More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3625 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_3625  MCP methyltransferase, CheR-type  100 
 
 
298 aa  612  9.999999999999999e-175  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0636111 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2710  protein-glutamate O-methyltransferase  66.19 
 
 
298 aa  377  1e-103  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1444  MCP methyltransferase, CheR-type  62.67 
 
 
300 aa  369  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0281  MCP methyltransferase, CheR-type  56.58 
 
 
292 aa  331  1e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354754  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4074  chemotaxis methyltransferase  53.77 
 
 
302 aa  318  5e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0300  MCP methyltransferase, CheR-type  52.05 
 
 
302 aa  312  4.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000961073  normal  0.256387 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0332  MCP methyltransferase, CheR-type  52.05 
 
 
302 aa  311  6.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.284961 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0237  protein-glutamate O-methyltransferase  54.04 
 
 
307 aa  310  2e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.291409 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1098  protein-glutamate O-methyltransferase  51.3 
 
 
305 aa  275  9e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2434  putative MCP methyltransferase, CheR1  51.3 
 
 
305 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3469  MCP methyltransferase, CheR-type  48.3 
 
 
280 aa  256  5e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.912759  normal  0.640591 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1796  protein-glutamate O-methyltransferase  49.09 
 
 
294 aa  251  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3204  MCP methyltransferase, CheR-type  45.22 
 
 
285 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.25041  normal  0.841939 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2839  MCP methyltransferase, CheR-type  47.92 
 
 
293 aa  240  2e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.40202  normal  0.212015 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2146  MCP methyltransferase, CheR-type  44.16 
 
 
271 aa  228  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0163  MCP methyltransferase, CheR-type  41.85 
 
 
280 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3104  MCP methyltransferase, CheR-type  40.44 
 
 
285 aa  218  1e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.575775  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0110  MCP methyltransferase, CheR-type  42.12 
 
 
288 aa  217  2e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0757  MCP methyltransferase, CheR-type  39.64 
 
 
275 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0183  protein-glutamate O-methyltransferase  41.79 
 
 
280 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3498  protein-glutamate O-methyltransferase  44.84 
 
 
273 aa  203  2e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22590  Protein-glutamate O-methyltransferase  40.39 
 
 
309 aa  199  5e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1043  MCP methyltransferase, CheR-type  45.85 
 
 
283 aa  198  7.999999999999999e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3218  MCP methyltransferase, CheR-type  45.06 
 
 
295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.108561 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1143  chemotaxis protein methyltransferase CheR  40.15 
 
 
292 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0207024  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2618  MCP methyltransferase, CheR-type  37.33 
 
 
292 aa  194  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1595  MCP methyltransferase, CheR-type  37.94 
 
 
284 aa  194  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2162  protein-glutamate O-methyltransferase  41.52 
 
 
272 aa  192  5e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0040  CheR methyltransferase, SAM binding domain protein  38.17 
 
 
283 aa  192  6e-48  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5610  MCP methyltransferase, CheR-type  40.66 
 
 
303 aa  191  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.503579  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0089  MCP methyltransferase, CheR-type  37.09 
 
 
283 aa  191  2e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0730  MCP methyltransferase, CheR-type  37.46 
 
 
300 aa  189  4e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0443063  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1988  Protein-glutamate O-methyltransferase  39.86 
 
 
275 aa  189  5e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0152  chemotaxis protein methyltransferase CheR  38.13 
 
 
276 aa  189  5.999999999999999e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1077  MCP methyltransferase, CheR-type  41.39 
 
 
300 aa  188  9e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00329536 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1932  MCP methyltransferase, CheR-type  40.94 
 
 
283 aa  188  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2984  protein-glutamate O-methyltransferase  36.43 
 
 
285 aa  187  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3691  chemotaxis regulator, protein-glutamate methyltransferase  40.66 
 
 
303 aa  186  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00198927  normal  0.0225149 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4164  MCP methyltransferase, CheR-type  37.46 
 
 
293 aa  186  5e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4052  MCP methyltransferase, CheR-type  37.46 
 
 
293 aa  186  5e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3811  MCP methyltransferase, CheR-type  39.18 
 
 
318 aa  185  7e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0645  protein-glutamate O-methyltransferase  41.67 
 
 
302 aa  185  8e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0464454  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4154  MCP methyltransferase, CheR-type  40.22 
 
 
273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1204  chemotaxis methyltransferase CheR  41.95 
 
 
288 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2078  chemotaxis methyltransferase CheR  41.95 
 
 
288 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.687941  hitchhiker  2.73756e-16 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1405  chemotaxis protein methyltransferase  37.46 
 
 
292 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.685879  normal  0.0669102 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2073  chemotaxis methyltransferase CheR  41.73 
 
 
288 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.50771  hitchhiker  0.000251677 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2622  chemotaxis methyltransferase CheR  42.69 
 
 
286 aa  182  6e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000206628 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1617  MCP methyltransferase, CheR-type  39.64 
 
 
289 aa  182  7e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0569703 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1756  MCP methyltransferase, CheR-type  42.69 
 
