05 
 
 		 290 aa  194  2e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>