 
286 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0553359  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1980  chemotaxis methyltransferase CheR  42.69 
 
 
286 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2133  chemotaxis methyltransferase CheR  41.57 
 
 
288 aa  182  9.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000021864 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1327  chemotaxis methyltransferase CheR  41.57 
 
 
288 aa  182  9.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000151288 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01855  chemotaxis regulator, protein-glutamate methyltransferase  42.69 
 
 
286 aa  181  1e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.435118  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1748  chemotaxis methyltransferase CheR  42.69 
 
 
286 aa  181  1e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2105  MCP methyltransferase, CheR-type  34.8 
 
 
283 aa  181  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2177  chemotaxis methyltransferase CheR  42.69 
 
 
286 aa  181  1e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2475  MCP methyltransferase, CheR-type  39.49 
 
 
303 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0126751  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01844  hypothetical protein  42.69 
 
 
286 aa  181  1e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.370669  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1300  chemotaxis methyltransferase CheR  42.29 
 
 
286 aa  181  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000891589 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1539  protein-glutamate O-methyltransferase  36.03 
 
 
291 aa  181  2e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0159  chemotaxis protein methyltransferase CheR  39.45 
 
 
273 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2117  chemotaxis methyltransferase CheR  42.29 
 
 
286 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.396301  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1845  MCP methyltransferase, CheR-type  40.78 
 
 
289 aa  178  1e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.516279 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2420  MCP methyltransferase, CheR-type  38.58 
 
 
289 aa  177  1e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.503139  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00055  chemotaxis protein methyltransferase 2  37.5 
 
 
286 aa  178  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00310975  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1415  MCP methyltransferase, CheR-type  35.16 
 
 
281 aa  177  2e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.299383  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2571  MCP methyltransferase, CheR-type  39.49 
 
 
303 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0661  MCP methyltransferase, CheR-type  38.89 
 
 
271 aa  177  2e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2166  protein-glutamate O-methyltransferase  40 
 
 
292 aa  177  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00016475  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2021  MCP methyltransferase, CheR-type  39.93 
 
 
290 aa  176  3e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0207  CheR methyltransferase SAM-binding domain-containing protein  39.06 
 
 
270 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3062  MCP methyltransferase, CheR-type  38.91 
 
 
297 aa  177  3e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.509251  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0255  putative chemotaxis protein methyltransferase  44.2 
 
 
280 aa  176  4e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0185  MCP methyltransferase, CheR-type  38.8 
 
 
325 aa  176  4e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4376  MCP methyltransferase, CheR-type  38.31 
 
 
295 aa  176  4e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.525329  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0172  MCP methyltransferase, CheR-type  38.93 
 
 
325 aa  175  7e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.581337  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24390  protein-glutamate O-methyltransferase. chemotaxis protein  39.03 
 
 
287 aa  174  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.273905  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4310  chemotaxis methyltransferase  38.49 
 
 
293 aa  174  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2455  chemotaxis methyltransferase CheR  39.62 
 
 
288 aa  174  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2174  protein-glutamate O-methyltransferase  39.05 
 
 
296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.432884  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0808  MCP methyltransferase, CheR-type  36.76 
 
 
272 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0168  MCP methyltransferase, CheR-type  38.59 
 
 
328 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.419483 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0569  MCP methyltransferase, CheR-type  36.62 
 
 
298 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.429442  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3788  MCP methyltransferase, CheR-type  38.55 
 
 
297 aa  173  3.9999999999999995e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.236792  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3361  MCP methyltransferase, CheR-type  38.59 
 
 
327 aa  172  5e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0405517  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0122  MCP methyltransferase, CheR-type  40.65 
 
 
316 aa  172  5e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2848  MCP methyltransferase, CheR-type  38.26 
 
 
330 aa  172  5e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.242371  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0259  MCP methyltransferase, CheR-type  38.26 
 
 
330 aa  172  5e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.000294494  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0241  MCP methyltransferase, CheR-type  38.26 
 
 
325 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0215152  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1382  MCP methyltransferase, CheR-type  39.27 
 
 
303 aa  172  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3302  protein-glutamate O-methyltransferase  37.31 
 
 
265 aa  172  9e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1405  MCP methyltransferase, CheR-type  36.43 
 
 
284 aa  171  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.216379  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1610  MCP methyltransferase, CheR-type  36.06 
 
 
274 aa  171  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0466  MCP methyltransferase, CheR-type  36.16 
 
 
295 aa  170  3e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.176521 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0635  MCP methyltransferase, CheR-type  37.68 
 
 
301 aa  170  3e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4819  MCP methyltransferase, CheR-type  37.73 
 
 
282 aa  169  4e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.728077  hitchhiker  0.00962017 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3852  chemotaxis protein methyltransferase  37.71 
 
 
315 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3179  chemotaxis protein methyltransferase CheR  38.1 
 
 
314 aa  169  5e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0700  MCP methyltransferase, CheR-type  36.82 
 
 
284 aa  169  6e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.531661 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>